Glioblastoma (GBM) is the most common primary brain tumor in adults. This study attempted to
identify the genes potentially regulated by promoter methylation in GBM. Therefore, we analyzed
the expression of COX7A1, SPINT1, AREG, NPTX2, and KRT81 in glioblastomas and human brain
tissue and investigated if there were any associations between the expression and methylation of
these genes. Moreover, we aimed to determine the methylation frequency of 11 genes (AREG,
CASP8, CD81, DcR1, DR4, GATA4, GATA6, hMLH1, NPTX2, TES, and TFPI2) promoters in 100
patients with glioblastoma multiforme and to evaluate the associations between patients’ clinical
characteristics and prognostic value. The methylation status of the following 4 gene promoters
was significantly related to patients’ survival after surgery: AREG, CASP8, GATA6 and TFPI2.
Identification of the methylation status of these genes could be one of the objective criteria in the
prognosis of disease course in patients with glioblastoma and could supplement the list of already
known epigenetic markers. The methylation status of a combination of 6 genes (AREG, CASP8,
DR4, GATA4, GATA6, and TFPI2) was found to be a more accurate independent prognostic factor
associated with patients’ survival after surgery when compared with the methylation status of
individual genes. The molecular classification of GBM according to the methylation profile of a
combination of these 6 genes could help clinicians tailor an appropriate treatment... [to full text] / Glioblastoma (GBM) yra vienas labiausiai paplitusių ir agresyviausių pirminių galvos smegenų auglių. Siekiant nustatyti molekulinius žymenis, susijusius su GBM vystymusi, diagnoze ir prognoze, buvo atlikta 14 genų (AREG, CASP8, CD81, COX7A1, DcR1, DR4, GATA4, GATA6, hMLH1, KRT81, NPTX2, SPINT1, TES ir TFPI2) promotorių metilinimo analizė. Buvo nustatyti naviką slopinančių genų promotorių metilinimo dažniai, ryšiai su klinikinėmis sergančiųjų GBM charakteristikomis ir prognozinė vertė. Disertacinio darbo metu nustatyta, kad AREG ir NTPX2 genų raiška susijusi su šių genų promotorių metilinimu, tuo tarpu COX7A1, KRT81 ir SPINT1 genų raiškos skirtumai nėra susiję su šių genų promotorių metilinimu. Naujų epigenetinių žymenų tyrimai 100 GBM pavyzdžių parodė navikų epigenetinį heterogeniškumą ir įvairų tirtų genų promotorių metilinimo dažnį. Nustatyta, kad AREG, CASP8, GATA6 ir TFPI2 genų promotorių metilinimas statistiškai patikimai susijęs su išgyvenimo trukme po operacijos. Šių genų promotoriaus metilinimo nustatymas gali būti vienas iš objektyvių kriterijų prognozuojant pacientų ligos eigą ir papildyti jau nustatytų epigenetinių žymenų sąrašą. Buvo sudarytas, suminis šešių genų (AREG, CASP8, DR4, GATA4, GATA6 ir TFPI2) derinys, kuris yra tikslesnis nepriklausomas prognozinis veiksnys, susijęs su išgyvenimo trukme po operacijos lyginant su atskirų genų promotorių metilinimu. GBM molekulinis tipavimas pagal šių šešių genų derinį galėtų padėti parenkant gydymo strategiją.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:LABT_ETD/oai:elaba.lt:LT-eLABa-0001:E.02~2013~D_20130419_111627-63926 |
| Date | 19 April 2013 |
| Creators | Vaitkienė Grigaitė, Paulina |
| Contributors | Pauža, prof. dr. Dainius H., Tamašauskas, prof. habil. dr. Arimantas, Kupčinskas, prof. habil. dr. Limas, Lesauskaitė, prof. habil. dr. Vaiva, Gulbinas, prof. dr. Antanas, Šatkauskas, prof. dr. Saulius, Pivoriūnas, dr. Augustas, Borutaitė, prof. dr. Vilmantė, Jarmalaitė, prof. habil. dr. Sonata, Lithuanian University of Health Sciences |
| Publisher | Lithuanian Academic Libraries Network (LABT), Lithuanian University of Health Sciences |
| Source Sets | Lithuanian ETD submission system |
| Language | English |
| Detected Language | Unknown |
| Type | Doctoral thesis |
| Format | application/pdf |
| Source | http://vddb.laba.lt/obj/LT-eLABa-0001:E.02~2013~D_20130419_111627-63926 |
| Rights | Unrestricted |
Page generated in 0.0025 seconds