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Previous issue date: 2013-09-30 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The human gastroenteritis are among the diseases of greatest public health impact
worldwide. There are several etiologic agents of diarrhea, with emphasis rotavirus, viral
pathogen prominently in the genesis of severe acute gastroenteritis in childhood, accounting
for over 450,000 deaths in children worldwide. The rotavirus genome consists of a 11
segment of double stranded RNA encoding six structural proteins (VPs) and five nonstructural
proteins (NSPs). Classification of rotavirus serotypes and genotypes is based on
the epitopes of the glycoprotein VP7 neutralized, called G, and VP4 protease-sensitive
protein called P, which generates a binary classification scheme G and P. Epidemiological
studies of molecular characterization of genes encoding for proteins of rotavirus are
essential for assessing the effectiveness of the vaccine Rotarix (GlaxoSmithKline), introduced
in Brazil since 2006, in addition to assessing the possible emergence of new viral genotypes.
The aim of this study was to identify and characterize genes of rotavirus in feces of children
with diarrhea in Manaus between the years 2007 and 2008. 1337 samples were collected
from diarrheal children under 10 years old in the city of Manaus, between the years 2007
and 2008. There was a percentage of 5.4% of positive samples for rotavirus. Viral genotypes
were identified through polymerase chain reactions preceded by reverse transcription. The
genotype G2P[4] was found in 93% of cases, followed by G [NT-untyped] P4 in 6% and
G2P[9] 1% of the samples. Among the 73 samples detected in this study, 58 were eligible for
the current vaccine. Phylogenetic analysis revealed a pattern of clustering of gene sequences
into clusters that showed similarity with samples from Belém (Brazil) and China. / As gastrenterites humanas estão entre as doenças de maior impacto na saúde pública
ao nível mundial. São diversos os agentes etiológicos causadores da diarreia, merecendo
destaque o rotavírus, patógeno viral proeminente na gênese de gastrenterite aguda grave na
infância, sendo responsável por mais de 200 mil mortes de crianças em todo o mundo. O
rotavírus é constituído por um genoma de 11 segmentos de RNA dupla fita que codificam 6
proteínas estruturais (VPs) e 6 proteínas não-estruturais (NSPs). A atual classificação dos
rotavírus tem base na caracterização gênica dos 11 segmentos virais para a identificação de
seus respectivos genótipos, designados em conjunto como genótipos de constelação. A
vigilância epidemiológica que inclui a caracterização molecular é uma importante
ferramenta para o estudo da dinâmica de variações das cepas diante de fatores evolutivos
como a implementação da vacina Rotarix (GlaxoSmithKline), introduzida no Brasil desde
2006. A finalidade deste estudo foi realizar análises epidemiológicas, detecção e
caracterização de genes de rotavírus que infectaram crianças com até 10 anos de idade,
atendidas em hospitais públicos de Manaus entre os anos de 2007 e 2008. Foram coletadas
1337 amostras diarreicas. Observou-se um percentual de 5,4 % de positividade para
rotavírus. Foram identificados os genótipos virais através das reações em cadeia pela
polimerase precedida da transcrição reversa. O genótipo G2P[4] foi encontrado em 93% dos
casos, seguido do G[NT-não tipado]P4 em 6% e G2P[9] em 1% das amostras. Dentre as 73
amostras detectadas nesta pesquisa, 58 eram elegíveis à atual vacina. As análises
filogenéticas revelaram um padrão de agrupamento das sequências gênicas em clusters que
apresentaram similaridade com amostras provenientes de Belém (Brasil) e da China.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:http://localhost:tede/6074 |
| Date | 30 September 2013 |
| Creators | Balieiro, Karen Campos, 92-3236-1756 |
| Contributors | ppgiba@ufam.edu.br, Orlandi, Patrícia Puccineli, Soares, Leidiane Amorim |
| Publisher | Universidade Federal do Amazonas, Programa de Pós-graduação em Imunologia Básica e Aplicada, UFAM, Brasil, Instituto de Ciências Biológicas |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFAM, instname:Universidade Federal do Amazonas, instacron:UFAM |
| Rights | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/, info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | 8851295382702565619, 600, 500, 1984485651082134923 |
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