Return to search

Mot en effektiv data- och informationshantering på SiCell

Denna projektrapport är avsedd att vara ett hjälpmedel för SiCell, en del av SciLifeLab Uppsala som ska bli Europas första plattform för enkelcellgenomik till hösten 2013. SiCell har bett projektgruppen om undersökningar gällande ett Laboratory Information Management System, LIMS. På svenska ett datahanteringsystem för laboratorier. Ett sådant system skulle kunna effektivisera SiCells verksamhet. Undersökningarna har resulterat i en kravspecifikation som ett LIMS för SiCell ska uppfylla och en sammanställning av tillgängliga mjukvaror som bäst uppfyller dessa krav. Screensaver, MISO och Gnomex är de tre gratisprogram med öppen källkod som hamnade högst upp i listan. Inget av dem uppfyller alla krav men med modifieringar av programmerare tros detta vara möjligt. SiCell bad också om lägre prioriterade undersökningar av några av de metoder som används inom plattformen. Cellysering, Alternativa amplifieringsmetoder och transkriptomik har undersökts av projektgruppen. Detta resulterade i en sammanställning av vilka alternativ som finns och vad som är under utveckling inom respektive område.

Identiferoai:union.ndltd.org:UPSALLA1/oai:DiVA.org:uu-201165
Date January 2013
CreatorsBergman, Ebba, Blomkvist, Viktor, Erkers, Julia, Handin, Niklas, Hellner, Joakim, Nettelblad, Jessica
PublisherUppsala universitet, Institutionen för biologisk grundutbildning, Uppsala universitet, Institutionen för biologisk grundutbildning, Uppsala universitet, Institutionen för biologisk grundutbildning, Uppsala universitet, Institutionen för biologisk grundutbildning, Uppsala universitet, Institutionen för biologisk grundutbildning, Uppsala universitet, Institutionen för biologisk grundutbildning
Source SetsDiVA Archive at Upsalla University
LanguageSwedish
Detected LanguageSwedish
TypeStudent thesis, info:eu-repo/semantics/bachelorThesis, text
Formatapplication/pdf
Rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess

Page generated in 0.0021 seconds