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Previous issue date: 2010 / O rotavírus (RV) é o principal agente viral associado às gastrenterites, ocasionando
em média 39% dos casos diarreicos que culminam em hospitalizações, sendo
responsável por cerca de 520.000 óbitos entre crianças menores de cinco anos de
idade a cada ano. Pertencem à família Reoviridae, gênero Rotavirus, possui RNA de
dupla fita (dsRNA) com 11 segmentos codificando 12 proteínas, sendo seis
estruturais (VPs) e seis não estruturais (NSPs). A proteína VP4, juntamente com a
VP7, compõem a camada externa do RV, designando os genótipos P e G,
respectivamente. Até o momento foram descritos 23 tipos G e 31 tipos P. O genótipo
G9 emergiu em escala global e é possivelmente associado a manifestação clínica
mais grave, estando geralmente acompanhado do genótipo P[8]. O genótipo G9
possui 6 linhagens distintas e o P[8] 4 linhagens. Este estudo objetivou caracterizar
os genes VP7 e VP4 de RV do genótipo G9, circulantes na região metropolitana de
Belém, Pará, no período de 1999 a 2007. O dsRNA viral de 38 amostras
selecionadas foi extraído a partir das suspensões fecais e submetido à eletroforese
em gel de poliacrilamida para determinação dos eletroferotipos, seguido da reação
de seqüenciamento. Na presente investigação, foi possível a análise de 32 amostras
selecionadas, sendo todas genótipo G9P[8] associadas ao eletroferotipo longo. A
análise filogenética do gene VP7 demonstrou que as amostras G9 agruparam na
linhagem 3 com elevados índices de similaridade, apresentando 8 substituições
nucleotídicas. Contudo, apenas três modificações aminoacídicas foram observadas
nas posições 43 (I→V), 66 (A→V) e 73 (Q→R), sendo estes resíduos 43 e 73
exclusivos das amostras do ano de 2007. A análise do gene VP4 demonstrou que as
amostras P[8] agruparam na linhagem 3, identificando-se 15 substituições
nucleotídicas, as quais ocasionaram quatro modificações aminoacídicas nos
resíduos 108 (V→I), 172 (R→K), 173 (I→V) e 275 (K→R). As modificações nos
resíduos 172 e 275 são exclusivos das amostras dos anos de 1999 a 2002. As
amostras do presente estudo apresentaram elevada similaridade ao longo do tempo
estudado. As amostras de 2007 foram as mais divergentes, tanto para o gene VP4
quanto para o gene VP7. É importante se proceder ao contínuo monitoramento do
genótipo G9 na região metropolitana de Belém, a fim de detectar possíveis variantes
emergentes que possam representar um desafio as estratégias de imunização
atuais. / Rotavírus (RV) is the principal viral agent associated with gastroenterites, being
responsible for 39% of the diarrhea cases that need hospitalization and with 520.000
deaths among children under five years. It belongs the to Reoviridae family, genus
Rotavirus, the genome consists of 11 segments of double-stranded RNA that
encoding 12 proteins, six structural (VPs) and six non-structural (NSPs). The VP4
protein, together VP7 protein, compose the outer layer of the RV, defining genotypes
P and G, respectively. Until now, at least 23 different G genotypes and 31 P
genotypes have been established. The G9 genotype emerged in world scale, and is
possibly associated with severe clinical manifestation, being generally associated
with P[8] genotype. The G9 genotype has 6 distinct lineages and P[8] 4 lineages. The
aimed of this study was the characterization of VP4 and VP7 genes of the RV G9
genotype, that circulated in the metropolitan region of Belém, in the period of 1999 to
2007. The viral dsRNA of 38 selected samples were extracted from fecal
suspensions and submitted to electrophorese in gel of poliacrylamide to determine
the electropherotypes, followed sequencing reaction. In the present investigation,
was possible analyzed 32 selected samples, all of them G9P[8] genotype, with long
electropherotype. Phylogenetic analysis of VP7 gene showed that all G9 strains
belong to lineage 3 with high similarity indexes, with 8 nucleotide changes. However,
only three amino acids changes were observed in the positions 43 (I→V), 66 (A→V)
e 73 (Q→R), being the substitutions at positions 43 and 73 exclusive of the samples
isolated in 2007 year. Phylogenetic analysis of VP4 gene revealed that all strains
P[8] belong to lineage 3, with 15 nucleotide changes, that showed four amino acids
substitutions at positions 108 (V→I), 172 (R→K), 173 (I→V) e 275 (K→R). The amino
acids substitutions at positions 172 and 275 were exclusive of the strains isolated
from 1999 to 2002. The samples of the present study showed high homology
throughout the studied period. The strains isolated in 2007 were the most divergence
either to VP4 as to VP7 gene. It is important the continuous surveillance of G9
genotype in the metropolitan region of Belém, to detected possible new genetic
variants that can represent a challenge to the current strategies of immunization.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.ufpa.br:2011/3886 |
| Date | 05 July 2010 |
| Creators | GUERRA, Sylvia de Fátima dos Santos |
| Contributors | MASCARENHAS, Joana D'Arc Pereira, SOARES, Luana da Silva |
| Publisher | Universidade Federal do Pará, Programa de Pós-Graduação em Doenças Tropicais, UFPA, Brasil, Núcleo de Medicina Tropical |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | English |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Source | reponame:Repositório Institucional da UFPA, instname:Universidade Federal do Pará, instacron:UFPA |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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