The high world energy demand requires a search for renewable sources which are less
harmful to environment. Castor bean (Ricinus communis L.) cultivation is an excellent
alternative to compound the national energy matrix due to its traditional small and
intermediate producers, standing out as a culture with high economical and social appeal,
especially in Northeast region. There is a lack of information, especially at molecular level,
related to the amount of high genetic variability available in this oil crop. The objective of this
work was to characterize the genetic diversity within ten genotypes of Ricinus communis L.
by using RAPD molecular markers. A total of seven lines and three cultivars were evaluated,
which included five lines from Germplasm Bank of Embrapa Algodão, two lines from Costa
Rica and three Northeastern cultivars. Genomic DNA extraction was performed according
both to Graham et al. (1994) and an alternative protocol proposed in this study. Seven
arbitrary oligonucleotides employed in the RAPD-PCR amplification permitted to evaluate
the efficiency of the genomic DNA extraction protocols, DNA banding profiles and
calculation of similarity indexes. Similarity and cluster analysis were conducted using both
Jaccard and Dice coefficient and the unweighted pair group method. The similarity data
matrix was converted into a dendrogram. The amplified fragments yielded a total of 58
polymorphic bands ranging from 2394 to 3386 bp. On the basis of the performed analysis,
similarity indexes and data clustering revealed the occurrence of high genetic variability
among the genotypes. RAPD molecular markers were efficient on the detection of DNA
polymorphism within genotypes evaluated, suggesting that this marker could be suitable for
further characterization studies related to the main agroindustrial features of castor bean
germplasm. / Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Alagoas / A elevada demanda energética mundial faz necessária a busca por fontes renováveis e menos
agressivas ao meio ambiente. O cultivo da mamona (Ricinus communis L.) constitui uma
excelente alternativa na composição da matriz energética nacional por ser tradicionalmente
praticado por pequenos e médios produtores, destacando-se como uma cultura de elevado
apelo econômico e social, em especial na região Nordeste. Existe uma escassez de
informações, especialmente no âmbito molecular, acerca da grande variabilidade genética
apresentada por essa oleaginosa. O objetivo do presente trabalho foi caracterizar a diversidade
genética entre dez genótipos de Ricinus communis L. por meio de marcadores moleculares
RAPD. Foram avaliadas cinco linhagens do BAG da Embrapa Algodão, duas linhagens
provenientes da Costa Rica e três variedades comerciais da região Nordeste. A extração do
DNA genômico total dos genótipos foi realizada segundo metodologia descrita por Graham et
al. (1994) e através de um protocolo alternativo proposto nesse estudo. O emprego de sete
iniciadores arbitrários na amplificação RAPD-PCR permitiu avaliar a eficiência dos
protocolos na extração do DNA genômico total, o padrão de bandas de DNA gerado e o
cálculo de índices de similaridade. A matriz de dados de similaridade entre os genótipos foi
convertida num dendrograma. Na análise dos fragmentos amplificados foram reveladas 58
bandas polimórficas com fragmentos de 2394 a 3386 pb. Ainda na avaliação dos resultados, a
distância genética e o agrupamento gerado pelo dendrograma evidenciaram a grande
variabilidade genética existente entre os indivíduos. Os marcadores moleculares RAPD
mostraram-se eficientes na detecção de polimorfismos de DNA dos demais genótipos
avaliados, tornando possível seu emprego em posteriores estudos de caracterização
correlacionados com os principais caracteres agroindustriais de germoplasma de mamona.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:www.repositorio.ufal.br:riufal/204 |
| Date | 11 September 2006 |
| Creators | Cunha, Muciana Aracely da Silva |
| Contributors | Ramalho Neto, Cicero Eduardo, RAMALHO NETO, C. E., Soares, Lailton, http://lattes.cnpq.br/6462387513895322, Silva, Denise Maria Wanderlei, SILVA, D. M. W., Albuquerque, Marcondes Maurício, http://lattes.cnpq.br/7818319423646536 |
| Publisher | Universidade Federal de Alagoas, BR, Agronomia; Produção vegetal; Proteção de plantas, Programa de Pós-Graduação em Agronomia, UFAL |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Repositório Institucional da UFAL, instname:Universidade Federal de Alagoas, instacron:UFAL |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | bitstream:http://www.repositorio.ufal.br:8080/bitstream/riufal/204/1/Dissertacao_MucianaAracelydaSilvaCunha_2006_Aquivo_Liberado.pdf, bitstream:http://www.repositorio.ufal.br:8080/bitstream/riufal/204/2/Dissertacao_MucianaAracelydaSilvaCunha_2006_Aquivo_Liberado.pdf.txt |
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