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An?lise filogen?tica e funcional de dois genes de reparo hom?logos a AP endonuclease em cana-de-a??car: ScARP1 e ScARP3

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Previous issue date: 2014-03-21 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / The genome of all organisms constantly suffers the influence of mutagenic factors from endogenous and/or exogenous origin, which may result in damage for the genome. In order to keep the genome integrity there are different DNA repair pathway to detect and correct these lesions. In relation to the plants as being sessile organisms, they are exposed to this damage frequently. The Base Excision DNA Repair (BER) is responsible to detect and repair oxidative lesions. Previous work in sugarcane identified two sequences that were homologous to Arabidopsis thaliana: ScARP1 ScARP3. These two sequences were homologous to AP endonuclease from BER pathway. Then, the aim of this work was to characterize these two sequence using different approaches: phylogenetic analysis, in silico protein organelle localization and by Nicotiana tabacum transgenic plants with overexpression cassette. The in silico data obtained showed a duplication of this sequence in sugarcane and Poaceae probably by a WGD event. Furthermore, in silico analysis showed a new localization in nuclei for ScARP1 protein. The data obtained with transgenic plants showed a change in development and morphology. Transgenic plants had slow development when compared to plants not transformed. Then, these results allowed us to understand better the potential role of this sequence in sugarcane and in plants in general. More work is important to be done in order to confirm the protein localization and protein characterization for ScARP1 and ScARP3 / O genoma de todos os organismos sofre constantemente a influ?ncia de fatores mutag?nicos que podem ser de origem end?gena e/ou ex?gena, estes podem resultar em danos ao material gen?tico. Se esses danos n?o forem corrigidos pode levar ao aparecimento de muta??es. As plantas por serem organismos sesseis est?o continuamente expostas a estes fatores. Considerando isto, os organismos (animais e vegetais) possuem diferentes vias de reparo de DNA para manter a integridade do material gen?tico. Dentro destas vias, h? a via de Reparo por Excis?o de Bases (BER) que ? composta por diferentes enzimas, e dentro dessa via h? a enzima AP endonuclease que ? alvo deste estudo. Trabalhos anteriores em cana-de-a??car identificaram duas sequ?ncias de cDNA hom?logas a esta prote?na que foram denominadas ScARP1 e ScARP3. Com isso, o objetivo deste trabalho foi caracterizar estas duas sequ?ncias por meio de an?lises filogen?ticas utilizando sequ?ncias presentes dentro do reino Plantae, e de an?lises estruturais dos genes de AP endonuclease por an?lise in silico e por plantas transg?nicas contendo cassetes de super-express?o. Al?m disso, foi realizado transforma??es e a obten??o plantas transg?nicas de Nicotiana tabacum contendo cassetes de super-express?o em orienta??o anti-senso. Foi tamb?m analisado a rela??o filogen?tica de genes DNA ligase I presentes no organismo vegetal de estudo. Os resultados obtidos permitiram verificar que as sequ?ncias ScARP1 e ScARP3 correspondem a uma duplica??o, provavelmente devido a um processo de duplica??o do genoma como um todo (WGD) que deve ter ocorrido no grupo das gram?neas (Poaceae). Refor?ando estes dados, foi verificado um poss?vel direcionamento da prote?na para organelas diferentes, sendo que a ScARP1 pode ser encontrada no n?cleo e a ScARP3 em mitocondrias e/ou cloroplasto. Com rela??o as plantas transg?nicas contendo o cassete em orienta??o anti-senso foi observado que estas apresentaram crescimento lento quando comparado com a planta selvagem (n?o transformada). Al?m disso, seu fen?tipo abrange altera??es morfol?gicas no crescimento foliar, baixa estatura e diminui??o na produ??o de sementes. Entretanto, ainda se faz necess?rio a obten??o da linhagem homozigota para aprofundar essas observa??es. Desta forma, estes resultados permitem compreender um pouco melhor do poss?vel papel da enzima AP endonuclease em cana-de-a??car e em plantas

Identiferoai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.ufrn.br:123456789/12627
Date21 March 2014
CreatorsMedeiros, Nathalia Maira Cabral de
ContributorsCPF:13451112825, http://lattes.cnpq.br/4808910380593455, Sluys, Marie-anne Van, CPF:80867359749, http://lattes.cnpq.br/5131787064674647, Theodoro, Raquel Cordeiro, CPF:22405839830, http://lattes.cnpq.br/0977453259767928, Scortecci, K?tia Castanho
PublisherUniversidade Federal do Rio Grande do Norte, Programa de P?s-Gradua??o em Bioqu?mica, UFRN, BR, Bioqu?mica; Biologia Molecular
Source SetsIBICT Brazilian ETDs
LanguagePortuguese
Detected LanguageEnglish
Typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis
Formatapplication/pdf
Sourcereponame:Repositório Institucional da UFRN, instname:Universidade Federal do Rio Grande do Norte, instacron:UFRN
Rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess

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