Submitted by Ana Maria Fiscina Sampaio (fiscina@bahia.fiocruz.br) on 2012-08-31T17:46:19Z
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Thessika Hialla Almeida Araujo Desenvolvimento de um banco de dados HTLV-1....pdf: 1454472 bytes, checksum: 665a7044bdf71c54637b51f71b0d6527 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-08-31T17:46:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1
Thessika Hialla Almeida Araujo Desenvolvimento de um banco de dados HTLV-1....pdf: 1454472 bytes, checksum: 665a7044bdf71c54637b51f71b0d6527 (MD5)
Previous issue date: 2012 / Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, Bahia, Brasil / As pesquisas biológicas geram uma grande quantidade de informações que
devem ser armazenadas e gerenciadas, permitindo que os usuários tenham
acesso a dados completos sobre o tema de interesse. O volume de dados não
relacionados gerados nas pesquisas com HTLV-1 justifica a criação de um
Banco de dados que contenha o maior número de informações sobre o vírus,
seus aspectos epidemiológicos, para que possam estabelecer melhores
relações sobre infecção, patogênese, origem e principalmente, evolução. Os
dados foram obtidos a partir de pesquisa no GENBANK, em artigos
relacionados e diretamente com os autores dos dados. O banco de dados foi
desenvolvido utilizando o Apache Webserver 2.1.6 e o SGBD – MySQL. A
webpage foi desenvolvida em HTML a escrita em PHP. Atualmente temos
cadastradas 2435 sequências, sendo que 1968 (80,8%) representam diferentes
isolados. Em relação ao status clínico, o banco de dados tem informação de
40,49% das sequências, no qual 43%, 18,69%, 32,7%, 5,61% são TSP/HAM,
ATL, assintomático e outras doenças, respectivamente. Quanto ao gênero e
idade tem-se informação de 15,4% e 10,56% respectivamente. O HTLV-1
Molecular Epidemiology Database está hospedado no servidor do Centro de
Pesquisa Gonçalo Moniz/FIOCRUZ-BA com acesso em
http://htlv1db.bahia.fiocruz.br/, sendo um repositório de sequências do HTLV-1
com informações clínicas, epidemiológicas e geográficas. Esta base de dados
dará apoio às investigações clínicas e pesquisas para desenvolvimento de
vacinas. / Scientific development has generated a large amount of data that should be
stored and managed in order for researchers to have access to complete data
sets. Information generated from research on HTLV-1 warrants the design of
databases to aggregate data from a range of epidemiological aspects. This
database would support further research on HTLV-1 viral infections,
pathogenesis, origins, and evolutionary dynamics. All data was obtained from
publications available at GenBank or through contact with the authors. The
database was developed using the Apache Webserver 2.1.6 and SGBD
MySQL. The webpage interfaces were developed in HTML and sever-side
scripting written in PHP. There are currently 2,435 registered sequences with
1,968 (80.8%) of those sequences representing different isolates. Of these
sequences, 40.49% are related to clinical status (TSP/HAM, 43%, ATLL,
18.69%, asymptomatic, 32.7%, and other diseases, 5.61%). Further, 15.4% of
sequences contain information on patient gender while 10.56% of sequences
provide the age of the patient. The HTLV-1 Molecular Epidemiology Database is
hosted on the Gonçalo Moniz/FIOCRUZ-BA research center server with access
at http://htlv1db.bahia.fiocruz.br/. Here, we have developed a repository of
HTLV-1 genetic sequences from clinical, epidemiological, and geographical
studies. This database will support clinical research and vaccine development
related to viral genotype.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:www.arca.fiocruz.br:icict/4315 |
| Date | January 2012 |
| Creators | Araújo, Thessika Hialla Almeida |
| Contributors | Alcantara, Luiz Carlos Júnior |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Source | reponame:Repositório Institucional da FIOCRUZ, instname:Fundação Oswaldo Cruz, instacron:FIOCRUZ |
| Rights | Thessika Hialla Almeida Araújo, info:eu-repo/semantics/openAccess |
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