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Previous issue date: 2017-10-03 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / Sapoviruses are important agents causing acute gastroenteritis worldwide, and are most often
detected in children under five years of age. The present study aimed to evaluate the
positivity and viral load index of sapovirus in faecal samples and nasopharyngeal swab of
children, in association with the symptoms presented by these children. The study included
102 children hospitalized at the Hospital Materno Infantil, presenting symptoms of
gastroenteritis, attended between May 2014 and May 2015, with a sample of faeces and a
nasopharyngeal swab sample from each of them. Samples of faeces and nasopharyngeal
swabs from all children were submitted to extraction of the genetic material from a
commercial kit and screened for sapovirus by RT-qPCR. The viral load was determined by
constructing a standard curve from recombinant plasmid. A faecal sample and a
nasopharyngeal swab sample were obtained and 47% of the children were positive for
sapovirus in at least one of the samples collected, being 10.7% positive only in faecal samples
and 28.4% positive only in the samples of nasopharyngeal swab. Regarding viral load, a
median of 7.77 x 108 CG / mL was found for stool samples. Regarding the viral load of the
nasopharyngeal swab samples, a median 1.54 x 108 CG / mL was observed and a statistically
significant result was observed (13/14 p = 0.01), for the samples with viral load above the
median obtained in the rainy season. The median viral load of samples from positive children
in both clinical specimens was 2.33 x 108 CG / mL in the faeces and 2.67 x 108 CG / mL in
the nasopharyngeal swab. Two of these children presented a considerably higher viral load
when compared to the others. It is hoped that the data obtained may contribute to a better
understanding of the molecular epidemiology of sapoviruses, as well as to the development of
better preventive measures, in order to limit the risk of transmission of sapoviruses,
especially in a hospital environment. This is the first study to carry out the research and
detection of sapovirus in a respiratory tract sample, which could suggest a possible alternative
route of viral transmission. / Sapovírus são importantes agentes causadores de gastroenterite aguda no mundo todo,
sendo mais frequentemente detectados em crianças menores de cinco anos. O presente
estudo teve como objetivo, avaliar o índice de positividade e carga viral de sapovírus em
amostras de fezes e swab nasofaringeano de crianças, em associação com os sintomas
apresentados por essas crianças. Participaram do estudo 102 crianças hospitalizadas no
Hospital Materno Infantil, apresentando sintomas de gastroenteríte, atendidas entre o período
de maio de 2014 a maio de 2015, sendo obtidas uma amostra de fezes e uma amostra de
swab nasofaringeano de cada uma delas. As amostras de fezes e de swab nasofaringeano de
todas as crianças, foram submetidas a extração do material genético a partir de kit comerciale triadas para sapovírus por RT-qPCR. A carga viral foi determinada através da construção de
uma curva padrão, a partir de plasmídeo recombinante. Foram obtidas uma amostra de fezes
e uma de amostra de swab nasofaringeano sendo 47% das crianças foram positivas para
sapovírus em pelo menos uma das amostras coletadas, sendo 10,7% positivas apenas nas
amostras de fezes e 28,4% positivas apenas nas amostras de swab nasofaringeano. Em
relação a carga viral constatou-se uma mediana 7,77 x 10 8 CG/mL para as amostras de fezes.
Em relação a carga viral das amostras de swab nasofaringeano, foi observada uma mediana
1,54 x 10 8 CG/mL e um resultado estatisticamente significativo foi observado (13/14 p=
0,01), para as amostras com carga viral acima da mediana obtidas no período chuvoso. A
mediana da carga viral das amostras proveniente das crianças com positividade em ambos
espécimes clínicos foi de 2,33 x 10 8 CG/mL nas fezes e de 2,67 x 10 8 CG/mL nos swab
nasofaringeano. Duas dessas crianças apresentaram carga viral consideravelmente mais
elevada, quando comparada com as demais. Espera-se que os dados obtidos possam
contribuir para um melhor entendimento da epidemiologia molecular dos sapovírus, bem
como para que melhores medidas preventivas sejam desenvolvidas, a fim de limitar os riscos
de transmissão dos sapovírus, especialmente em ambiente hospitalar. Este é o primeiro
estudo a realizar a pesquisa e detecção de sapovírus em amostra do trato respiratório, o que
poderia sugerir uma possível rota alternativa de transmissão viral.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.bc.ufg.br:tede/7956 |
| Date | 03 October 2017 |
| Creators | Silva, Thairiny Neres |
| Contributors | Souza, Menira Borges de Lima Dias e, Souza, Menira Borges de Lima Dias e, Fiaccadori, Fabíola Souza, Carneiro, Megmar Aparecida dos Santos |
| Publisher | Universidade Federal de Goiás, Programa de Pós-graduação em Biologia da Relação Parasito-Hospedeiro (IPTSP), UFG, Brasil, Instituto de Patologia Tropical e Saúde Pública - IPTSP (RG) |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFG, instname:Universidade Federal de Goiás, instacron:UFG |
| Rights | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/, info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | -5087190859350688984, 600, 600, 600, 600, -7769011444564556288, -2817712778945337933, -961409807440757778 |
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