Orientador: Patricia Pintor dos Reis / Resumo: Introdução: O tumor carcinoide do pulmão pertence ao tipo neuroendócrino das neoplasias pulmonares. Devido à sua baixa incidência (~2%), pouco se conhece sobre suas alterações moleculares. Os microRNAs (miRNAs) têm importante papel na regulação gênica e têm sido associados ao câncer como biomarcadores diagnósticos, prognósticos e preditivos. Objetivos: Determinar o perfil global de expressão de miRNAs em tumores carcinoides do pulmão e identificar (in silico) vias moleculares envolvendo os miRNAs desregulados e genes-alvo preditos. Material e Métodos: Dois fragmentos de um tumor carcinoide típico e sua metástase correspondente foram obtidos, o RNA extraído de cada amostra e analisado na plataforma TaqMan Low Density Array (TLDA), a qual contém sondas para 384 miRNAs. Os dados foram analisados no Expression Suite software. Adicionalmente, 7 tumores (5 carcinoides típicos e 2 atípicos) foram utilizados para análise de expressão de 2,578 miRNAs na plataforma GeneChip™ miRNA 4.0 e os dados analisados utilizando o Transcriptome Analysis Console software. A análise estatística dos dados foi realizada para identificação dos miRNAs significativamente (p<0,05) alterados. Métodos de análise in silico incluíram a identificação de mRNAs-alvo dos miRNAs e vias moleculares de tumorigênese. Resultados e Discussão: No tumor carcinoide típico e metástase (TLDA), 15 miRNAs estavam com expressão comumente diminuída, os quais regulam genes associados a vias de resposta imune adaptativa. Adiciona... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Introduction: Lung carcinoid tumors are a type of neuroendocrine lung neoplasia. Due to its low incidence (~2%), little is known about the molecular alterations associated with these tumors. microRNAs (miRNAs) have an important role in gene regulation and have been associated with cancer as diagnostic, prognostic and predictive biomarkers. Objectives: To determine the global expression miRNA profiles of lung carcinoid tumors and to identify (in silico) molecular pathways including deregulated miRNAs and predicted target-genes. Material and Methods: Two fragments of a typical carcinoid tumor and its corresponding metastasis were obtained, the RNA extracted and analyzed using the TaqMan Low Density Array (TLDA) platform containing 384 miRNAs. Data were analyzed using Expression Suite software. Additionally, 7 tumors (5 typical and 2 atypical carcinoids) were used for expression analysis of 2,578 miRNAs in the GeneChip™ miRNA 4.0 platform and data were analyzed using the Transcriptome Analysis Console software. Statistical analysis was performed to identify the significantly (p<0,05) deregulated miRNAs. In silico analyses methods included the identification of miRNA target genes (and enriched pathways. Results and Discussion: In the typical carcinoid tumor and metastasis (TLDA data), 15 miRNAs were commonly down-regulated and these modulate genes associated with the adaptive immune system pathway. Additionally, the comparison of typical carcinoids or atypical vs. normal (GeneChi... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
| Identifer | oai:union.ndltd.org:UNESP/oai:www.athena.biblioteca.unesp.br:UEP01-000913249 |
| Date | January 2019 |
| Creators | Seneda, Ana Laura |
| Contributors | Universidade Estadual Paulista "Júlio de Mesquita Filho" Faculdade de Medicina. |
| Publisher | Botucatu, |
| Source Sets | Universidade Estadual Paulista |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | computer file |
| Relation | Sistema requerido: Adobe Acrobat Reader |
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