Return to search

A novel nomenclature for the identification of ground truth in medical imaging data : Design, implementation and integration in a large knowledge database

The annotation of medical images is a critical task for many downstream applications. However, the lack of a unified annotation nomenclature has resulted in inconsistency and ambiguity in the storage and use of such data. In this thesis, we propose and evaluate a novel annotation nomenclature for medical images. Our nomenclature is designed to be intuitive, easy to use and to expand. We also developed a knowledge database storing large medical image datasets that integrates the new nomenclature. The database is implemented as a server application exposing REST APIs. This allows users to upload/download datasets and query the data based on the annotations and to integrate the system in existing frameworks. We conducted a user study to assess the usability characteristics of the label nomenclature and its integration in the new system. The results collected from the user base are positive. The nomenclature is well perceived and the users had rated positively the usability of the whole system. / Annotering av medicinska bilder är en kritisk uppgift för många efterföljande tillämpningar. Bristen på en enhetlig annoteringsnomenklatur har emellertid resulterat i inkonsekvens och tvetydighet i lagring och användning av sådana data. I denna avhandling föreslår och utvärderar vi en ny annoteringsnomenklatur för medicinska bilder. Vår nomenklatur är utformad för att vara intuitiv, lätt att använda och att expandera. Vi har också utvecklat en kunskapsdatabas som lagrar stora medicinska bildsätt som integrerar den nya nomenklaturen. Databasen är implementerad som en serverapplikation som exponerar REST API: er. Detta gör att användare kan ladda upp / ladda ner datasätt och söka efter data baserat på annotationer och integrera systemet i befintliga ramverk. Vi genomförde en användarstudie för att bedöma användbarhetskaraktäristikerna för etikettnomenklaturen och dess integration i det nya systemet. Resultaten som samlades in från användarbasen är positiva. Nomenklaturen är väl uppfattad och användarna har positivt betygsatt användbarheten i hela systemet.

Identiferoai:union.ndltd.org:UPSALLA1/oai:DiVA.org:kth-343140
Date January 2023
CreatorsRealini, Edoardo
PublisherKTH, Skolan för elektroteknik och datavetenskap (EECS)
Source SetsDiVA Archive at Upsalla University
LanguageEnglish
Detected LanguageSwedish
TypeStudent thesis, info:eu-repo/semantics/bachelorThesis, text
Formatapplication/pdf
Rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
RelationTRITA-EECS-EX ; 2023:842

Page generated in 0.0022 seconds