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Previous issue date: 2017-09-22 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / Genetic diversity is a fundamental component for the survival of any species over evolutionary
time, because it is the repertoire of possible responses to environmental pressures, which are
dynamic and constant. Knowledge of the magnitude and structuring patterns of this diversity
allows to understand how environmental and microevolutionary factors have interacted over time
and shaped the populations. Microsatellite markers have been the most used molecular tool in
recent decades for mapping studies of diversity and genetic structure due to its high degree of
polymorphism, genomic abundance and codominant nature. For native species these markers rarely
are available, however, the regions flanking the microsatellites are usually conserved among
evolutionarily close species, which allows the transfer of these markers. Pterodon emarginatus
Vogel, popularly known as Sucupira branca, is a tree plant belonging to the legume family. This
species is widely used for medicinal purposes because of the broad properties of its secondary
compounds. In addition, it provides rigid wood of interest for construction and is also used as an
ornamental species. Despite the substantial number of studies directed to the medicinal potential,
little is known about the genetic diversity present in this species. Therefore, the objectives of the
work were to transfer to P. emarginatus microsatellite markers developed for Dipteryx alata and to
access the diversity and genetic structure in natural populations of P. emarginatus. For this, the
cross-amplification of 25 primers were tested and 12 natural populations were genotyped for 6 loci.
Of the 25 primers tested, 2 (8%) showed good amplification and polymorphism pattern. The set of
markers used revealed a total of 45 alleles for the 12 populations evaluated, with a mean of 7.667
per locus. This value ranged from 4 (DaE12) to 22 (PVESTBR067). Populations showed
intermediate levels of genetic diversity (He = 0.555) and greater variability within populations than
among populations. Small but significant levels of inbreeding were detected due to both the mating
system and the population subdivision (f = 0.07; Fst = 0.073). These results support that the species
presents a mixed mating system, being preferentially allogama. The pattern of divergence among
populations was moderately structured in space (Mantel = 0.440, p <0.002) indicating a profile of
large continuous populations with significant levels of gene flow over distances up to
approximately 400 km. / A diversidade genética é componente fundamental para a sobrevivência de qualquer espécie ao
longo do tempo evolutivo, isto porque configura-se como o repertório de possíveis respostas ás
pressões ambientais, que são dinâmicas e constantes. O conhecimento da magnitude e dos padrões
de estruturação dessa diversidade permite entender como fatores ambientais e microevolutivos tem
interagido ao longo do tempo e moldado as populações, possibilitando melhor uso e conservação.
Marcadores microssatélites tem sido a ferramenta molecular mais utilizada nas últimas décadas
para estudos de mapeamento de diversidade e estrutura genética, devido ao seu alto grau de
polimorfismo, abundância genômica e natureza codominante. Para espécies nativas raramente
esses marcadores estão disponíveis, no entanto, as regiões que flanqueiam os microssatélites
costumam ser conservadas entre espécies evolutivamente próximas, o que possibilita a
transferência desses marcadores. Pterodon emarginatus Vogel, popularmente conhecida como
Sucupira Branca, é uma planta arbórea pertencente à família das leguminosas. Esta espécie é
amplamente utilizada com propósitos medicinais devido ao vasto potencial terapêutico de seus
compostos secundários. Além disso, fornece madeira rígida de interesse para construção civil e
também é utilizada como espécie ornamental. Apesar da grande quantidade de estudos
direcionados para o potencial medicinal, pouco se sabe sobre a diversidade genética presente nessa
espécie. Diante disso, os objetivos do trabalho foram transferir para P. emarginatus marcadores
microssatélites desenvolvidos para Dipteryx alata e acessar a diversidade e estrutura genética em
populações naturais de P. emarginatus. Para isso, foi testada à amplificação cruzada de 25
iniciadores e 12 populações naturais foram genotipadas para 6 locos microssatelites. Dos 25
iniciadores testados, 2 (8%) apresentaram bom padrão de amplificação e polimorfismo. O conjunto
de marcadores utilizados revelou um total de quarenta e cinco alelos, com uma média de 7,667 por
loco. Esse valor variou de 4 (DaE12) a 22 (PVESTBR067). As populações apresentaram nível
intermediário de diversidade genética (He=0,555) e maior variabilidade dentro de populações do
que entre populações. Foram detectados pequenos, porém significativos, níveis de endogamia
devido tanto ao sistema de acasalamento quanto a subdivisão populacional (f= 0,07; Fst= 0,073).
Esses resultados suportam que a espécie apresenta sistema misto de acasalamento. O padrão de
divergência entre as populacionais demonstrou-se moderadamente estruturado no espaço (Mantel=
0,440; p<0,002) indicando um perfil de grandes populações continuas, com níveis significativos de
fluxo gênico em distancias até aproximadamente 400 km.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.bc.ufg.br:tede/9102 |
| Date | 22 September 2017 |
| Creators | Pinto, Marcos Vinícius Pereira |
| Contributors | Soares, Thannya Nascimento, Soares, Thannya Nascimento, Telles, Mariana Pires de Campos, Mansano, Vidal de Freitas |
| Publisher | Universidade Federal de Goiás, Programa de Pós-graduação em Genética e Melhoramento de Plantas (EA), UFG, Brasil, Escola de Agronomia - EA (RG) |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFG, instname:Universidade Federal de Goiás, instacron:UFG |
| Rights | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/, info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | -6265679607231828330, 600, 600, 600, 600, -6046953723502374070, -3091138714907603907, -961409807440757778 |
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