Return to search

Convolutional Neural Networks for Classification of Metastatic Tissue in Lymph Nodes : How Does Cutout Affect the Performance of Convolutional Neural Networks for Biomedical Image Classification? / Convolutional Neural Networks för att klassificera förekomsten av metastatisk vävnad i lymfkörtlarna

One of every eight women will in their lifetime suffer from breast cancer, making it the most common type of cancer for women. A successful treatment is very much dependent on identifying metastatic tissue which is cancer found beyond the initial tumour. Using deep learning within biomedical analysis has become an effective approach. However, its success is very dependent on large datasets. Data augmentation is a way to enhance datasets without requiring more annotated data. One way of doing this is using the cutout method which masks parts of an input image. Our research focused on investigating how the cutout method could improve the performance of Convolutional Neural Networks for classifying metastatic tissue on the Patch Camelyon dataset. Our research showed that improvements in performance can be achieved by using the cutout method. Further, our research suggests that using a non label- preserving version of cutout is better than a label- preserving version. The most improvement in accuracy was seen when we used a randomly sized cutout mask. The experiment resulted in an increase in accuracy by 3.6%, from the baseline of 82,3% to 85.9%. The cutout method was also compared- and used in conjunction with other well- established data augmentation techniques. Our conclusion is that cutout can be a competitive form of data augmentation that can be used both with and without other data augmentation techniques. / Var åttonde kvinna drabbas under sin livstid av bröstcancer. Detta gör det till den vanligaste formen av cancer för kvinnor. En framgångsrik behandling är beroende av att kunna identifiera metastatisk vävnad, vilket är cancer som spridit sig bortom den ursprungliga tumören. Att använda djupinlärning inom biomedicinsk analys har blivit en effektiv metod. Dock är dess framgång väldigt beroende av stora datamängder. Dataförstärkning är olika sätt att förbättra en mängd data som inte innebär att addera ytterligare annoterad data. Ett sätt att göra detta är genom den en metod som kallas Cutout som maskar en del av en bild. Vår studie undersöker hur Cutout påverkar resultatet när Convolutional Neural Networks klassificerar huruvida bilder från datasetet Patch Camelyon innehåler metastaser eller inte. Vår studie visar att användandet av Cutout kan innebära förbättringar i resultatet. Dessutom tyder vår studie på att resultatet förbättras än mer om även delen av bilden som kan innehålla metastaser kan maskas ut. Den största förbättringen i resultatet var när maskningen var av varierande storlek från bild till bild. Resultatet förbättrades från 82.3% korrekta klassifikationer utan någon dataförstärkning till 85.9% med den bästa versionen av Cutout. Cutout jämfördes också, och användas tillsammans med, andra väletablerade dataförstärkningsmetoder. Vår slutsats är att Cutout är en dataförstärkningsmetod med potentital att vara användbar såväl med som utan andra dataförstärkningsmetoder.

Identiferoai:union.ndltd.org:UPSALLA1/oai:DiVA.org:kth-302529
Date January 2021
CreatorsEricsson, Andreas, Döringer Kana, Filip
PublisherKTH, Skolan för elektroteknik och datavetenskap (EECS)
Source SetsDiVA Archive at Upsalla University
LanguageEnglish
Detected LanguageSwedish
TypeStudent thesis, info:eu-repo/semantics/bachelorThesis, text
Formatapplication/pdf
Rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
RelationTRITA-EECS-EX ; 2021:491

Page generated in 0.0021 seconds