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Uma estratégia para garantir coerência de cache e percepção em sistemas cooperativos com apoio à mobilidade.

Carla Diacui Medeiros Berkenbrock 10 September 2009 (has links)
Os avanços da computação móvel em adição às novas formas de conectividade permitem a integração de dispositivos móveis em aplicações cooperativas. Entretanto, a maior parte das aplicações cooperativas síncronas correntes considera ambientes fortemente acoplados, onde a desconexão dos dispositivos móveis em geral não é considerada. Existem estratégias eficientes para manter a coerência dos dados e fornecer um desempenho razoável em aplicações para dispositivos móveis em ambientes fracamente acoplados. No entanto, essas estratégias não consideram as necessidades de processamento e comunicação de sistemas cooperativos síncronos. Neste trabalho é definida a estratégia Cache Coherence Scheme for Mobile Cooperative Work (CCS-MoCW). Essa estratégia é baseada na disseminação de notificações de alteração, mescla características das abordagens stateful e stateless, interações síncronas e assíncronas, bloqueios, e disponibiliza aspectos de percepção. A avaliação da estratégia CCS-MoCW foi conduzida por meio de experimentos controlados. Esses experimentos envolvem o desenvolvimento de um protótipo e elaboração de um estudo de caso. Os resultados dos experimentos mostram que a estratégia apresenta-se como solução para garantir a coerência de cache, o controle de concorrência e permitir a apresentação de aspectos de percepção em um ambiente cooperativo com apoio à mobilidade dos usuários.
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Alinhamento de seqüências biológicas em arquiteturas com memória distribuída

Peranconi, Daniela Saccol 04 March 2005 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-05T13:53:44Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 4 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A utilização de aglomerados de computadores na solução de problemas que demandam grande quantidade de recursos computacionais vem se mostrando uma alternativa interessante. aglomerados são economicamente viáveis e de fácil manutenção, oferecendo poder computacional equivalente ao de supercomputadores. No entanto, o desenvolvimento de aplicações para este tipo de arquitetura é complexo, uma vez que envolve questões não presentes na programação seqüencial, como a comunicação de dados e a sincronização de tarefas concorrentes, problemas estes que, em geral, são tratados em supercomputadores por pacotes de software especializados. Neste contexto, este trabalho apresenta o desenvolvimento de um mecanismo de suporte à comunicação sobre aglomerados de computadores, focado na exploração desta plataforma de hardware para o processamento de alto desempenho. O mecanismo criado e disponibilizado sob a forma de uma biblioteca de funções em C, é baseado no modelo de Mensagens Ativas. Sua implementação é realizada na cama / The use of cluster of computers for solving problems that require a great quantity of computational resources is becoming an interesting alternative. Clusters are economically feasible and of easy maintenance, offering a computational power equivalent to that of supercomputers. However developing applications for this kind of architecture is complex because it involves issues that are not present in the sequential programming such as data communication and concurrent tasks synchronization, problems that usually are handled by specialized software packages in supercomputers. Considering this context, this work presents the development of a mechanism for supporting communication on clusters of computers focused on exploring this hardware platform for high performance processing. The mechanism was created as a library of functions written in C and it is based on the Active Messages model. Its implementation was performed on the applicative level, using light multiprogramming techniques as programming resou
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Implementação paralela em um ambiente de múltiplas GPUs de um modelo 3D do sistema imune inato

Xavier, Micael Peters 26 August 2013 (has links)
Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2017-02-24T13:29:14Z No. of bitstreams: 1 micaelpetersxavier.pdf: 17481766 bytes, checksum: fb76bff140085a73dc148ca7493df8b3 (MD5) / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2017-02-24T15:36:12Z (GMT) No. of bitstreams: 1 micaelpetersxavier.pdf: 17481766 bytes, checksum: fb76bff140085a73dc148ca7493df8b3 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-24T15:36:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 micaelpetersxavier.pdf: 17481766 bytes, checksum: fb76bff140085a73dc148ca7493df8b3 (MD5) Previous issue date: 2013-08-26 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O desenvolvimento de sistemas computacionais que simulam o funcionamento de tecidos ou mesmo de órgãos completos é uma tarefa extremamente complexa. Um dos muitos obstáculos relacionados ao desenvolvimento de tais sistemas é o enorme poder computacional necessário para a execução das simulações. Por essa razão, o uso de estratégias e métodos que empregam computação paralela são essenciais. Este trabalho foca na simulação temporal e espacial, em uma seção tridimensional de tecido, do comportamento de algumas das células e moléculas que constituem o sistema imunológico humano (SIH) inato. Com o objetivo de reduzir o tempo necessário para realizar a simulação, foram utilizadas múltiplas unidades de processamento gráfico (Graphics Processing Unit, GPUs) em um ambiente de agregados computacionais. Apesar do alto custo de comunicação imposto pelo uso de múltiplas GPUs, as abordagens e técnicas utilizadas neste trabalho para implementar as versões paralelas do simulador mostraram-se efetivas para alcançar o objetivo de redução do tempo de simulação. / The development of computer systems that simulate the behavior of tissues or even whole organs is an extremely complex task. One of the many obstacles related to the development of such systems is the huge computational resources needed to execute the simulations. For this reason, the use of strategies and methods that employ parallel computing are essential. This work focuses on the spatial-temporal simulation of some human innate immune system (HIS) cells and molecules in a three-dimensional section of tissue. Aiming to reduce the time required to perform the simulation, multiple graphics processing units (GPUs) were used in a cluster environment. Despite of high communication cost imposed by the use of multiple GPUs, the approaches and techniques used in this work to implement parallel versions of the simulator proved to be very effective in their purpose of reducing the simulation time.

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