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Identification and functional analysis of intestinal stem cell genes in homeostasis and cancer

The first chapter of this thesis describes the study of intestinal stem cells (ISCs) and
their relationship to colon cancer. We describe the transcriptional landscape of
intestinal epithelial populations through the use of the surface marker EphB2 which
allowed us to build an ISC-specific gene signature. Elevated levels of this signature
characterize CRC patients with high risk of disease relapse after therapy. Furthermore,
our studies led us to discover that colon cancers are organized according to a
hierarchical structure similar to that present in the normal colonic epithelium. EphB2-
high cells retain an ISC-like phenotype and behave as cancer stem cells (CSCs).
The second chapter of this thesis focuses on the description of the function of Mex3a, a
novel ISC-specific gene. We generated genetic mouse models to disrupt Mex3a
function in vivo. We show that this RNA binding protein is required for embryonic
development, but dispensable in adult intestines. By generating a Mex3a reporter
mouse we have been able to identify intestinal cells that resemble label-retaining cells.
This mouse strain has also allowed us to purify stem/progenitor cells from other
tissues. We demonstrate that Mex3a is a translational activator that interacts with the
protein HuR. Our data suggest that Mex3a may be involved in the response of stem
cells to stress. / El primer capítulo de esta tesis describe el estudio de células madre intestinales
(CMIs) y su relación con el cáncer de colon. Describimos los perfiles de expresión
génica de las distintas poblaciones intestinales utilizando la expresión del receptor
EphB2. Esto nos permitió describir la firma genética de las CMIs. Observamos que los
tumores de colon con altos niveles de expresión de la firma genética de CMI tienen
mayor probabilidad de recaer después de terapia. Además de estas observaciones,
describimos que los tumores de colon se organizan con una estructura similar a la del
colon normal. Finalmente observamos que las células tumorales con altos niveles de
EphB2 retienen una identidad de célula madre intestinal y se comportan como células
madre tumorales.
El segundo capítulo de esta tesis se centra en el estudio del gen Mex3a, el cual es un
nuevo gen específico de células madre intestinal. Generamos ratones modificados
genéticamente para eliminar la función de Mex3a in vivo. Observamos que este gen es
esencial para el desarrollo embrionario, pero que es dispensable para la homeostasis
del intestino adulto de ratón. También generamos un ratón reportero de Mex3a que
nos permitió purificar una población de células intestinales que se asemejan a “células
retenedoras de marcaje”. Además, con este ratón reportero pudimos purificar células
madre de otros tejidos. Demostramos que Mex3a es un activador traduccional que
interacciona con la proteína HuR. Nuestros datos sugieren que Mex3a podría estar
involucrado en como las células madre responden a estrés.

Identiferoai:union.ndltd.org:TDX_UPF/oai:www.tdx.cat:10803/292365
Date28 November 2013
CreatorsBarriga de Vicente, Francisco Martín,1983-
ContributorsBatlle Gómez, Eduard, Universitat Pompeu Fabra. Departament de Ciències Experimentals i de la Salut
PublisherUniversitat Pompeu Fabra
Source SetsUniversitat Pompeu Fabra
LanguageEnglish
Detected LanguageSpanish
Typeinfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis, info:eu-repo/semantics/publishedVersion
Format224 p., application/pdf
SourceTDX (Tesis Doctorals en Xarxa)
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