Conselho Nacional de Desenvolvimento CientÃfico e TecnolÃgico / Four genotypes of human coronavirus (CoVh-229E, OC43, NL63 and HKU1) are often associated with diseases of the upper respiratory tract as well as in the lower.Despite the diversity of human coronavirus associated with acute respiratory infections, little is known about the impact of infections associated with them in child populations living in tropical regions.The present study had as objective detect CoVh in nasopharyngeal samples from pediatric patients with pneumonia treated at emergency rooms and wards of a referral hospital in the city of Fortaleza - CearÃ, during the years 2011 and 2012.To that end, we collected 522 nasopharyngeal aspirates, where the principle indirect immunofluorescence (IIF) was used for detection of influenza A and B viruses, respiratory syncytial virus, adenovirus and parainfluenza 1, 2 and 3, and 99 (19%) samples positive by this technique. Negative samples by IFA were subjected to polymerase chain reaction in real-time (RT-qPCR) for detection of CoVh. Of the 423 negative samples by IFA, 71 (16.80%) had a positive result for CoVh, where the type 229E was the most frequent (34.11%), followed by genotypes OC43 and NL63 with 28.23% each and with lower detection HKU1 genotype (9.4%).We observed 14 (19.71%) co-detections with at most two genotypes among CoVh.All types of CoVh were observed during the study period.A rate of 67.60% of the infected children was treated by CoVh in emergency, but it is worth mentioning the high detection rate in hospitalized patients (32.40%).HKU1 genotype identified in a child with one month old who died, where the only risk factor was age observed.Our results show the circulation four types of CoVh in our city,being detected in pediatric patients with pneumonia, demonstrating the potential importance of these viruses in severe respiratory syndromes. / Quatro genÃtipos de coronavÃrus humanos (CoVh-229E, OC43, NL63 e HKU1) sÃo frequentemente associados a doenÃas no trato respiratÃrio superior como tambÃm no inferior. Apesar da diversidade de coronavÃrus associados a infecÃÃes respiratÃrias agudas humanas pouco se conhece sobre o impacto das infecÃÃes a eles associadas em populaÃÃes infantis que vivem em regiÃes tropicais. O presente estudo teve como objetivo detectar os CoVh em amostras de nasofaringe provenientes de pacientes pediÃtricos com pneumonia atendidos na emergÃncia e nas enfermarias de um hospital de referÃnciana cidade de Fortaleza â CearÃ, durante os anos de 2011 e 2012. Para tanto, foram coletadas 522 aspirados de nasofaringe, onde a princÃpio foi utilizada a tÃcnica de imunofluorescÃncia indireta (IFI) para detecÃÃo dos vÃrus influenza A e B, sincicial respiratÃrio (VSRh), adenovÃrus (ADVh), e parainfluenza 1, 2 e 3 (VPIh 1, 2 e 3), sendo 99 (19%) amostras positivas por esta tÃcnica. As amostras negativas por IFI foram submetidas à reaÃÃo em cadeia da polimerase em tempo real (RT-qPCR) para detecÃÃo dos CoVh. Das 423 amostras negativas por IFI, 71 (16,80%) tiveram o resultado positivo para os CoVh, onde o tipo 229E foi o mais frequente (34,11%), seguidos pelos tipos OC43 e NL63 com 28,23% cada e como menor detecÃÃo o HKU1 (9,4%). Todos os tipos de CoVh puderam ser observados durante o perÃodo de estudo. Uma taxa de 67,60% das crianÃas infectadas pelos CoVh foram atendidas na emergÃncia, mas vale ressaltar a alta taxa de detecÃÃo em pacientes hospitalizados (32,40%). Quanto aos sinais e sintomas clÃnicos, observamos uma maior frequÃncia de coriza, tosse, febre e dispnÃia nos pacientes positivos para os CoVh. Identificamos o tipo HKU1 em uma crianÃa com um mÃs de idade que foi a Ãbito, onde o Ãnico fator de risco observado foi a idade. Nossos resultados demonstram a circulaÃÃo de quatro tipos de CoVh no Nordeste do Brasil, sendo detectados em pacientes pediÃtricos com pneumonia, mostrando a possÃvel importÃncia desses vÃrus em sÃndromes respiratÃrias mais graves. Este estudo representa a primeira anÃlise sobre a epidemiologia dos CoVh em nosso estado.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:www.teses.ufc.br:10700 |
| Date | 15 July 2016 |
| Creators | Francisco MÃrio Sidney Oliveira |
| Contributors | Fernanda Edna AraÃjo Moura, SÃnia Mara Raboni, Luiz Gustavo Bentim Goes |
| Publisher | Universidade Federal do CearÃ, Programa de PÃs-GraduaÃÃo em Microbiologia MÃdica, UFC, BR |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | English |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFC, instname:Universidade Federal do Ceará, instacron:UFC |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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