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Previous issue date: 2014-07-18 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / Dengue is a major challenge to public health in Brazil and worldwide. Dengue virus (DENV) is an arbovirus of the family Flaviviridae, genus Flavivirus, classified into four antigenically distinct serotypes DENV1-4. Since the introduction of DENV1 in Goiás, the current situation consisted of successive epidemics of dengue fever with change among prevalence serotypes. One of the factors that have been associated with the pathogenesis of this infection is the occurrence of a cross-serotype immune response in secondary infections. Thus, the identification of circulating serotypes and also the characterization of the genomic variants have been considered important on disease surveillance, since the introduction of new variants can be a risk factor for severe dengue. In this context, the present study aimed to investigate the occurrence of DENV infection in individuals treated at health centers in Goiânia, Goiás in the epidemic period 2012-2013, using serological and molecular methods for determining the rate of positivity and identification of serotypes/genotypes in the circulating virus. For this, 278 samples from suspected individuals of DENV infection, which were submitted to the research of serological markers NS1, IgM and IgG using a commercial kit, as well as viral RNA detection and serotype identification by RT-PCR for region C-prM. The positivity for infection was 43.9%, with rates of 30.5%, 13.6% and 20.5% for NS1, IgM and RNA, respectively. Considering the RNA-positive samples, 31.5% were DENV1 and 68,5% were DENV4, which were subjected to nucleotide sequencing of the E/NS1 junction to characterize the viral genotype. Phylogenetic analysis classified the DENV1 samples as genotype V, that differentiated into two clades, which may reflect the occurrence of genetic variants with differences in evolutionary history. For DENV4 samples, classified as genotype II, was observed a phylogenetic proximity between the strains analyzed and others strains of the country and Latin America. These results demonstrate the effectiveness of the combination methods in the diagnosis of DENV infection. Still, the molecular evaluation has proven crucial to establish a complete data base to be used for surveillance studies, collaborating with investigations of the dynamics of the virus and the expected profile for future epidemics. / A dengue é um dos maiores desafios para a saúde pública no Brasil e no mundo. O vírus dengue (DENV) é um arbovírus da família Flaviviridae, gênero Flavivírus, classificado em quatro sorotipos antigenicamente distintos DENV1-4. Desde a introdução do DENV1 em Goiás, o cenário da dengue consistiu de epidemias sucessivas de dengue com alternância da predominância entre os sorotipos. Um dos fatores que têm sido associados à patogênese desta infecção, é a ocorrência de uma resposta imune sorotipo cruzada em infecções secundárias. Assim, a identificação dos sorotipos circulantes, bem como a caracterização das variantes genômicas, têm sido consideradas importantes na vigilância da doença, uma vez que a introdução de novas variantes pode constituir um fator de risco para a gravidade da doença. Nesse contexto, o presente estudo objetivou investigar a ocorrência de infecção pelo DENV em indivíduos atendidos em unidades de saúde no município de Goiânia, Goiás no período epidêmico de 2012-2013, utilizando métodos sorológicos e moleculares, para determinação do índice de positividade e identificação dos sorotipos/genótipos do vírus circulantes. Para isso, foram coletadas 278 amostras de indivíduos suspeitos de infecção pelo DENV, as quais foram submetidas à pesquisa dos marcadores sorológicos NS1, IgM e IgG utilizando kit comercial, bem como a detecção do RNA viral e identificação do sorotipo através de RT-PCR para a região C-prM. A positividade para a infecção foi de 43,9%, com índices de 30,5%, 13,6% e 20,5%, para os marcadores NS1, IgM e RNA, respectivamente. Das 57 amostras RNA positivas, 31,5% eram DENV-1 e 68,5% DENV-4, as quais foram submetidas ao seqüenciamento de nucleotídeos da região da junção E/NS1 para a caracterização do genótipo viral. As análises filogenéticas classificaram as amostras DENV1 como genótipo V, sendo observada a diferenciação em dois clados, podendo refletir a ocorrência de variantes genéticas com diferenças na história evolutiva. Para as amostras DENV4, classificadas como genótipo II, foi observada uma proximidade filogenética entre os isolados deste estudo e outros isolados do país e América Latina. Estes resultados demonstram a eficácia da combinação de metodologias no diagnóstico desta infecção. Ainda, a avaliação molecular mostra-se fundamental para estabelecer uma base de dados completa a ser utilizada para estudos de vigilância, colaborando com investigações da dinâmica do vírus e o padrão esperado para as epidemias futuras.
Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.bc.ufg.br:tede/4178 |
Date | 18 July 2014 |
Creators | Guimarães, Vanessa Neiva |
Contributors | Fiaccadori, Fabíola Souza, Souza, Menira Borges de Lima Dias e, Cardoso, Divina das Dores de Paula, Fiaccadori, Fabíola Souza |
Publisher | Universidade Federal de Goiás, Programa de Pós-graduação em Biologia das Interações PH (IPTSP), UFG, Brasil, Instituto de Patologia Tropical e Saúde Pública - IPTSP (RG) |
Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
Language | Portuguese |
Detected Language | Portuguese |
Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
Format | application/pdf |
Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFG, instname:Universidade Federal de Goiás, instacron:UFG |
Rights | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/, info:eu-repo/semantics/openAccess |
Relation | 6367159433410056917, 600, 600, 600, 600, -7769011444564556288, 7934387506561046206, -961409807440757778 |
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