Histonų potransliacinės modifikacijos sąlygoja chromatino struktūros pakitimus, lemiančius genų, atsakingų už ląstelėje vykstančių įvairių procesų, tokių kaip proliferacija, diferenciacija, apoptozė reguliavimą. Šiame darbe įvertinome chromatino baltymų, histonų H3 ir H4, modifikacijų dinamiką HL-60 ląstelėse, indukuotose granuliocitinei diferenciacijai su retinoine rūgštimi (RA) ir histonų deacetilazių slopikliais, fenilo butiratu (PB) ir vitaminu B3 (vitB3) bei jų kombinacijomis. Aktyvaus chromatino baltymų kompleksai proliferuojančiose ir diferenciacijai indukuotose ląstelėse buvo analizuojami chromatino imunoišsodinimo metodu, naudojant antikūnus prieš histonus - hiperacetilintą H4 ir trimetil-Lys4 H3, esančius aktyvaus chromatino vietose mononukleosomų frakcijoje. Atlikta baltymų, esančių komplekse su modifikuotais histonais H3 ir H4 proteominė analizė vienmatėje (SDS/PAGE) ir dvimatėje (2DE) elektroforezės sistemose. Nustatyti baltymai, sąveikaujantys su hiperacetilintu H4 ir trimetil-Lys4 H3. Tai baltymai, dalyvaujantys genų raiškos iniciavime bei chromatino modifikacijose, t.y. transkripcijos faktorius Sp1, metionino acetiltransferazė, DNR metiltransferazė ir kt. Taip pat patodyta, kad HL-60 ląstelėse p21 WAF1/CIP geno raiška priklauso nuo pasirinkto induktoriaus. Apibendrinant manome, kad poveikio variantas - 3mM PB su 5mM vit.B3 6 val., nuplovus tolesnis poveikis su 1μM RA ir 5mM vit.B3 24 val., galėtų būti tinkamas leukeminių ląstelių diferenciacinei terapijai... [toliau žr. visą tekstą] / Recently, a novel strategy for the treatment of leukemia’s through the modulation of chromatin structure is applicable. In this study, we conducted a detailed analysis of anti-leukemia effects of histone deacetylase (HDAC) inhibitors and their combinations with retinoic acid using human promyelocytic leukemia cell line HL-60. We have shown that HDAC inhibitors - phenyl butyrate and vitamin B3, cause rapid histone H3 and H4 modifications. Further we examined how HDACI and retinoic acid (RA) can modulate gene expression via acetylation and other modifications of histones associated with targeted genes. We performed Chip assay to identify proteins associated with hyperacetylated histone H4. Immunoprecipitated proteins were fractionated by SDS/PAGE and 2DE. Proteomic analysis was performed by using mass spectrometry (MALDI TOF and ESI MS/MS). We identified Sp1 transcriptional activation, DNA methyltransferase, methionine acetyltransferase and other proteins that were associated with modified histones H3 and H4. To evaluate the changes ofp21 gene expression affected by hyperacetylation of histone H4 during HL-60 cell granulocytic differentiation we performed PGR of active chromatin immunoprecipitated with hyperacetylated H4 by using different primers of p21 gene. In this study we have shown that p21 gene expression changes during granulocytic differentiation and depends on inducer. Our results suggest that the chromatin remodeling caused by HDAC inhibitors could be a promising... [to full text]
| Identifer | oai:union.ndltd.org:LABT_ETD/oai:elaba.lt:LT-eLABa-0001:E.02~2007~D_20090908_194023-77061 |
| Date | 08 September 2009 |
| Creators | Meržvinskytė, Rasa |
| Contributors | Navakauskienė, Rūta, Vilnius University |
| Publisher | Lithuanian Academic Libraries Network (LABT), Vilnius University |
| Source Sets | Lithuanian ETD submission system |
| Language | Lithuanian |
| Detected Language | Unknown |
| Type | Master thesis |
| Format | application/pdf |
| Source | http://vddb.library.lt/obj/LT-eLABa-0001:E.02~2007~D_20090908_194023-77061 |
| Rights | Unrestricted |
Page generated in 0.0031 seconds