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Dissertacao Final Giane Zupellari.pdf: 1538567 bytes, checksum: 99734d4093e76fed6d05c37113c7903d (MD5)
Previous issue date: 2008-08-01 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / Human rotavirus constitutes one of the most important causes of diarrheic disease in children less than five years in the whole world. With the objective of verifying the occurrence of genotypes of human rotavirus in children of 1 the 36 months residents in the city of Manaus
in Amazon, had been analyzed during the years from 2004 to 2006, a total of 607 the feces diarrheic samples that had been collected of children attended hospital of children in the city of Manaus. This analyzes was carried through by the detention of the viral genome through the techniques of EGPA (electrophoresis in gel of polyacrylamide), and RT-PCR (reaction in chain of polymerases associated to the reaction of reversal transcriptase). Through the EGPA
method can be observed a positivity of 25% of the human rotavirus samples. All of the positive samples for rotavirus had been genotyped by the method of RT-PCR with use of
specific primers for genotypes G (G1, G2, G3, G4 and G9) and genotypes P (P[8], P[4], P[6], P[9] and P[10]). By the genotyping, it was detected genotype G in 30,7% of the positive samples for rotavirus, with predominance of the G2 genotypes (17%), followed of G1 (14.9%) and G9 (10.6%) and genotype P in 44,7% of the positive samples for rotavirus, with predominance of genotypes P[8] in 66,2% of samples and P[4] in 13,2% of the samples. The
combinations of genotypes G and P had been responsible for 53,3% of the positive samples for rotavirus, being that P[8]G1 and P[4]G2 had been found with 12,5% and 10%
consecutively, followed of P[8]G3 (5%). Other combinations as P[4]G1, P[8]G9 and P[10]G1 had been also found in less expressive numbers. It was observed that 38.3% of the
positive samples for genotype G and 11.7% of the positive samples for genotype P had not presented characteristics for none of searched genotypes G and P. The number positive
samples for human rotavirus, as well as for genotypes G and genotypes P had been similar in such a way in children of the masculine sex, how much in children of the feminine sex, being
that these samples had predominated in children less than 18 months. The positive samples for human rotavirus, as well as for genotypes G and genotype P had been found in every
month of the years of had lasted the study. The east zone of the city of Manaus was where they had been found the biggest number of positive samples for rotavirus, as well as for
genotype G and genotype P. The children with positive samples for rotavirus had presented on average of 10 episodes of diarrhea for child per day with predominance for the feces of liquid aspect (86.2%), this profile also was observed in the children with positive samples for
genotypes G and genotypes P. With exception of the hyperthermia, other signals and characteristic symptoms of the diarrheic disease for rotavirus as vomit, dehydration and
abdominal pain, had been presents in the biggest parcel of the children with positive samples in such a way for human rotavirus as for genotype G, as for genotype P. The high number of samples that had not been tipadas with use of specific primers for genotypes G and P, suggest the circulation of uncommon genotypes in the region, however so that this situation is defined, new studies of the epidemiological molecular of rotavirus circulating in Manaus,
Amazon, must be developed, enclosed specific primers also for detention of rotavirus of animal origin. / Os rotavírus humano constituem uma das mais importantes causas de doença diarréica em crianças menores de cinco anos em todo o mundo. Com o objetivo de verificar a ocorrência de genótipos de rotavírus humano em crianças de 1 a 36 meses residentes no município de Manaus no Amazonas, foram analisadas durante os anos de 2004 a 2006, um total de 607 amostras de fezes diarréica que foram coletadas de crianças atendidas em prontos socorros
infantis do município de Manaus. Esta análise foi realizada pela detecção do genoma viral através das técnicas de EGPA (eletroforese em gel de poliacrilamida) e RT-PCR (reação de
polimerase em cadeia com transcriptase reversa). Através do método de EGPA pode-se observar uma positividade de 25% das amostras para rotavírus humano. Todas as amostras
positivas para rotavírus foram genotipadas pelo método de RT-PCR com utilização de primers específicos para os genótipos G (G1, G2, G3, G4 e G9) e genótipos P (P[8], P[4], P[6], P[9] e
P[10]). Pela genotipagem foi detectado o genótipo G em 30,7% das amostras positivas para rotavírus, com predominância dos genótipos G2 (17%), seguidos de G1 (14,9%) e G9 (10,6%) e o genótipo P em 44,7% das amostras positivas para os rotavírus, com predominância dos genótipos P[8] em 66,2% das amostras e P[4] em 13,2% das amostras. As combinações dos genótipos G e P foram responsáveis por 53,3% das amostras positivas para rotavírus, sendo que P[8]G1 e P[4]G2 foram as mais encontradas com 12,5% e 10%
consecutivamente, seguidas de P[8]G3 (5%). Outras combinações como P[4]G1, P[8]G9 e P[10]G1 também foram encontradas em números menos expressivos. Foi observado que 38,3% das amostras positivas para o genótipo G e 11,7% das amostras positivas para o genótipo P não apresentaram características para nenhum dos genótipos G e P pesquisados. O número amostras positivas para rotavírus humano, bem como para os genótipos G e para os genótipos P foram semelhantes tanto em crianças do sexo masculino, quanto em crianças do sexo feminino, sendo que estas amostras predominaram em crianças menores de 18 meses. As
amostras positivas para rotavírus humano, assim como para os genótipos G e para o genótipo P foram encontradas em todos os meses do estudo. A zona leste da cidade de Manaus foi onde foram encontradas o maior número de amostras positivas para rotavírus, assim como para o genótipo G e para o genótipo P. As crianças com amostras positivas para rotavírus apresentaram em média de 10 episódios de diarréia por criança por dia com predominância para os fezes de aspecto líquido (86,2%). Este perfil também foi observado nas crianças com amostras positivas para os genótipos G e para os genótipos P. Com exceção da hipertermia, outros sinais e sintomas característicos da doença diarréica por rotavírus como vômito, desidratação e dor abdominal, estiveram presentes na maior parcela das crianças com amostras positivas para os rotavírus humano, para o genótipo G e para o genótipo P. O número elevado de amostras que não foram tipadas com utilização de primers específicos para
os genótipos G e P sugerem a circulação de genótipos incomuns na região, porém para que esta situação seja definida, novos estudos da epidemiologia molecular dos rotavírus circulantes em Manaus, Amazonas, devem ser desenvolvidos, incluindo inclusive primers específicos para detecção de rotavírus de origem animal.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:http://localhost:tede/3646 |
| Date | 01 August 2008 |
| Creators | Santos, Giane Zupellari dos |
| Contributors | Costa, Cristóvão Alves da |
| Publisher | Universidade Federal do Amazonas, Programa de Pós-Graduação em Patologia Tropical, UFAM, BR, Faculdade de Medicina |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | English |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM, instname:Universidade Federal do Amazonas, instacron:UFAM |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
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