Le cancer colorectal (CCR) représente un problème majeur de Santé publique. Des facteurs de risque environnementaux, ainsi que l'apparition séquentielle d'altérations génétiques et épigénétiques corrélant avec la progression tumorale ont été extensivement décrites. Cependant, les variations épigénétiques préexistant dans le tissu sain, potentiellement responsables de différences notoires de susceptibilité au CCR, sont restées élusives jusqu'à ce jour. Afin de répondre à cette problématique, la lignée murine Apcd14 (porteuse d'une mutation hétérozygote constitutive au niveau du gène Adenomatous polyposis coli) a servi de modèle au cours de ce projet. Les individus de cette lignée comportent une expressivité très variable, au sens qu'ils développent spontanément un nombre plus ou moins important de tumeurs intestinales, impactant sur leur survie. Cette hétérogénéité est observée en dépit de conditions d'élevage et de génomes considérés identiques. L'analyse exhaustive de cette lignée a conduit à y caractériser deux groupes de souris, présentant une gravité différente de phénotype. La variation d'expression génétique dans le tissu sain (i.e en amont de la tumorigenèse) a ensuite été analysée dans le but de comprendre l'établissement de cette hétérogénéité. Ceci a mené à la découverte d'une signature de gènes différemment exprimés entre les deux groupes, permettant de corréler de façon parfaite données moléculaires et phénotype. La potentielle héritabilité de cette signature a par la suite conduit à remettre en cause le statut considéré syngénique de la lignée. Les approches expérimentales effectuées ont déjà permis de cibler une région chromosomique, ce qui mènera à court terme à la caractérisation d'un nouvel acteur impliqué dans la tumorigenèse intestinale. De manière plus générale, les expériences développées durant ce projet ouvrent la voie à la notion de susceptibilité individuelle face au cancer dépendante de la variation d'expression génétique. / Colorectal cancer (CRC) is a major public health concern. Environmental clues, as well as sequential genetic and epigenetic alterations correlating with tumor progression have been extensively described. Meanwhile, pre-existing epigenetic variations in the healthy intestinal mucosa, potentially leading to differences in CRC suceptibility, have generally been overlooked. In order to answer to this question, we have made use of the Apcd14 mouse model (carrying a heterozygous mutation in the Adenomatous polyposis coli gene). Although all Apcd14 mice apparently share the same genome and are raised in the same environmental conditions, they exhibit a huge phenotypic variability at the individual level, spontaneously developping a few or numerous intestinal tumors, that ultimately results in differences in survival rates. Through detailed analysis of this strain, two groups have been characterized, exhibiting several phenotypic specificities. Gene expression analysis in the healthy intestinal tissue was then performed in order to understand the differences already existing, prior to tumorigenesis. This led to the identification of a group-specific gene expression signature, allowing a correlation between macroscopic phenotype and molecular data. Consideration of the hereditary potential of this signature led to reconsider the syngeneic status of the Apcd14 strain. Several experimental data already targeted a specific genomic region, and this will allow to identify the genetic alteration involved. More generally, this project opens the way to discover a link between individual susceptibility to intestinal tumorigenesis and gene expression variability.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:theses.fr/2013MON1T013 |
| Date | 20 September 2013 |
| Creators | Quesada, Stanislas |
| Contributors | Montpellier 1, Legraverend, Catherine |
| Source Sets | Dépôt national des thèses électroniques françaises |
| Language | French |
| Detected Language | French |
| Type | Electronic Thesis or Dissertation, Text |
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