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Previous issue date: 2016-07-21 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / Early detection of resistance to drugs used to treat tuberculosis (TB) from Mycobacterium
tuberculosis isolates, represent a challenge to Tuberculosis Control Program (TCP), because
most antimicrobial susceptibility testing needs bacillus isolation in growth medium.
Molecular methods have greater possibilities for rapid determination of resistance, they aim to
detect mutations in M. tuberculosis genes associated with antimicrobial resistance and have
promising results for Isoniazid and Rifampin, which are the major drugs of basic therapeutic
regimen for TB treatment. This study evaluated the performance of PCR assay in Real Time
(qPCR), directly by sputum samples and cultivation of strains isolated from patients with
pulmonary tuberculosis multibacillar from Polyclinic Cardoso Fontes. 171 samples were
analyzed by qPCR, targeting genes: katG, inhA and rpoB and the results were compared using
the Nitrate Reductase Method (MNR). The resistance frequency for the evaluated samples
was 9.36 % for Isoniazid , 5.85% for Rifampin and 4.09 % for both drugs. The katG and rpoB
genes were associated with resistance to Isoniazid (p = 0.0001, 95% CI 3.61 to 21.01) and to
Rifampin (p = 0.0001, 95% CI 6.34 to 51.05), respectively . The inhA gene was not associated
with resistance to Isoniazid. There was acceptable agreement between phenotypic assay,
MNR, and qPCR (sputum samples) for mutation detection for katG genes (kappa index:
0.4097) and rpoB (kappa index: 0.4985). The selected genes katG and rpoB were associated
with resistance to Isoniazid and Rifampacina respectively, although the qPCR has had
underperformed the MNR in this study. However, the molecular tests continue as promising
targets for achieving faster results. In this context , optimizations in molecular testing should
be performed to allow faster and more reliable diagnostics for resistance to anti -TB drugs and
thus provide an appropriate treatment for the patient and reduce the transmission of TB. / A detecção precoce de resistência aos medicamentos utilizados no tratamento da tuberculose
(TB), a partir de isolados de Mycobacterium tuberculosis, representa um desafio aos
Programas de Controle de Tuberculose (PCT), pois a maioria dos testes de sensibilidade aos
antimicrobianos necessita do isolamento do bacilo em meio de cultivo. Os métodos
moleculares apresentam maiores possibilidades de determinação rápida da resistência, eles
visam detectar mutações em genes de M. tuberculosis associados à resistência aos
antimicrobianos e possuem resultados promissores para Isoniazida e Rifampicina, que são os
principais fármacos do esquema terapêutico básico de tratamento da TB. O presente estudo
avaliou o desempenho do ensaio PCR em Tempo Real (qPCR), diretamente de amostras de
escarro e de isolados de cultivo de pacientes com TB pulmonar multibacilares, oriundos da
Policlínica Cardoso Fontes. Foram analisadas 171 amostras por qPCR, tendo como alvo os
genes: katG, inhA e rpoB e os resultados comparados com o Método de Nitrato Redutase
(MNR). A frequência de resistência para as amostras avaliadas foi de 9,36% para Isoniazida,
5,85% para Rifampicina e 4,09% para ambos os fármacos. Os genes katG e rpoB foram
associados a resistência a Isoniazida (p=0,0001; IC95% 3,61 a 21,01) e a Rifampicina
(p=0,0001; IC95% 6,34 a 51,05), respectivamente. O gene inhA não apresentou associação a
resistência a Isoniazida. Houve concordância aceitável entre ensaio fenotípico, MNR, e o
qPCR (de amostras de escarro) para a detecção da mutação para os genes katG (Índice kappa:
0,4097) e rpoB (Índice kappa: 0,4985). Os genes selecionados katG e rpoB foram associados
a resistência a Isoniazida e Rifampacina respectivamente, embora a qPCR tenha tido um
desempenho inferior ao MNR neste estudo. Todavia, os testes moleculares continuam como
alvos promissores para obtenção de resultados mais rápidos. Neste contexto, otimizações nos
testes moleculares devem ser realizadas, para permitir diagnósticos mais rápidos e confiáveis
para resistência aos fármacos anti-TB e, desta forma, proporcionar um tratamento adequado
ao paciente e reduzir a transmissão da TB.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:http://localhost:tede/5475 |
| Date | 21 July 2016 |
| Creators | Neves, Suelen Ennes das |
| Contributors | Sadahiro, Aya, Souza, João Vicente Braga de, Garrido, Marlúcia da Silva |
| Publisher | Universidade Federal do Amazonas, Programa de Pós-graduação em Ciências Farmacêuticas, UFAM, Brasil, Faculdade de Ciências Farmacêuticas |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM, instname:Universidade Federal do Amazonas, instacron:UFAM |
| Rights | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/, info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | -8773172453627126821, 500 |
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