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Localização de modos vibracionais em sistemas de baixa dimensionalidade : uma aplicação ao DNA / Localization of vibrational modes in low dimensional systems : an application to DNA

Orientador: Peter Alexander Bleinroth Schulz / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Fisica Gleb Wataghin / Made available in DSpace on 2018-08-13T03:40:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2009 / Resumo: Neste trabalho estudamos a localização dos modos vibracionais de três modelos simples do DNA: cadeia unidimensional,dupla cadeia e o modelo de quatro cadeias; nestes modelos substituímos os grupos atômicos por massas efetivas ligadas entre si com molas. Para cada modelo calculamos e diagonalizamos a matriz dinâmica obtendo os modos vibracionais e suas freqüências. Cada componente de um modo vibracional representa a amplitude da oscilação nesse sitio, permitindo calcular a razão de participação e a fiutuação relativa desse modo. A partir destas grandezas se mostrou que nos sistemas quasi-unidimensionais (dupla cadeia e quatro cadeias) existe um intervalo a baixas freqüências onde todos os modos vibracionais são estendidos independentemente da seqüencia e as possíveis constantes de mola. / Abstract: ln this work we studied the localization of vibrational modes of three simple models of DNA: unidimensional chain, double chain and the model of falir chains. ln these models, atomic groups were replaced by effective fiasses linked to each other by springs. For each model, the dynamic matrix was calculated and diagonalized obtaining the vibrational modes with their frequencies. Each component of a vibrational mode represents the amplitude of the oscillation in that site, allowing the calculation of the participation fatia and the relative fluctuation of that mode. From these quantities we showed that there is a range at low frequencies in quasi-one-dimensional systems (double chain and falir chains) where alI vibrational modes are extended regardless the sequence and spring constants. / Mestrado / Física da Matéria Condensada / Mestre em Física

Identiferoai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.unicamp.br:REPOSIP/277044
Date13 August 2018
CreatorsPáez González, Carlos José, 1984-
ContributorsUNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS, Schulz, Peter Alexander Bleinroth, 1961-, Moura, Francisco Anacleto Barros Fidelis de, Koning, Maurice de
Publisher[s.n.], Universidade Estadual de Campinas. Instituto de Física Gleb Wataghin, Programa de Pós-Graduação em Física
Source SetsIBICT Brazilian ETDs
LanguagePortuguese
Detected LanguagePortuguese
Typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis
Format114 p : il., application/pdf
Sourcereponame:Repositório Institucional da Unicamp, instname:Universidade Estadual de Campinas, instacron:UNICAMP
Rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess

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