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Previous issue date: 2009-09-30 / 79 Sclerotinia sclerotiorum isolates were collected under central pivot irrigations
sistems, from Brazilian fields, divided in 4 populations (S2, S3, A and M) and analyzed
to determine the genetic variability among and between populations using molecular
markers based on microsatelittes. 10 primers were used and the amplification products
were separate in poliacrilamida gels and the bands were silver stained. A total of 102
different haplotypes were identified, and the amount of haplotypes varied from 6 to 18
for locus. The genotypic diversity ranged from 65% to 91%. Analyses based on genetic
diversity and fixation indices which indicate the variability between populations was
28.79% (FST = 28793) and the variability among populations was 71.21%. The Jaccard
similarity index indicated that the populations S2 and A is genetically closer. The
population S3 presented a similarity index of 0.44 compared with the populations S2 and
A. The population M, originated from several collection sites, was considered
genetically more distant showing a index of 0.46 compared with the others populations .
The high variability between and among populations can indicate that, besides the
possible introduction of new genotypes in the analyzed fields, could be having clonal
and sexual reproduction in isolated of S. sclerotiorum from Brazilian cerrado. / Foram coletados 79 isolados de S. sclerotiorum, sob sistemas de irrigação por pivô
central, provenientes da região do entorno de Brasília DF, divididos em 4 populações
(S2, S3, A e M) e analisados, quanto a sua variabilidade intra e interpopulações
utilizando marcadores moleculares baseados em microssatélites. Foram utilizados 10
conjuntos de oligonucleotídeos e o produto de amplificação desses marcadores foram
separados em géis de poliacrilamida e corados com nitrato de prata. Um total de 102
alelos foram identificados, sendo que a quantidade de alelos variou de 6 a 18 por lócus e
a diversidade alélica variou de 65% a 91%. A variabilidade entre as populações foi de
28.79% (Fst = 28793) e a variabilidade dentro das populações foi de 71.21%. O índice
de similaridade de Jaccard indicou que as populações S2 e A são as populações
geneticamente mais próximas, a população S3 apresentou um índice de similaridade de
0.44 em relação as populações S2 e A e a população M proveniente de vários sítios de
coleta foi considerada a população geneticamente mais distante. A alta variabilidade
dentro e entre populações pode indicar que esteja havendo reprodução tanto sexuada
como assexuada em isolados de S. sclerotiorum da região do entorno de Brasília DF.
Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.bc.ufg.br:tde/1248 |
Date | 30 September 2009 |
Creators | GOMES, Eriston Vieira |
Contributors | SILVA, Silvana Petrofeza da |
Publisher | Universidade Federal de Goiás, Mestrado em Biologia, UFG, BR, Ciências Biolóicas |
Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
Language | Portuguese |
Detected Language | Portuguese |
Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
Format | application/pdf |
Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFG, instname:Universidade Federal de Goiás, instacron:UFG |
Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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