Resumo: H. seropedicae foi estudado no contexto do metabolismo de fontes alternativas de nitrogênio. A provável existência de um gene do tipo nac no genoma deste organismo foi investigada. Para isso inicialmente caracterizamos o crescimento da estirpe mutante ntrC, DCP286A, em fontes alternativas de nitrogênio porque sabia-se através do estudo em outros organismos que o gene nac é dependente da proteína NtrC-P para sua expressão. Os resultados da análise fisiológica da utilização de fontes alternativas de nitrogênio mostraram a dependência parcial ou total da proteína NtrC-P para o catabolismo da uréia, Lalanina, L-serina e L-prolina. Um modelo de regulação foi proposto mostrando o provável envolvimento da proteína NtrC-P na utilização dessas fontes de nitrogênio. Uma pesquisa no banco de dados do Genopar indicou a presença de três prováveis proteínas do tipo Nac (Nacl, Nac2 e Nac3) e as análises comparativas revelaram que essas proteínas estão em regiões distintas do genoma. As seqüências de aminoácidos das proteínas do tipo Nac de H. seropedicae foram traduzidas e comparadas entre si e os dados revelaram apenas 7,8% de identidade e 23 % de similaridade. Estas seqüências foram também alinhadas com as ortólogas Nac de E. coli e K. aerogenes. Os dados revelaram maior identidade para a proteína do tipo Nacl (27% de identidade), seguida da Nac2 (22%) e Nac3 (16%). Essas proteínas são pertencentes à família LysR de reguladores transcricionais e apresentam um motivo hélice-voltahélice na região N-terminal que é o fragmento mais conservado dessas três proteínas e portanto, característica de todas LTTRs. A provável região promotora do gene do tipo Nacl foi clonada no vetor de transcrição pMP220 originando a fusão pnacl::/acZ. A análise da expressão de pnacl revelou que a proteína NtrCP não é um ativador da transcrição desse gene. Os resultados sugerem que as proteínas do tipo Nacl, Nac2 e Nac3 apresentam funções diferentes das proteínas Nac já estudadas e talvez e provavelmente sem envolvimento com o metabolismo de nitrogênio em H. seropedicae.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:dspace.c3sl.ufpr.br:1884/28707 |
| Date | 13 November 2012 |
| Creators | Gusso, Claudio Luiz |
| Contributors | Universidade Federal do Paraná. Setor de Ciencias Biológicas. Programa de Pós-Graduaçao em Ciencias Biológicas (Microbiologia, Parasitologia e Patologia Básica), Souza, Emanuel Maltempi de, 1964-, Klassen, Giseli |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Repositório Institucional da UFPR, instname:Universidade Federal do Paraná, instacron:UFPR |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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