Dans ce travail, nous nous sommes intéressés à l’étude des infections à Anaplasmataceae chez les animaux et leurs tiques afin de caractériser au mieux ces infections animales et humaines et décrire de nouvelles espèces. Nous avons tout d’abord proposé un système de diagnostic moléculaire qui couple une qPCR suivie d’amplification et un séquençage ciblant le gène 23S ARNr. Puis, au long de ce travail, nous avons proposé d’autres amorces ciblant d’autres gènes incluant la sous unité ribosomal bêta (rpoB), la protéine du choc thermique (groEl), et le 16S ARNr. Notre objectif a été de sélectionner et d’identifier les différentes espèces impliquées ou non dans des pathologies chez les animaux et mettre en évidence leur vecteur. Au cours de ces travaux, nous avons eu accès à différents prélèvements de sang et des tiques en provenance de diverses régions du monde incluant la France métropolitaine et d’outre-mer, l’Algérie, le Niger, la Côte d’Ivoire, le Sénégal et le Pakistan. Nos investigations ont permis d’identifier différentes espèces d’Anaplasmataceae incluant de potentielles nouvelles espèces. Les prévalences rapportées dans chaque étude démontrent que les animaux sont les réservoirs de ces infections. Les recherches menées sur les tiques ont permis d’identifier de potentiels vecteurs d’Anaplasmataceae dans différentes régions du monde. Les potentielles nouvelles espèces identifiées sont caractérisées en ciblant différents gènes, et les analyses moléculaires démontrent qu’elles sont différentes des autres Anaplasmataceae connues jusqu’à maintenant. Ces différents travaux apportent donc davantage d’informations sur l’épidémiologie des Anaplasmataceae dans le monde. / In this work, we are interested in studying Anaplasmataceae infections in animals and their ticks. Our objective is to describe these infections in animals and to identify new species implicated in different pathology. First, we propose a molecular diagnostic approach that couples a qPCR followed by amplification and sequencing targeting the 23S rRNA gene. Then we propose other primers targeting other genes including the ribosomal subunit beta (rpoB), heat shock protein (groEl), and the 16S rRNA. Our goal was to screen and identify the different species involved, or not involved, in pathologies of animals and identify their vectors. During this work, we had access to different blood samples and ticks from different parts of the world including metropolitan France, France overseas, Algeria, the Republic of Niger, Côte d'Ivoire, Senegal and Pakistan. Our different investigations allowed to identify different species of Anaplasmataceae including potential new species. The prevalence reported in each study demonstrates that animals are the reservoirs of these infections. So, the research conducted on ticks has identified potential vectors of Anaplasmataceae in different regions of the world. Potentially new species were identified are characterized by different targeting genes. These studies provide further information on the epidemiology of Anaplasmataceae in the world.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:theses.fr/2017AIXM0202 |
| Date | 06 July 2017 |
| Creators | Dahmani, Mustapha |
| Contributors | Aix-Marseille, Fenollar, Florence, Mediannikov, Oleg, Davoust, Bernard |
| Source Sets | Dépôt national des thèses électroniques françaises |
| Language | French, English |
| Detected Language | French |
| Type | Electronic Thesis or Dissertation, Text |
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