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Caracterização citogenética e molecular em acessos do gênero Arachis

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Previous issue date: 2010-02-22 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The Arachis genus has been the target of several studies due to its importance in human and animal food and because its seeds are recognized as source of protein and oil of vegetal origin, besides its use as ornamental plants. Arachis breeding programs have as main objective the introduction of new varieties and increase of genetic variability through crosses and selection to obtain important agronomic characters. Cytogenetic techniques such as conventional staining, chromosome banding with fluorochromes and FISH were used to analyze four species of Heteranthae: Arachis pusilla, A. giacomettii, A. dardani and A. sylvestris. All species had a diploid chromosome number 2n = 20, A. pusilla and A. dardani presented a karyotypic formula 18m + 2sm and satellite type 2, while A. giacomettii and A. sylvestris had 16m + 4sm and satellite type 10. Flumachromes CMA and DAPI revealed in A. pusilla a large number of blocks rich in Guanine and Cytosine, located in eight chromosomal pairs in the pericentromeric position. DAPI + blocks were observed in the proximal region in most chromosomes of the analyzed accesses of this species after the FISH technique. Arachis dardani presented two large subterranean CMA + blocks. A. giacomettii and A. dardani presented only two CMA + blocks, in the terminal region of the satelite chromosome pair. In situ hybridization demonstrated in A. giacomettii two hybridization signals in the terminal region of a chromosomal pair and in A. pusilla four 45S rDNA sites in two chromosomal pairs and two adjacent 5S rDNA sites. In A. giacomettii, two hybridization signals were visualized in the terminal region of a chromosomal pair, coinciding with the CMA + blocks, but not visualized, but 5S rDNA sites. For the molecular technique, 35 oligonucleotide primers from legume expression libraries were used, which were applied in two contrasting peanut lines, "BR1" and "LVIPE-06" accessions, commonly used in the formation of segregating populations. Objective of obtaining a panel of endonucleases recommended to generate polymorphic markers useful for the genetic improvement of peanuts or for genetic mapping purposes. From the total of oligonucleotide primers, three generated polymorphisms directly from PCR between the accesses investigated. Of the monomorphic amplicons, ten were purified, sequenced and aligned for the identification of candidate SNPs for the generation of restriction and conversion maps in molecular tags. / O gênero Arachis tem sido alvo de diversos estudos devido à sua importância na alimentação humana e animal e por suas sementes serem reconhecidas como fonte de proteína e óleo de origem vegetal, além do seu uso como plantas ornamentais. Os programas de melhoramento genético de Arachis têm por objetivo principal a introdução de novas variedades e aumento da variabilidade genética via cruzamentos e seleção para obtenção de caracteres agronômicos importantes. Técnicas citogenéticas como coloração convencional, bandeamento cromossômico com fluorocromos e FISH foram empregadas para analisar quatro espécies da seção Heteranthae: Arachis pusilla, A. giacomettii, A. dardani e A. sylvestris. Todas as espécies apresentaram número cromossômico diplóide 2n=20, A. pusilla e A. dardani apresentaram fórmula cariotípica 18m+2sm e satélite tipo 2, enquanto que A. giacomettii e A. sylvestris possuem 16m+4sm e satélite tipo 10. A coloração com fluorocromos CMA e DAPI revelou em A. pusilla um grande número de blocos ricos em Guanina e Citosina, localizados em oito pares cromossômicos na posição pericentromérica. Blocos DAPI+ foram observados na região proximal na maioria dos cromossomos dos acessos analisados dessa espécie após a técnica de FISH. Arachis dardani apresentou dois grandes blocos subterminais CMA+. A. giacomettii e A. dardani apresentaram apenas dois blocos CMA+, na região terminal do par cromossômico satelitato. A técnica de Hibridização in situ evidenciou em A. giacomettii dois sinais de hibridização na região terminal de um par cromossômico e em A. pusilla quatro sítios de DNAr 45S em dois pares cromossômicos e dois sítios de DNAr 5S adjacentes. Já em A. giacomettii foram visualizados dois sinais de hibridização na região terminal de um par cromossômico, coincidindo com os blocos CMA+, não sendo visualizados, porém sítios DNAr 5S. Para a técnica de molecular foram utilizados 35 oligonucleotídeos iniciadores, provenientes de bibliotecas de expressão de leguminosas, estes foram aplicados em duas linhagens contrastantes de amendoim, acessos „BR1‟ e „LVIPE-06‟, comumente utilizados na formação de populações segregantes, com o objetivo de obter um painel de endonucleases recomendadas para gerar marcas polimórficas úteis ao melhoramento genético de amendoim ou para fins de mapeamento genético. Do total de oligonucleotídeos iniciadores, três geraram polimorfismos diretamente da PCR entre os acessos investigados. Dos amplicons monomórficos, dez foram purificados, sequenciados e alinhados para a identificação dos SNPs candidatos a geração dos mapas de restrição e conversão em marcas moleculares.

Identiferoai:union.ndltd.org:IBICT/oai:tede2:tede2/6475
Date22 February 2010
CreatorsMARTINS, Maria Isabel Gomes
ContributorsCARVALHO, Reginaldo de, SANTOS, Roseane Cavalcanti dos, MELO FILHO, Péricles de Albuquerque, CAMARA, Terezinha de Jesus Rangel, OLIVEIRA, Maria Betânia Melo de
PublisherUniversidade Federal Rural de Pernambuco, Programa de Pós-Graduação em Melhoramento Genético de Plantas, UFRPE, Brasil, Departamento de Agronomia
Source SetsIBICT Brazilian ETDs
LanguagePortuguese
Detected LanguagePortuguese
Typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis
Formatapplication/pdf
Sourcereponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRPE, instname:Universidade Federal Rural de Pernambuco, instacron:UFRPE
Rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
Relation-6234655866848882505, 600, 600, 600, 600, -6800553879972229205, 2615607299470131967, -2555911436985713659

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