CERN Scalable Analytics Section currently offers shared YARN clusters to its users as monitoring, security and experiment operations. YARN clusters with data in HDFS are difficult to provision, complex to manage and resize. This imposes new data and operational challenges to satisfy future physics data processing requirements. As of 2018, there were over 250 PB of physics data stored in CERN’s mass storage called EOS. Hadoop-XRootD Connector allows to read over network data stored in CERN EOS. CERN’s on-premise private cloud based on OpenStack allows to provision on-demand compute resources. Emergence of technologies as Containers-as-a-Service in Openstack Magnum and support for Kubernetes as native resource scheduler for Apache Spark, give opportunity to increase workflow reproducability on different compute infrastructures with use of containers, reduce operational effort of maintaining computing cluster and increase resource utilization via cloud elastic resource provisioning. This trades-off the operational features with datalocality known from traditional systems as Spark/YARN with data in HDFS.In the proposed architecture of cloud-managed Spark/Kubernetes with data stored in external storage systems as EOS, Ceph S3 or Kafka, physicists and other CERN communities can on-demand spawn and resize Spark/Kubernetes cluster, having fine-grained control of Spark Applications. This work focuses on Kubernetes CRD Operator for idiomatically defining and running Apache Spark applications on Kubernetes, with automated scheduling and on-failure resubmission of long-running applications. Spark Operator was introduced with design principle to allow Spark on Kubernetes to be easy to deploy, scale and maintain with similar usability of Spark/YARN.The analysis of concerns related to non-cluster local persistent storage and memory handling has been performed. The architecture scalability has been evaluated on the use case of sustained workload as physics data reduction, with files in ROOT format being stored in CERN mass-storage called EOS. The series of microbenchmarks has been performed to evaluate the architecture properties compared to state-of-the-art Spark/YARN cluster at CERN. Finally, Spark on Kubernetes workload use-cases have been classified, and possible bottlenecks and requirements identified. / CERN Scalable Analytics Section erbjuder för närvarande delade YARN-kluster till sina användare och för övervakning, säkerhet, experimentoperationer, samt till andra grupper som är intresserade av att bearbeta data med hjälp av Big Data-tekniker. Dock är YARNkluster med data i HDFS svåra att tillhandahålla, samt komplexa att hantera och ändra storlek på. Detta innebär nya data och operativa utmaningar för att uppfylla krav på dataprocessering för petabyte-skalning av fysikdata.Från och med 2018 fanns över 250 PB fysikdata lagrade i CERNs masslagring, kallad EOS. CERNs privata moln, baserat på OpenStack, gör det möjligt att tillhandahålla beräkningsresurser på begäran. Uppkomsten av teknik som Containers-as-a-Service i Openstack Magnum och stöd för Kubernetes som inbyggd resursschemaläggare för Apache Spark, ger möjlighet att öka arbetsflödesreproducerbarheten på olika databaser med användning av containers, minska operativa ansträngningar för att upprätthålla datakluster, öka resursutnyttjande via elasiska resurser, samt tillhandahålla delning av resurser mellan olika typer av arbetsbelastningar med kvoter och namnrymder.I den föreslagna arkitekturen av molnstyrda Spark / Kubernetes med data lagrade i externa lagringssystem som EOS, Ceph S3 eller Kafka, kan fysiker och andra CERN-samhällen på begäran skapa och ändra storlek på Spark / Kubernetes-klustrer med finkorrigerad kontroll över Spark Applikationer. Detta arbete fokuserar på Kubernetes CRD Operator för idiomatiskt definierande och körning av Apache Spark-applikationer på Kubernetes, med automatiserad schemaläggning och felåterkoppling av långvariga applikationer. Spark Operator introducerades med designprincipen att tillåta Spark över Kubernetes att vara enkel att distribuera, skala och underhålla. Analys av problem relaterade till icke-lokal kluster persistent lagring och minneshantering har utförts. Arkitekturen har utvärderats med användning av fysikdatareduktion, med filer i ROOT-format som lagras i CERNs masslagringsystem som kallas EOS. En serie av mikrobenchmarks har utförts för att utvärdera arkitekturegenskaperna såsom prestanda jämfört med toppmoderna Spark / YARN-kluster vid CERN, och skalbarhet för långvariga dataprocesseringsjobb.
Identifer | oai:union.ndltd.org:UPSALLA1/oai:DiVA.org:kth-237455 |
Date | January 2018 |
Creators | Mrowczynski, Piotr |
Publisher | KTH, Skolan för elektroteknik och datavetenskap (EECS) |
Source Sets | DiVA Archive at Upsalla University |
Language | English |
Detected Language | Swedish |
Type | Student thesis, info:eu-repo/semantics/bachelorThesis, text |
Format | application/pdf |
Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
Relation | TRITA-EECS-EX ; 2018:609 |
Page generated in 0.0023 seconds