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Previous issue date: 2009-03-04 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / The Amazon is characterized primarily by having two major ecosystems, the
flooding and no flooding, which is covering the land where it is anthropogenic
archaeological sites caused by human action from pre-Columbian peoples of
Amazon, rich in organic matter with high nutrient content, which provides a
favorable habitat for microbial community can or can’t shows vast diversity of
microbial populations in natural environments and until this moment was not
disclosure and make use of sequences of 16S rRNA gene directly from the
environment has be possible to estimate this diversity. Facing this, the objective
of this study was to construct four libraries 16S rRNA from soils Anthropogenic
Dark Earth (TPBact e TPArch) and adjacente soil (TABact e TAArch), to
compare biodiversity of Bacteria Domain and Archaea Domain between these
two environments. Were selected 960 clones to Bacteria Domain and 672
clones to Archaea Domain and were compared using databases of Genbank
(NCI-USA) and RDP-II program. Data analyses indicated prodominace of
microoganims unknown from 38% among the sequences from TPBact, 58%
from TABact, and 52% from TPArch and 49% from TAArch. The phylum
founded for libraries to Domain Bacteria was: Acidobacteria (20% TPBact and
33
11% TABact); Nitrospira (8% TPBact and 1% TABact); Firmicutes (7% TPBact
and 3% TABact); Actinobacteria and Alphaproteobacteria (5% TPBact and 4%
TABact); Proteobacteria (5% TPBact and 2% TABact); Sphigobacteria (2%
TPBact and 5% TABact) and 4% Gammaproteobacteria in both libraries. For
Archeae Domain were found just two phylum, Crenarcheota (40% TPArch and
46% TAArch) e Euryarcheota (8% TPArch and 5% TAArch). Overall values
obtaind from Simpson and shannon indexes for library Bacteria Domain of Dark
Earth and Mulata showed greater diversity in this soil, while it doesn’t occur to
Archaea libraries, perhaps because they are poorly described in literature. This
study aimed to contribute with knowledge about variety of Bacteria Domain, with
great diversity of Filos and Archaea Domain, a group still needs to be further
studied, mainly in Amazonian soil, with its ecological significance and
biotechnological / A Amazônia caracteriza-se por apresentar dois ecossistemas principais,
os inundáveis e os não-inundáveis, sendo que este engloba a terra firme onde
encontra-se os sítios arqueológicos antropogênicos originados pela ação
humana de povos pré-colombianos da Amazônia. Este solo é rico em matéria
orgânica e com alto teor de nutrientes, o que proporciona um habitat favorável
a comunidade microbiana, podendo ou nao demonstrar uma imensa
diversidade microbiana em ambientes naturais que ainda encontra-se por ser
desvendada, e a utilização de seqüências do gene 16S rRNA diretamente
nestes ambientes tem tornado possível estimar essa diversidade. Diante disto,
o objetivo deste trabalho foi construir quatro bibliotecas 16S rRNA de solos de
Terra Preta de Índio (TPBact e TPArch) e Adjacente (TABact e TAArch),
visando comparar a biodiversidade do Domínio Bacteria e do Domínio Archaea
entre estes dois tipos de solos. Foram selecionados 960 clones para o Domínio
Bacteria e 672 clones para o Domínio Archaea e foram comparados usando os
bancos de dados do NCBI (BLAST) e RDP-II. Os resultados mostraram o
predomínio de microrganismos desconhecidos e ou não-cultivados
representando 38% em TPBact, 58% em TABact, 52% em TPArch e 49% em
TAArch. Os Filos encontrados para as bibliotecas do Domínio Bacteria foram:
Acidobacteria (20% em TPBact e 11% TABact); Nitrospira (8% TPBact e 1%
32
em TABact); Firmicutes (7% TPBact e 3% TABact); Actinobacteria e
Alphaproteobacteria (5% TPBact e 4% TABact); Proteobacteria (5% TPBact e
2% TABact); Sphigobacteria (2% TPBact e 5% TABact) e por fim, 4% de
Gammaproteobacteria em ambas as bibliotecas. Para o Domínio Archaea
foram encontrados apenas dois Filos, Crenarcheota (40% TPArch e 46%
TAArch) e Euryarcheota (8% TPArch e 5% TAArch). De um modo geral, os
valores obtidos pelos índices de Simpson e Shannon para a biblioteca do
Domínio Bacteria de Terra Preta e Mulata, nos mostraram uma maior
diversidade netes solos, enquanto isso não ocorre para as bibliotecas de
Archaea, talvez porque estas últimas sejam pouco descritas na literatura. Este
trabalho visou contribuir com o conhecimento sobre a diversidade do Domínio
Bacteria, com sua grande diversidade de Filos, e do Domínio Archaea, um
grupo que ainda precisa ser mais estudado, principalmente nos solos
amazônicos, com sua importância ecológica e biotecnológica
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:http://localhost:tede/4943 |
| Date | 04 March 2009 |
| Creators | Silva, Luciana Batista da |
| Contributors | Leomil, Luciana, Astolfi Filho, Spartaco |
| Publisher | Universidade Federal do Amazonas, Programa de Pós-graduação em Diversidade Biológica, UFAM, Brasil, Instituto de Ciências Biológicas |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM, instname:Universidade Federal do Amazonas, instacron:UFAM |
| Rights | info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | 3867939861266202433, 600 |
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