The 12th International St Gallen conference on breast cancer (2011) proposed patient categorization for systemic therapy, based on intrinsic breast cancer subtypes, defined by imunohistochemistry (IHC) test results. Since this classification is based on semi-quantitative expression of IHC biomarker expression, an issue of defining and applying cutoff values remains. Essential improvement in the IHC testing has become possible with digital image analysis tools enabling quantitative evaluation of the IHC data. This study explores data obtained by digital image analysis methods applied to evaluate a comprehensive biomarker dataset (p53, AR, p16, BCL2, SATB1, HIF1) along with well established (ER, PR, HER2, Ki67) biomarkers. Also, an extensive set of genetic and epigenetic biomarkers has been tested. For the first time, the dataset of 10 IHC biomarkers, evaluated by digital analysis was explored by the means of factor analysis to establish the intrinsic factors of biological variation and informative value of IHC biomarkers and their combinatiions. The results also provided insights into the significance and combinatorial effects of the established and relatively new biomarkers (p16, SATB1, HIF1, Ki67/BCL2, etc.). / XII tarptautinėje St Gallen krūties vėžio konferencijoje (2011) Ekspertų komisijos priimta nauja pacientų klasifikacija sisteminei terapijai atlikti, paremta biologiniais krūties vėžio subtipais, kurie apibrėžiami imunohistocheminiu tyrimu (IHC). Tačiau ši nauja navikų klasifikacija iš esmės pagrįsta pusiau kiekybiniu biožymenų raiškos vertinimu, todėl išlieka aktuali ribinių verčių nustatymo problematika. Esminiai pokyčiai IHC tyrimų srityje galimi atsiradus skaitmeninio vaizdinimo technologijoms, leidžiančiomis IHC tyrimų rezultatus analizuoti kiekybiniais parametrais. Darbe naudojant skaitmeninį vaizdo analizės metodą atliktas išsamus biologinių žymenų tyrimas leido palyginti svarbių, tačiau nepakankamai ištirtų (p53, AR, p16, BCL2, SATB1, HIF1) IHC žymenų informatyvumą su esamų prognozinių žymenų (ER, PR, HER2, Ki67) rodikliais. Ištirtas platus genetinių ir epigenetinių krūties vėžio žymenų spektras. Pirmą kartą 10 IHC žymenų rinkinio, įvertinto skaitmeninės analizės būdu, duomenys panaudoti faktorinės analizės metodu nustatyti jų variacijų vidinius veiksnius, atskleidžiančius biologinius dėsningumus ir IHC žymenų bei jų derinių informatyvumą. Šios analizės rezultatai leido naujai įvertinti publikuotų krūties vėžio IHC žymenų bei jų derinių (p16, SATB1, HIF1, Ki67/BCL2 ir kt.) informatyvumą.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:LABT_ETD/oai:elaba.lt:LT-eLABa-0001:E.02~2012~D_20120426_160810-22763 |
| Date | 26 April 2012 |
| Creators | Laurinavičienė, Aida |
| Contributors | Didžiapetrienė, Janina, Juozaitytė, Elona, Inčiūra, Artūras, Kirvelienė, Vida, Characiejus, Dainius, Pangonytė, Dalia, Gudlevičienė, Živilė, Jarmalaitė, Sonata, Ostapenko, Valerijus, Vilnius University |
| Publisher | Lithuanian Academic Libraries Network (LABT), Vilnius University |
| Source Sets | Lithuanian ETD submission system |
| Language | English |
| Detected Language | Unknown |
| Type | Doctoral thesis |
| Format | application/pdf |
| Source | http://vddb.laba.lt/obj/LT-eLABa-0001:E.02~2012~D_20120426_160810-22763 |
| Rights | Unrestricted |
Page generated in 0.0026 seconds