As variações do número de cópias (CNVs) no cromossoma 2 estão associadas a uma variedade de doenças humanas, em particular distúrbios do neurodesenvolvimento, problemas comportamentais e anormalidades esqueléticas. O array comparative genomic hybridization (aCGH) constitui uma mais valia para o diagnóstico destas doenças do neurodesenvolvimento ou neuropsiquiátricas.
Este estudo tem como objetivo estabelecer uma relação genótipo-fenótipo, descrevendo CNVs identificadas no cromossoma 2, contribuindo assim para uma melhor caracterização do significado molecular das CNVs raras neste cromossoma.
Para tal, foi realizado um estudo transversal, utilizando informações genéticas disponíveis na base de dados do Departamento de Genética da Faculdade de Medicina e dados clínicos da base de dados do Hospital. As CNVs foram classificadas como patogénicas, benignas, variantes de significado desconhecido e provavelmente patogénicas ou provavelmente benignas, de acordo com o American College of Medical Genetics (ACMG) Standards and Guidelines.
Um total de 2.897 doentes foram estudados usando o aCGH. Entre as 32 CNVs encontradas no cromossoma 2, 24 foram classificadas como provavelmente patogénicas e 8 como patogénicas. Os intervalos genómicos com maior incidência localizam-se nas regiões 2p25.3 e 2q13.
Este estudo ajudará a estabelecer novas relações genótipo-fenótipo, permitindo desta forma a atualização das bases de dados e da literatura, e contribuindo para um melhor diagnóstico e aconselhamento genético, que poderá ser uma mais valia também para o aconselhamento genético pré-natal. / Copy number variations (CNVs) on chromosome 2 are associated with a variety of human diseases in particular neurodevelopmental disorders, behavioral problems, and skeletal abnormalities. Array comparative genomic hybridization (aCGH) constitute an added value for the diagnosis of these neurodevelopmental or neuropsychiatric diseases.
This study aims to stablish a genotype-phenotype correlation, reporting CNVs identified on the chromosome 2, contributing for a better characterization of the molecular significance of rare CNVs in this chromosome.
To accomplish this, a cross-sectional study was performed, using genetic information included in a database of the Department of Genetics of the Faculty of Medicine and clinical data from Hospital database. CNVs were classified as pathogenic, benign, variants of unknown significance, and likely pathogenic or likely benign, in accordance with the American College of Medical Genetics (ACMG) Standards and Guidelines.
A total of 2897 patients were studied using aCGH. Among these, 32 CNVs were found on chromosome 2, 24 classified as likely pathogenic and 8 as pathogenic. The genomic intervals with a higher incidence were the 2p25.3 and 2q13 regions.
This study will help to established new genotype-phenotype correlations, allowing the update of databases and literature and the improvement of diagnosis and genetic counselling which could be an added value also for prenatal genetic counseling.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:up.pt/oai:repositorio-aberto.up.pt:10216/142046 |
| Date | 22 March 2022 |
| Creators | Beatriz Oliveira e Sousa |
| Contributors | Faculdade de Medicina |
| Source Sets | Universidade do Porto |
| Language | English |
| Detected Language | English |
| Type | Dissertação |
| Format | application/pdf |
| Rights | restrictedAccess, https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ |
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