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LARISSA CAVALCANTE COSTA - DISSERTAÇÃO PPGCNBio 2015..pdf: 1987711 bytes, checksum: 9d66a83ab8d2cec764aeaa785de117d4 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-19T20:53:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1
LARISSA CAVALCANTE COSTA - DISSERTAÇÃO PPGCNBio 2015..pdf: 1987711 bytes, checksum: 9d66a83ab8d2cec764aeaa785de117d4 (MD5)
Previous issue date: 2015-07-31 / CNPq / O gênero Begomovirus pertence à família Geminiviridae de vírus que infectam plantas e são transmitidos pelo vetor mosca branca (Bemisia tabaci), também considerado umas das maiores pragas da agricultura. O presente estudo investigou a diversidade de begomovírus presente no vetor mosca branca (B. tabaci) em áreas da Paraíba, Minas Gerais e Distrito Federal. Um total de 17 amostras de moscas brancas foi coletado a partir de 12 espécies vegetaisem áreas da Paraíba, Minas Gerais e Distrito Federal e e usado para detecção do DNA-A de begomovirus por PCR, por RCA e por PCR-RCA, com primers específicos. Amplicons virais foram clonados e os clones recombinantes foram selecionados sob meio de cultura seletivo, contendo X-Gal e IPTG. A presença de amplicons foi confirmada por padrões de restrição gerados pelas enzimas EcoR I e Msp I em DNAs plasmidiais isolados dos clones selecionados e, então, sequenciados. As sequencias de DNA-A de begomovírus isoladas de moscas brancas coletadas em plantas de algodoeiro EMEPA-PB, em Emília, picão preto, barba-de-falcão, jatrofa, berinjela e malvona, presentes na área do Distrito Federal, foram analisadas quanto a porcentagem de identidade de sequencias de nucleotídeos e agrupamentos filogenéticos comparando com outras sequencias de isolados de begomovírus disponíveis no banco de dados GenBank. Como resultado, 5 espécies de begomovírus (SiYBV, CoMoV, SiMMV, BGMV e SiGLSV) evidenciaram a diversidade de begomovírus presente em moscas brancas nas áreas estudadas, mas que não necessariamente está presente nas respectivas plantas onde as moscas foram coletadas. Os primers PAL1v 1978 e PAR1c 496 descritos para detecção de DNA-A de begomovírus a partir de plantas foram eficientes para detecção específica desse componente genômico viral a partir do vetor mosca branca. A detecção específica de DNA-A do componente de begomovírus por PCR a partir do DNA total extraído de moscas brancas foi enriquecida pela amplificação por RCA. O begomovírus BGMV foi predominantemente encontrado em moscas brancas coletadas em plantas na área do Distrito Federal. A diversidade presente nos isolados dos 5 vírus identificados neste trabalho foi agrupada em 4 ramos filogenéticos suportados pela porcentagem de identidade de sequencias de nucleotídeos comparadas com sequencias dos isolados de begomovírus disponíveis no banco de dados GenBank / The Begomovirus genus belongs to Geminiviridae family of viruses that infect plants and is transmitted by whitefly (Bemisia tabaci) vector, which is also considered one of the major pests of agriculture. The present study investigated the diversity of begomovirusesin the whitefly vector (B. tabaci) in areas of Paraíba, Minas Gerais and the Federal District. A total of 17 samples of whiteflies were collected from 12 plant species in areas of Paraíba, Minas Gerais and the Federal District and used for the detection of begomovirus DNA-A by PCR, RCA and RCA-PCR with specific primers. Viral amplicons were cloned and the recombinant clones were selected on selective medium containing X-Gal and IPTG. The presence of amplicons was confirmed by restriction enzyme patterns generated by EcoR I and Msp I on plasmid DNAs of selected clones isolated and then sequenced. The begomovirus DNA-A sequences isolated from whiteflies collected from cotton plants EMEPA-PB, in Emilia, black prick, beard-of-hawk, jatropha, eggplant and malvona present in the Federal District, were analyzed bynucleotide sequence identity percentage and phylogenetic groups compared to other begomovirus strain sequences available in GenBank database. As a result, five species of begomovirus (SiYBV, CoMoV, SiMMV, BGMV e SiGLSV) revealed the diversity of begomovirus present in whiteflies in the studied areas, but that is not necessarily present in the respective plants where the flies were collected. The PAL1v 1978 PAR1c 496 primers described for begomovírus DNA-A detection from plants were also efficient for detection of this specific viral genomic component from whitefly vector. The specific detection of begomovirus DNA-A component by PCR from total DNA extracted from whiteflies was enriched by amplification by RCA. The BGMV begomovirus was found predominantly in whiteflies on plants collected in the Federal District. The diversity present in strains of thefive virus identified in this work was grouped into four phylogenetic branches supported by the nucleotide sequence identity percentage compared to sequences of the begomovirus strains available in GenBank database
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:localhost:riufcg/1204 |
| Date | 19 July 2018 |
| Creators | Costa, Larissa Cavalcante |
| Contributors | Campos , Magnólia de Araújo, Ribeiro, Simone da Graça, CAMPOS, Magnólia de Araújo, RIBEIRO, Simone da Graça, COSTA, Danielly Albuquerque da, LOPES, Marcus José Conceição, NASCIMENTO, Luciana Cordeiro do |
| Publisher | Universidade Federal de Campina Grande, PÓS-GRADUAÇÃO EM CIÊNCIAS NATURAIS E BIOTECNOLOGIA, UFCG, Brasil, Centro de Educação e Saúde - CES |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Source | reponame:Biblioteca de Teses e Dissertações da UFCG, instname:Universidade Federal de Campina Grande, instacron:UFCG |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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