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Functional characterization of a subset (RipAX2, RipH2, RipHS and RipG7) of type III effectors from Ralstonia solanacearum / Analyse fonctionnelle des effecteurs de type III (RipAX2, RipH2, RipH3 et RipG7) de la bactérie phytopathogène Ralstonia solanacearum

La bactérie phytopathogène du sol, Ralstonia solanacearum cause la maladie du flétrissement bactérien sur un grand nombre de plante hôtes. Un des déterminants clefs de son pouvoir pathogène est le système de sécrétion de type III. Celui-ci permet à la bactérie d'injecter des protéines directement dans les cellules de l'hôte. Dans ma thèse je me suis attaché à décrire et analyser finement la contribution au pouvoir pathogène de la bactérie de certains de ces substrats de l'appareil de sécrétion de type III (RipAX2, RipH2, RipH3 et RipG). Des expériences de double-hybride nous ont permis d'identifier des protéines des plantes hôtes pouvant être ciblées par ces effecteurs de type III. Dans une autre partie de mon travail j'ai contribué à l'étude de RipAX2 qui est induit spécifiquement la résistance dans des lignées d'aubergines porteur d'un locus de résistance. J'ai également travaillé sur l'identification des cellules de plantes soumises à l'injection de type III dans une interaction compatible. Pour cela j'ai utilisé la plante hôte Medicago truncatula, en exprimant dans certaines lignées cellulaires un effecteurs (RipG7) pour lequel nous avions démontré que son expression constitutive das M. truncatula pouvait restaurer l'infection de ces plantes par un mutant bactérien dans ce même effecteur. Enfin, j'ai aussi contribué à l'analyse structure-fonction fine de l'effecteur RipG7 dans sa fonction de contribution au pouvoir pathogène de R. solanacearum sur la plante hôte M. truncatula. Ce travail nous a permis d'identifier les acides aminés de RipG7 qui sont sous sélection positive, et parmi ceux-là, ceux qui contribuent directement à la fonction de RipG7 sur M. truncatula. / The soil-borne pathogen Ralstonia solanacearum causes bacterial wilt in a broad range of plants. The type III secretion system (T3SS) and its associated type III effectors (T3Es) are the main virulence determinants of R. solanacearum. In my PhD study, to understand the mode of action of several "core" effectors (RipH2, RipH3, RipG7, RipG6) from R. solanacearum in host cells. We performed yeast two-hybrid screening of plant cDNA library to identify their protein targets. Besides, we also collaborated on the identification and characterization of a specific type III effector RipAX2 which is an avirulence factor that triggers a hypersensitive response in specific Eggplant lines. To understand which plant root cells are actually subjected to type III injection during the compatible interaction, I have generated transiently transformed Medicago truncatula lines (hairy root), expressing a host specificity and core T3E RipG7 in different root cell layers. When the transformed plant expressing RipG7 under 35S promoter, the plant can be infected and colonized by the ripG7 single mutant strain. The study could be refined by using specific root cell layer promoter to identify the root cell layers that are key players in this interaction. We also worked on the characterization of the structure-function of RipG7 from R. solanacearum. Our work revealed the genetic and functional variation of RipG7. Furthermore, positive selection study and mutagenesis analysis enabled us to identify essential functional residues which likely to have been differentially selected during the host-pathogen co-evolution. The potential plant targets of RipG7 were also studies further in our study by differential yeast two-hybrid.

Identiferoai:union.ndltd.org:theses.fr/2015TOU30385
Date05 October 2015
CreatorsWang, Keke
ContributorsToulouse 3, Peeters, Nemo
Source SetsDépôt national des thèses électroniques françaises
LanguageEnglish
Detected LanguageEnglish
TypeElectronic Thesis or Dissertation, Text

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