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Previous issue date: 2015-11-30 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / Bioremediation is the use of microorganisms capable of metabolizing contaminants and
converts them into less toxic products. In previous studies, we performed bacteria isolation
from contaminated area for oil waste in Amazon. Despite its oil degradation potential, the
application of bacteria in contaminated sites may interfere with their ecological balance. This
study aimed to promote studies of gene characterization and hydrocarbon degradation
potential with a selected bacterial strain and identify and define the proteins involved in
degradation process. To achieve this objectives degraded substances have been identified by
gas chromatography and proteins involved by proteomics; Genome analysis allowed
characterization of genes related to xenobiotics degradation. The strain was identified as
Pseudomonas putida S16. 51 substances were detected by gas chromatography, of these, 23
were completely degraded, including PAH containing naphthalene (100%), anthracene
(11.49%) and phenanthrene (7.41%). We identified 89 genes related to xenobiotic degradation
in P. putida S16 AM genome, genes capable of degrading naphthalene, anthracene and
phenanthrene (nah, phn, fdx, catA), cytochrome production and chemotaxis. In proteome
analysis, proteins were expressed oxidation-reduction, metabolic processes, polyamines,
aldehyde dehydrogenase, carbon storage, chemotaxis and amino acid synthesis. 355 proteins
were identified with redundancy expressed during 7h contact to P. putida S16 AM (I4) with
petroleum, and 268 during 75h contact; For glycerol, 467 were identified in 7h interaction,
and 228 in 75h contact. The presence of proteins related to metabolism and oxidationreduction
when the strain under study was in contact to the petroleum suggest the use of this
as a carbon source for bacterial metabolism. These studies are important because of
identification of genes and proteins with potential to become practical application of
biotechnology products. / A biorremediação é a utilização de microrganismos capazes de metabolizar contaminantes e
transforma-los em produtos menos tóxicos. Em estudos anteriores, foi realizado o isolamento
de bactérias provenientes de área contaminada por resíduos de petróleo na Amazônia. Apesar
de possuírem o potencial de degradação de petróleo, a aplicação de bactérias em ambientes
contaminados pode interferir em seu equilíbrio ecológico. Este estudo propôs-se a seleção de
uma linhagem bacteriana para promover estudos de caracterização gênica, identificação do
potencial de degradação de hidrocarbonetos e definição das proteínas envolvidas no processo
de degradação. Para alcançar os objetivos, foram identificadas substâncias degradadas por
cromatografia gasosa e proteínas envolvidas por proteômica; A análise do genoma permitiu a
caracterização dos genes relacionados a degradação de compostos xenobióticos através da
revisão da literatura. A cepa foi identificada como Pseudomonas putida S16. Foram
detectadas 51 substâncias por cromatografia gasosa, destas, 23 foram completamente
degradadas, incluindo HPAs contendo naftaleno (100%), antraceno (11,49%) e fenantreno
(7,41%). Foram identificados 89 genes relacionados a degradação de xenobíoticos no genoma
da P. putida S16 AM, genes capazes de degradar naftaleno, antraceno e fenantreno (nah, phn,
fdx, catA), produção de citocromo e quimiotaxia. Na análise proteômica, foram expressas
proteínas de óxido-redução, processos metabólicos, poliaminas, aldeído desidrogenase,
armazenamento de carbono, quimiotaxia e síntese de aminoácidos. Foram identificadas 355
proteínas com redundância expressas durante o contato de 7h da P. putida S16 AM (I4) com o
petróleo, e 268 no contato de 75h; Para o glicerol, foram identificadas 467 na interação de 7h,
e 228 no contato de 75h. A presença de proteínas relacionadas ao metabolismo e óxidoredução
quando a cepa em estudo esteve em contato com o petróleo evidenciam a utilização
deste como fonte de carbono para o metabolismo bacteriano. Estes estudos são importantes
devido à identificação de genes e proteínas que possuem o potencial de se tornarem produtos
biotecnológicos de aplicação prática.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:http://localhost:tede/6260 |
| Date | 30 November 2015 |
| Creators | Castro, Diogo Pereira de, 92-99216-2717 |
| Contributors | ppgbiotec@ufam.edu.br, Orlandi, Patrícia Puccinelli, Pereira, José Odair, Batista, Ieda Hortêncio, Teixeira, Ana Frazão, Chapeaurouge, Donat Alexander de, Lozano, Jorge Luis López |
| Publisher | Universidade Federal do Amazonas, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia, UFAM, Brasil, Instituto de Ciências Biológicas |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM, instname:Universidade Federal do Amazonas, instacron:UFAM |
| Rights | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/, info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | 32215883775770440, 600, 500, 461231695918095045 |
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