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Previous issue date: 2015 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / A transcrição dirigida pela RNA polimerase II nos tripanossomatídeos produz um RNA precursor que abriga dezenas a centenas de genes que são processados para formar unidades monocistrônicas. Os processos de trans-splicing e poliadenilação vinculados ao processamento do RNA precursor são os responsáveis pela formação dos extremos do mRNA e portanto representam pontos importantes de controle pós-transcricional e de geração de diversidade funcional em termos de regiões não traduzidas (UTRs). O genoma de T. cruzi abriga genes tanto multicópia como de poucas cópias, os quais são importantes para a interação com seus hospedeiros e para realizar processos biológicos fundamentais para a sua sobrevivência. Isto levanta questões relevantes em relação à transcrição e processamento de genes duplicados ou multicópia no T. cruzi. Para acrescentar o conhecimento sobre o processamento de genes de poucas cópias nós estudamos este processo em duas cepas de Trypanosoma cruzi: Y e clone CL-Brener
Na cepa Y as formas epimastigota, amastigota e tripomastigota sanguínea da cepa Y foram estudadas usando uma abordagem baseada no pirosequencimento e em CL-Brener usamos RT-PCR, RACE, clonagem e sequenciamento pelo método de Sanger das UTRs para as formas epimastigotas e tripomastigotas metacíclicos. Os resultados indicam que a transcrição e processamento dos transcritos do locus de calmodulina nos estágios estudados de ambas cepas produz formas alternativas predominantes com 5'UTRs longas e 3'UTR curtas. Encontramos também, um marcado desequilíbrio alélico na frequência dos transcritos das cópias de calmodulina nas diferentes formas estudadas de CL-Brener. Finalmente, existe uma aparente frequência assimétrica das isoformas de calmodulina dentro de cada cópia e entre as cópias em todos os estágios de ambas cepas estudadas indicando que possivelmente o controle da abundância dos transcritos exerce um papel importante na regulação da expressão deste gene / The RNA pol II transcription in tripanosomatids produces a RNA precursor harboring
ten to hundreds of genes that must be processed to produce monocistronic mRNAs. The
trans-splicing and polyadenylation processing of the RNA precursor is responsibles for
the mRNA ends formation, important points of post-transcriptional regulation and
functional diversity around the UTRs. The T. cruzi genome harbor both multicopy and
few copies genes that are important for the interaction with the parasite host and to carry
out essential biological process for the T. cruzi survival. This fact rases relevant aspects
about the transcription and processing of genes in T. cruzi. To increase the knowledge
on the mRNA processing of genes with few copies we studied this process in two
strains: Y and CL-Brener clone. We analyzed the final mRNA from the epimastigote,
amastigote and blood trypomastigote of Y strain using amplicon pyrosequencing and for
the CL-brener epimastigote and metacyclic stage we devised an RT-PCR and RACE to
target calmodulin UTRs combined with amplicon cloning and Sanger sequencing. The
results point out that the mRNA processing of the transcripts of the calmodulin locus in
all T. cruzi stages from studied strains produced mostly calmodulin mRNA bearing long
5'UTR and short 3'UTR. Also, we found a remarkable allelic imbalance in the frequency
of the transcripts from calmodulin copies in all stages of CL-Brener. Finally, there was
an inter-copy and intra-copy asymmetric frequency of calmodulin mRNA in all stages
of the T. cruzi strain studied here indicating that the control of transcript abundance may
has an important role in the calmodulin gene expression regulation
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:www.arca.fiocruz.br:icict/13821 |
| Date | January 2015 |
| Creators | Acosta, Franklyn Enrique Samudio |
| Contributors | Ferreira, Marcelo Alves, Souza, Marcos Paulo Catanho de, Santos, Eduardo Caio Torres dos, Bello, Alexandre Ribeiro, Toma, Helena Keiko, Moreira, Carlos José de Carvalho, Mello Neto, Cicero Brasileiro de, Brandäo, Adeilton Alves |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
| Source | reponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ, instname:Fundação Oswaldo Cruz, instacron:FIOCRUZ |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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