Recent advancements in machine learning and the widespread adoption of electronic healthrecords have enabled breakthroughs for several predictive modelling tasks in health care. One such task that has seen considerable improvements brought by deep neural networks is length of stay (LOS) prediction, in which research has mainly focused on adult patients in the intensive care unit. This thesis uses multivariate time series extracted from the publicly available Medical Information Mart for Intensive Care III database to explore the potential of deep learning for classifying the remaining LOS of newborns in the neonatal intensive care unit (NICU) at each hour of the stay. To investigate this, this thesis describes experiments conducted with various deep learning models, including long short-term memory cells, gated recurrentunits, fully-convolutional networks and several composite networks. This work demonstrates that modelling the remaining LOS of newborns in the NICU as a multivariate time series classification problem naturally facilitates repeated predictions over time as the stay progresses and enables advanced deep learning models to outperform a multinomial logistic regression baseline trained on hand-crafted features. Moreover, it shows the importance of the newborn’s gestational age and binary masks indicating missing values as variables for predicting the remaining LOS. / Framstegen inom maskininlärning och det utbredda införandet av elektroniska hälsoregister har möjliggjort genombrott för flera prediktiva modelleringsuppgifter inom sjukvården. En sådan uppgift som har sett betydande förbättringar förknippade med djupa neurala nätverk är förutsägelsens av vistelsetid på sjukhus, men forskningen har främst inriktats på vuxna patienter i intensivvården. Den här avhandlingen använder multivariata tidsserier extraherade från den offentligt tillgängliga databasen Medical Information Mart for Intensive Care III för att undersöka potentialen för djup inlärning att klassificera återstående vistelsetid för nyfödda i den neonatala intensivvårdsavdelningen (neonatal-IVA) vid varje timme av vistelsen. Denna avhandling beskriver experiment genomförda med olika djupinlärningsmodeller, inklusive longshort-term memory, gated recurrent units, fully-convolutional networks och flera sammansatta nätverk. Detta arbete visar att modellering av återstående vistelsetid för nyfödda i neonatal-IVA som ett multivariat tidsserieklassificeringsproblem på ett naturligt sätt underlättar upprepade förutsägelser över tid och gör det möjligt för avancerade djupa inlärningsmodeller att överträffaen multinomial logistisk regressionsbaslinje tränad på handgjorda funktioner. Dessutom visar det vikten av den nyfödda graviditetsåldern och binära masker som indikerar saknade värden som variabler för att förutsäga den återstående vistelsetiden.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:UPSALLA1/oai:DiVA.org:kth-282873 |
| Date | January 2020 |
| Creators | Straathof, Bas Theodoor |
| Publisher | KTH, Skolan för elektroteknik och datavetenskap (EECS) |
| Source Sets | DiVA Archive at Upsalla University |
| Language | English |
| Detected Language | Swedish |
| Type | Student thesis, info:eu-repo/semantics/bachelorThesis, text |
| Format | application/pdf |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | TRITA-EECS-EX ; 2020:582 |
Page generated in 0.0029 seconds