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Distribuição e prevalência de elementos não codificantes em Glycine Willd. Vigna Savi

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Previous issue date: 2014-07-30 / FACEPE; CNPq / A genômica comparativa tornou-se uma importante área de pesquisa nos
últimos anos, após a disponibilização de um número de genomas total ou
parcialmente sequenciados, permitindo uma visão detalhada da organização de
regiões gênicas ou não codificantes. A comparação dos genomas é de grande
importância para a análise das regiões funcionalmente relevantes, permitindo
também inferências sobre a evolução e os mecanismos que conduzem ao
rearranjo de cariótipos, havendo importantes implicações práticas,
principalmente quando são comparadas espécies cultivadas e seus parentes
silvestres, potencialmente doadores de genes para o melhoramento. Este
trabalho teve o objetivo de realizar um estudo citogenético e comparativo de
espécies dos gêneros Glycine e Vigna. Para isso foram utilizadas três
abordagens: Uma análise citogenômica comparativa mediante localização in
situ de oligonucleotídeos com padrão de microssatélites [(AAC)5, (AAG)5,
(ACC)5, (AG)8 (CTC)5, (TGA)6] ao longo dos cromossomos de Glycine soja e G.
tomentella. Nesta etapa, foram observadas regiões de marcação mais intensa
em alguns cromossomos, embora a maioria dos oligonucleotídeos tenha
apresentado distribuição dispersa nos genomas analisados. Uma segunda
abordagem avaliou a distribuição de domínios RT do retrotransposons Ty1-
copia-like, nos cromossomos de Vigna umbellata, V. sesquipedalis e V.
aconitifolia, apresentando uma distribuição dispersa e sinais proximais destes
elementos nem determinados cromossomos. Em uma terceira abordagem, foi
realizada uma investigação do elemento transponível CACTA no genoma da
soja (Glycine max), mediante análise in silico. Neste estudo, foram identificados
domínios transposase do elemento citado, compreendendo 10 Mb de Tnp1, 2,2
Mb de Tnp2, bem como domínios de outras transposases não relacionados
diretamente ao elemento CACTA, mostrando que a diversidade e abrangência
destes elementos é maior do que reportado até então. Considerando-se que
microssatélites e retrotransposons são importantes componentes dos genomas
em espécies da tribo Phaseoleae, os resultados aqui obtidos trazem
interessantes evidências sobre o papel estrutural e funcional dessas
sequências repetitivas.

Identiferoai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.ufpe.br:123456789/12340
Date30 July 2014
CreatorsSILVA, Pollyana Karla da
ContributorsBENKO-ISEPPON, Ana Maria, VIDAL, Ana Christina Brasileiro
PublisherUniversidade Federal de Pernambuco
Source SetsIBICT Brazilian ETDs
LanguageBreton
Detected LanguagePortuguese
Typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
Sourcereponame:Repositório Institucional da UFPE, instname:Universidade Federal de Pernambuco, instacron:UFPE
RightsAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil, http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/, info:eu-repo/semantics/openAccess

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