Made available in DSpace on 2014-06-12T18:03:18Z (GMT). No. of bitstreams: 2
arquivo3696_1.pdf: 651388 bytes, checksum: 142f3b2132eee234fbd7d5a6590a0ccc (MD5)
license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5)
Previous issue date: 2008 / Bancos de dados de seqüências expressas representam uma fonte potencialmente valorosa
para o desenvolvimento de marcadores moleculares. Neste trabalho, estudos foram realizados
para o desenvolvimento de marcadores para aplicação no melhoramento de feijão-caupi,
feijão-comum e soja. Foram analisadas 10.880 ESTs de feijão-comum e 116.965 ESTs de
soja. Um total de 331 e 4553 SSRs foram identificados nas seqüências de feijão-comum e
soja, respectivamente. Trinucleotídeos (45,62 %) foram as mais abundantes em feijãocomum,
enquanto que os dinucletídeos (49,67 %), em soja. A densidade média variou de um
SSR a cada 22 Kb (feijão-comum) a um SSR a cada 14,68 Kb (soja). Repetições diméricas
AG/GA / TC/CT e triméricas AAG/AGA/GAA / TTC/TCT/CTT foram as mais abundantes
em ambas espécies. Um total de 153 e 1928 pares de primers EST-SSRs foram propostos para
feijão-comum e para soja, respectivamente. Desses, sinteizaram-se 20 para soja, dos quais
apenas nove amplificaram (sendo quatro de tamanho esperado e, desses, dois polimórficos) e
dois foram transferíveis. Para feijão-comum sintetizaram-se 22, dos quais 15 amplificaram,
sendo que 11 apresentaram tamanho esperado e 10 desses foram polimórficos (PIC médio de
0,50); 11 dos funcionais foram transferidos para feijão-caupi, sendo oito de tamanho esperado
e cinco desses, polimórficos (PIC médio de 0,36). Análises detalhadas dos amplicons
seqüenciados determinaram que as extensões dos motivos de SSRs foram variáveis e que as
regiões flanqueadoras dessas repetições foram geralmente bem conservadas, confirmando o
sucesso da transferibilidade entre feijão-comum e feijão-caupi
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.ufpe.br:123456789/6258 |
| Date | 31 January 2008 |
| Creators | Ferreira Neto, José Ribamar Costa |
| Contributors | Kido, Éderson Akio |
| Publisher | Universidade Federal de Pernambuco |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Source | reponame:Repositório Institucional da UFPE, instname:Universidade Federal de Pernambuco, instacron:UFPE |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
Page generated in 0.0092 seconds