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Previous issue date: 2008-04-23 / Universidade Federal de Sao Carlos / Genetic studies have been performed for an endemic species from São Francisco River
basin, Prochilodus argenteus, which has a great importance in the artisanal and subsistence
fishing in the region. The linkage mapping and the genetic variability studies were made with
AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) dominants markers and with 189
specimens from a F1 cross, that was also used for restocking the upstream area from Três
Marias hydroelectric dam. All the analyses were carried out with 15 primer pairs
combinations and the linkage map was made using the pseudo-testcross mapping strategy.
Forty six heterozygous marks were found for the genitors, with mendelian segregation of 1:1.
The female genitor map had 3 linkage groups and the lenght of the analysed genome was
128,45 cM, the male genitor map had the same number of linkage groups and the total length
of 192,67 cM. Common markers for both genitors, with mendelian segregation ratio of 3:1,
served as bridge between the maps, for the construction of an integrated map. This map had 9
linkage groups, and the total map length was 442,08 cM. Additionally, the genetic variability
was assessed and an expected heterozygosity mean was of 0,32082, with a Jaccard s
similarity coefficient of 0,72564 + 0,00451. These preliminary values show that the cultured
sample has a higher similarity coefficient than that obtained for the wild populations. Hence,
the present results suggest that genetic studies and management restocking practices should be
simultaneously performed for the maintenance of the genetic patrimony of this species at the
São Francisco River basin. The results also showed that AFLP marks were suitable and
effective to identify linkage marks in Prochilodus argenteus and for genetic variability studies
in cultivar samples. / Estudos genéticos foram realizados em uma espécie endêmica da bacia do rio São
Francisco, Prochilodus argenteus, a qual possui grande importância na pesca artesanal e de
subsistência da região. Os estudos do mapa de ligação e de variabilidade genética foram
realizados com o uso do marcador dominante AFLP (Polimorfismo de Comprimento de
Fragmentos Amplificados) e com 189 indivíduos de um cruzamento F1, utilizado também
para o repovoamento do rio São Francisco, à montante da barragem de Três Marias (MG).
Todas as análises foram realizadas com 15 combinações de primers. Para a construção dos
mapas de ligação foi utilizada a abordagem pseudocruzamento teste. Os primers utilizados
geraram 46 marcas heterozigóticas para os genitores, com segregação mendeliana de 1:1. O
mapa referente ao genitor feminino apresentou 3 grupos de ligação e o comprimento do
genoma analisado foi de 128,45 cM, e o mapa do genitor masculino também consistiu em 3
grupos de ligação com comprimento total de 192,67 cM. Marcadores comuns aos dois
genitores, com segregação mendeliana de 3:1, foram utilizados como pontes na integração dos
mapas. O mapa integrado foi formado por 9 grupos de ligação, o que correspondeu a 442,08
cM de genoma analisado. Adicionalmente, a variabilidade genética foi estudada por meio da
média da heterozigosidade esperada (He), a qual foi de 0,32082 e pela análise do coeficiente
de similaridade de Jaccard, que foi igual a 0,72564 + 0,00451. Estes valores, ainda que
preliminares, mostraram que essa amostragem cultivada possui o coeficiente de similaridade
maior quando comparado com os de populações selvagens. Desta forma, sugere-se no
presente trabalho que estudos genéticos devam ser realizados juntamente com a prática de
repovoamento de rios, visando conservar o patrimônio genético desta espécie na bacia do São
Francisco. Os resultados mostraram também que os marcadores AFLP foram adequados e
eficientes para a identificação de marcas ligadas em Prochilodus argenteus e no estudo da
variabilidade genética de amostras cultivadas.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.ufscar.br:ufscar/5448 |
| Date | 23 April 2008 |
| Creators | Rojas, Thaís Cabrera Galvão |
| Contributors | Hatanaka, Terumi |
| Publisher | Universidade Federal de São Carlos, Programa de Pós-graduação em Genética Evolutiva e Biologia Molecular, UFSCar, BR |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Repositório Institucional da UFSCAR, instname:Universidade Federal de São Carlos, instacron:UFSCAR |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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