Los plásmidos en cepas de Acidithiobacillus sp. aislados de aguas ácidas de mina son
recursos genéticos que aún no han sido reportado en nuestro país, que podrían usarse en
la construcción de vectores y el mejoramiento de cepas bacterianas para su aplicación en
biorremediación y biolixiviación. Por ello, el objetivo de esta tesis fue determinar la
presencia de plásmidos de Acidithiobacillus aislados de aguas ácidas de zonas mineras, y
analizar in sílico genes putativos identificados a partir del secuenciamiento y anotación de
dos plásmidos de la cepa At. ferrivorans PQ33.
Para la extracción de plásmidos se utilizó el protocolo de PureLink™ Quick Plasmid
Miniprep Kit (Invitrogen ™). Los plásmidos de At. ferrivorans PQ33 fueron secuenciados
por síntesis química en sistema HiSeq 200 de Illumina. El software Velveth, versión 1.1, fue
empleado para el ensamblamiento de novo de las secuencias. Los plásmidos circularizados
fueron anotados usando las herramientas Prokka y ORFfinder, las búsquedas de
similaridad se realizaron empleando BlastX contra la base de datos del GenBank. Blastn y
el software Artemis fueron usados para identificar los orígenes de replicación. De 24 cepas
de Acidithiobacillus (10 de Puno, 6 de Huancavelica y 8 de Cerro de Pasco), 17 (70.83%)
presentaron plásmidos. El análisis in silico reveló la presencia de genes implicados en la
conjugación (TraD, MobA, proteínas de exclusión de entrada y XerD), sistemas toxina-anti
toxina (HicA y HicB), proteínas de replicación (RepA y proteínas de union a DNA),
reguladores de transcripción y post traducción (CopG y la chaperona DnaJ), así como la
destacable presencia de una proteína de virulencia (VapD), además de dos proteínas
(Porina fosfato selectiva O y diguanilato ciclasa), implicadas en la resistencia a la falta de
nutrientes y producción de biofilm, respectivamente. Es la primera vez que se reporta plásmidos caracterizados de un cepa psicrotolerante de
Acidithiobacillus ferrivorans, con capacidad de transferencia horizontal y sistemas de
regulación implicados tanto en el mantenimiento del plásmido como en la adherencia a
sustratos, característica importante de esta especie para su aplicación en biominería. / Tesis
| Identifer | oai:union.ndltd.org:Cybertesis/oai:cybertesis.unmsm.edu.pe:cybertesis/6087 |
| Date | January 2016 |
| Creators | Eca Avila, Anika Guadalupe |
| Contributors | Ramírez Roca, Pablo Sergio |
| Publisher | Universidad Nacional Mayor de San Marcos |
| Source Sets | Universidad Nacional Mayor de San Marcos - SISBIB PERU |
| Language | Spanish |
| Detected Language | Spanish |
| Type | info:eu-repo/semantics/bachelorThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | Repositorio de Tesis - UNMSM, Universidad Nacional Mayor de San Marcos |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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