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Previous issue date: 2016-05-02 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / This dissertation is divided into three chapters. In the first chapter, we provide a concise
literature review that discusses key theoretical concepts, the rationale, and main objectives
outlined for this study. The second chapter investigates the molecular evolution of the gene
family of odor receptors (ORs) identified in the transcriptomes of two species of fruit flies of
great economic importance: Anastrepha fraterculus and A. obliqua. The results showed a high
percentage of average identities between ORs from these species, as well as recent gene
expansions with signs of positive selection. A comparison of rates of synonymous and nonsynonymous
substitutions among Anastrepha species detected evidence of positive selection
in the gene Or7c, which is associated to an important potential role in aggregation behavior
and host choice for oviposition in D. melanogaster. The third chapter investigates patterns of
molecular evolution in pheromone binding proteins (PBPs), also identified in A. fraterculus
and A. obliqua, as well as studied pattern of polymorphisms, divergence and populational
structure of four chemosensory genes amplified in four species of tephritid flies of fraterculus
group: A. fraterculus, A. obliqua, A. sororcula and A. turpiniae. This study contrasted
previously identified genes with evidence of positive and purifying selection in order to
investigate whether they are contributing to the differentiation among some of the species of
this group. We found no evidence of positive selection in PBPs studied in a more global
comparison, although we found positive selection signals in some of the genes and studied
strains. Population analysis of chemosensory genes in different species of Anastrepha
detected high levels of intraspecific nucleotide and haplotype diversity. Divergence tests
showed that A. obliqua is the most different species of the ones here investigated, having, in
general, high levels of nucleotide substitutions, non-synonymous divergence, as well as fixed
species specific differences, whereas we failed to find similar differences amongst the other
species here studied. The genes Obp28a, Or7c and Or7d were differentiated in A. obliqua,
indicating a potential role in the differentiation of other species in the group, or in this
species’ diversification and adaptation. / A presente dissertação encontra-se dividida em três capítulos. O primeiro capítulo apresenta
uma concisa revisão bibliográfica que aborda os principais conceitos teóricos, a justificativa e
os objetivos delineados para este estudo. O segundo capítulo apresenta um estudo da evolução
molecular da família gênica dos receptores de odores (ORs) identificados nos transcriptomas
de duas espécies de moscas-das-frutas de grande importância econômica: Anastrepha
fraterculus e A.obliqua. Os resultados mostraram uma alta porcentagem de identidade média
entre os ORs destas espécies, assim como expansões gênicas recentes com sinal de seleção
positiva. Quando comparamos as taxas de substituições sinônimas e não-sinônimas entre as
espécies de Anastrepha encontramos evidências de seleção positiva no gene Or7c, que está
associado em D. melanogaster a um potencial importante papel nos comportamentos de
agregação e escolha de frutos para oviposição. No terceiro capítulo apresentamos um estudo
do padrão de evolução molecular dos genes que codificam para proteínas ligantes aos
feromônios (PBPs), também identificados em A. fraterculus e A. obliqua, assim como
também estudamos o padrão de polimorfismos, divergência e estrutura dos genes
quimiossensoriais Obp28a, Obp84a, Or7c e Or7d os quais foram amplificados em quatro
espécies de moscas-das-frutas do grupo fraterculus, A. fraterculus, A. obliqua, A. sororcula e
A. turpiniae. Este estudo foi realizado contrastando genes identificados com sinais de seleção
positiva e seleção purificadora com o intuito de investigar se eles estão contribuindo para a
diferenciação entre algumas das espécies desse grupo. Não encontramos evidências de seleção
positiva nas PBPs estudadas em uma comparação mais global, embora tenhamos encontrado
sinais de seleção positiva em alguns dos genes e linhagens estudadas. A análise populacional
de genes quimiossensoriais em diferentes espécies de Anastrepha detectou níveis altos de
diversidade nucleotídica e haplotípica dentro das espécies. Os testes de divergência
mostraram que a espécie A. obliqua é a espécie mais diferenciada, apresentando, em geral,
altos níveis de substituições nucleotídicas, divergência não-sinônima, assim como diferenças
fixadas quando comparada com as outras espécies. Os genes Obp28a, Or7c e Or7d
mostraram-se diferenciados em A. obliqua, indicando um potencial papel na diferenciação
desta espécie com respeito às outras espécies estudadas.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.ufscar.br:ufscar/8773 |
| Date | 02 May 2016 |
| Creators | Rojas Gallardo, Diana Marcela |
| Contributors | Brito, Reinaldo Otávio Alvarenga Alves de |
| Publisher | Universidade Federal de São Carlos, Câmpus São Carlos, Programa de Pós-graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular, UFSCar |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Source | reponame:Repositório Institucional da UFSCAR, instname:Universidade Federal de São Carlos, instacron:UFSCAR |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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