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Alinhamento de seqüências biológicas em arquiteturas com memória distribuída

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Previous issue date: 4 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A utilização de aglomerados de computadores na solução de problemas que demandam grande quantidade de recursos computacionais vem se mostrando uma alternativa interessante. aglomerados são economicamente viáveis e de fácil manutenção, oferecendo poder computacional equivalente ao de supercomputadores. No entanto,

o desenvolvimento de aplicações para este tipo de arquitetura é complexo, uma vez que envolve questões não presentes na programação seqüencial, como a comunicação de dados e a sincronização de tarefas concorrentes, problemas estes que, em geral, são tratados em supercomputadores por pacotes de software especializados. Neste contexto, este trabalho apresenta o desenvolvimento de um mecanismo de suporte à comunicação sobre aglomerados de computadores, focado na exploração desta plataforma de hardware para o processamento de alto desempenho. O mecanismo criado e disponibilizado sob a forma de uma biblioteca de funções em C, é baseado no modelo de Mensagens

Ativas. Sua implementação é realizada na cama / The use of cluster of computers for solving problems that require a great quantity

of computational resources is becoming an interesting alternative. Clusters are economically

feasible and of easy maintenance, offering a computational power equivalent to that

of supercomputers. However developing applications for this kind of architecture is complex because it involves issues that are not present in the sequential programming such

as data communication and concurrent tasks synchronization, problems that usually are

handled by specialized software packages in supercomputers. Considering this context,

this work presents the development of a mechanism for supporting communication on clusters of computers focused on exploring this hardware platform for high performance processing. The mechanism was created as a library of functions written in C and it is based on the Active Messages model. Its implementation was performed on the applicative level, using light multiprogramming techniques as programming resou

Identiferoai:union.ndltd.org:IBICT/oai:www.repositorio.jesuita.org.br:UNISINOS/2203
Date04 March 2005
CreatorsPeranconi, Daniela Saccol
ContributorsCavalheiro, Gerson Geraldo Homrich
PublisherUniversidade do Vale do Rio do Sinos, Programa de Pós-Graduação em Computação Aplicada, UNISINOS, Brasil, Escola Politécnica
Source SetsIBICT Brazilian ETDs
LanguagePortuguese
Detected LanguagePortuguese
Typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis
Sourcereponame:Repositório Institucional da UNISINOS, instname:Universidade do Vale do Rio dos Sinos, instacron:UNISINOS
Rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess

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