The problems of protein parametrisation in two-dimensional electrophoresis (2DE) gel image is analysed in this work. Analysis of the proteins gives possibility to observe the health state of living organisms. In proteomics two-dimensional electrophoresis is used for protein separation in the gel according to their isoelectric point and molecular mass. The resulting gel is scanned and analysed by automatic gel image analysis systems. Those systems are not able to deal with specific protein spot distortions found in the gel image. The over-saturated protein spots prevent proper segmentation of the 2DE gel images. The aim of the work is to investigate the possibility of image reconstruction applications for object parametrisation by creating new methods for protein spot parametrisation in 2DE gel images.
Three main tasks are resolved in this work: new mathematical models for parametrisation of saturated protein spots in 2DE gel images are proposed; new method for over-saturated protein spot search and reconstruction in 2DE gel images is proposed; new method for parametrisation of overlapped protein spots in 2DE gel images is proposed.
The thesis is divided into introduction, four chapters and generalisation. The review of image reconstruction techniques and current 2DE gel image analysis problems are presented in first chapter. In the second chapter – the new mathematical models for parametrisation of saturates protein spots are proposed and experimental investigation results... [to full text] / Disertacijoje nagrinėjamos baltymų pėdsakų parametrizavimo dvimatės elektroforezės (2ME) gelių vaizduose problemos. Proteomikoje, analizuojant baltymus, tiriami gyvame organizme vykstantys pokyčiai. 2ME metu baltymai išskiriami pagal jų molekulines savybes. Deja 2ME gelių vaizdų automatinei analizei skirtose programose pritaikytos technologijos netinka iškraipytiems baltymų pėdsakams (dėl baltymų įsisotinimo, persisotinimo ar susiliejimo) aptikti ir parametrizuoti. Pagrindinis disertacijos tikslas – ištirti galimybę taikyti vaizdo rekonstravimo technologijas trimačiams objektams parametrizuoti, sukuriant ir ištiriant baltymų pėdsakų 2ME gelių vaizduose parametrizavimo metodus.
Disertacijoje sprendžiami trys pagrindiniai uždaviniai: naujų baltymų pėdsakų matematinių modelių, tinkamų įsisotinusiems baltymų pėdsakams parametrizuoti, kūrimas; baltymų persisotinimų paieškos ir rekonstravimo metodo kūrimas ir susiliejusių baltymų pėdsakų parametrizavimo metodo kūrimas. Disertaciją sudaro įvadas, keturi skyriai ir rezultatų apibendrinimas. Įvadiniame skyriuje nagrinėjamas problemos aktualumas, iškeliamos hipotezės, formuluojamas darbo tikslas bei uždaviniai, mokslinis darbo naujumas, darbo praktinė reikšmė ir disertacijos struktūra. Pirmajame skyriuje apžvelgtos parametrizavimui taikomos vaizdo rekonstravimo technologijos. Skyriuje apžvelgtos vaizdo rekonstravimo technologijos, taikomos objektui parametrizuoti, kai naudojami keli, skirtingu kampu, gauti objekto vaizdai, taikomos... [toliau žr. visą tekstą]
| Identifer | oai:union.ndltd.org:LABT_ETD/oai:elaba.lt:LT-eLABa-0001:E.02~2008~D_20090122_094213-80420 |
| Date | 22 January 2009 |
| Creators | Serackis, Artūras |
| Contributors | Navakauskas, Dalius, Štaras, Stanislovas, Eidukas, Danielius, Lipeika, Antanas Leonas, Skudutis, Julius, Kajackas, Algimantas, Martavičius, Romanas, Pupeikis, Rimantas, Vilnius Gediminas Technical University |
| Publisher | Lithuanian Academic Libraries Network (LABT), Vilnius Gediminas Technical University |
| Source Sets | Lithuanian ETD submission system |
| Language | English |
| Detected Language | Unknown |
| Type | Doctoral thesis |
| Format | application/pdf |
| Source | http://vddb.library.lt/obj/LT-eLABa-0001:E.02~2008~D_20090122_094213-80420 |
| Rights | Unrestricted |
Page generated in 0.0028 seconds