La génomique nutritionnelle est une jeune science qui s'intéresse à l'étude de l'effet d'aliments et de composés alimentaires sur l'expression des gènes ainsi qu'à l'effet des variations génétiques sur la réponse métabolique à l'alimentation. Depuis son émergence au début des années 2000, de nombreuses interactions gène-diète ont été rapportées dans la littérature scientifique, toutefois ce n'est que récemment que des avancées en génomique ont permis de lever le voile sur leur potentiel pour prédire la réponse métabolique à une intervention nutritionnelle. Ces technologies pourraient permettre d'améliorer les interventions nutritionnelles à l'échelle individuelle et populationnelle en aidant à stratifier les recommandations de santé publique et en outillant les cliniciens. Cependant, bien que des compagnies aient déjà commencé à commercialiser des tests de nutrigénomique prédisant la réponse d'un individu à des nutriments, la génomique nutritionnelle demeure peu utilisée en clinique comparativement aux domaines de la médecine et de la pharmacologie, où la génomique est plus fréquemment utilisée pour prédire des résultats cliniques ou la réponse aux traitements. À ce jour, aucune étude en nutrition n'a investigué en profondeur les associations documentées afin de les traduire en outils concrètement utilisables par les professionnels de la santé. L'objectif général de ce doctorat était donc d'établir une preuve de concept montrant l'applicabilité de la génomique au domaine de la nutrition en se servant de la variabilité de la réponse des triglycérides (TG) à une supplémentation en acides gras (AG) oméga-3 (n-3) pour identifier les facteurs génétiques causatifs et construire des outils de prédiction utilisables en milieu clinique. Pour ce faire, un raffinement de la cartographie de loci identifiés par étude d'association à l'échelle du génome a été réalisé afin de construire un score du risque génétique pouvant prédire la réponse des TG plasmatiques suite à une supplémentation en AG n-3 d'origine marine. Les résultats de ce doctorat ont montré que le modèle du risque génétique était hautement prédictif de la réponse des TG et que cette capacité de prédiction demeurait robuste à travers différentes populations. Ils ont aussi montré que des études de génomique fonctionnelle pouvaient s'ajouter aux analyses génomiques afin d'en bonifier le potentiel prédictif. Ce projet de doctorat fournit une preuve de concept solide de l'applicabilité des technologies de génomique au domaine de la nutrition. / Nutritional genomics addresses the effect of foods and food compounds on gene expression as well as the effect of genetic variations on the metabolic response to food. Since its emergence in the early 2000s, numerous gene-diet interactions have been reported in the scientific literature, however it is only recently that advances in genomics have unveiled their potential to predict the metabolic response to nutritional intervention. These technologies could improve nutritional interventions at the individual and population level by stratifying public health recommendations and educating clinicians. However, although companies have already begun to commercialize nutrigenomic tests predicting the response of an individual to nutrients, nutritional genomics remains unused in the clinical setting as compared as in the fields of medicine and pharmacology, where genomics is more frequently used to predict clinical outcomes and response to treatments. To date, no studies have conducted in-depth investigations of the documented associations in order to translate them into tools that can be used by health professionals. The overall objective of this doctoral project was therefore to design a proof of concept showing the applicability of genomics to the field of nutrition by using the variability of TG response to n-3 fatty acid (FA) supplementation to identify causative genetic factors and build predictive tools that can be used in clinical settings. To this end, a refinement of the mapping of loci identified by genome-wide association study was carried out in order to construct a genetic risk score to predict the plasma TG response following an omega-3 fatty acid supplementation from marine source. The results of this project showed that the genetic risk model was highly predictive of the TG response and its predictive ability remained robust through different populations. They also showed that functional genomic studies could be added to genomic analyses to improve their predictive potential. This project provides a strong proof of concept of the applicability of genomics technologies to the field of nutrition.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:LAVAL/oai:corpus.ulaval.ca:20.500.11794/70379 |
| Date | 10 February 2024 |
| Creators | Vallée-Marcotte, Bastien |
| Contributors | Vohl, Marie-Claude |
| Source Sets | Université Laval |
| Language | French |
| Detected Language | French |
| Type | thèse de doctorat, COAR1_1::Texte::Thèse::Thèse de doctorat |
| Format | 1 ressource en ligne (xxiv, 284 pages), application/pdf |
| Rights | http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
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