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Previous issue date: 2016-08-23 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas - FAPEAM / Malaria in Brazil occurs especially in the Amazon (99% of cases), where
environmental conditions are favorable for the proliferation of the etiologic and their
mosquito vectors agents, whose main transmitter is the Anopheles darlingi.
Environmental factors and human activities are some of the main aspects that
contribute to the adaptive and evolutionary process that anopheles, which can be
reflected in chromosomal rearrangements. We carried out the physical chromosome
mapping by fluorescence in situ hybridization (FISH) of inume response genes in the
genome of A. darlingi, GNBP (Gran-negative binding protein), Toll-interacting protein
(Toll), defensin, Chymotrypsin-like serine protease (AdChyL), 28S ribosomal protein
S7- mitochondrial precursor (RpS7), gambicin anti-microbial peptide (gambicin) and
also the gene sensory response: OBP (odorant binding protein) to assist in more
precise assembly of its structural genomics. These genes have been mapped in
single chromosomal regions, with the exception of RpS7, which mapped in more than
one location. Other genes have been mapped in inversion regions: GNBP (inversion
2 Rd); AdChyL in the region 38D (inversion 3Lb) and RpS7 in 22C region (inversion
2Lb). The OBP gene mapped the X chromosome from five locations individuals,
where only A. darlingi of São Gabriel da Cachoeira/AM (SGC/AM) OBP gene marked
the region 3A compared to four locations Coari/AM, Manaus/AM, Barra do
Bugres/MT and Macapá/AP, where the probe mapped the region 4A. Two new
investments were described for A. darlingi and one on chromosome X (Xb) in the
population of SGC/AM and another in the arm 2L (2LC), population Bugres/MT.
Geographical distances and ecoregions (geographical barriers) are environmental
factors that can favor the appearance of the two new inversions described in this
work. In the phylogenetic analysis of GNBP genes Toll, defensin, RpS7 and
gambicin, we obtained three clades for GNBP and most of the analyzed sequence
was homologous to the subfamily B, including GNBP Anopheles gambiae (87%),
suggesting that GNBP A . darlingi belongs to the subfamily B. Phylogenetic trees for
RpS7 genes, gambicin, defensin and Toll showed a high degree of conservation
between these genes in A. gambiae and Anopheles arabiensis. Immune response
genes of A. darlingi and Anopheles albimanus are phylogenetically close but not
always a reliable support. This may suggest some level of evolutionary conservation
of the genes of the immune response of both species. The genes mapped in situ
were considered cytogenetic useful markers for chromosomal variability studies and
developments in A. darlingi as they are conserved genes, and assist in the
improvement of sequence analyzes not finalized the assembly and annotation of the
genome of A. darlingi. / A malária no Brasil ocorre especialmente na Amazônia (99% dos casos), onde as
condições ambientais são favoráveis para a proliferação dos agentes etiológicos e
de seus mosquitos vetores, cujo principal transmissor é o Anopheles darlingi.
Fatores ambientais e atividades antrópicas são alguns dos principais aspectos que
contribuem para o processo adaptativo e evolutivo desse anofelino, o que pode ser
refletido em rearranjos cromossômicos. Neste trabalho, realizamos o mapeamento
físico cromossômico por hibridização in situ fluorescente (FISH) dos genes de
resposta inume do genoma de A. darlingi, GNBP (Gran-negative binding protein),
Toll-interacting protein (Toll), defensina, Chymotrypsin-like serine protease (AdChyL),
28S ribosomal protein S7- mitochondrial precursor (RpS7), gambicin anti-microbial
peptide (gambicina) e ainda, o gene de resposta sensorial: OBP (odorant
binding protein), para auxiliar na montagem mais precisa do seu genoma estrutural.
Esses genes foram mapeados em regiões cromossômicas únicas, com exceção do
RpS7 que mapeou em mais de um local. Outros genes foram mapeados em regiões
de inversão: GNBP (inversão 2Rd); AdChyL, na região 38D (inversão 3Lb) e RpS7,
na região 22C (inversão 2Lb). O gene OBP mapeou o cromossomo X de indivíduos
de cinco localidades, onde apenas A. darlingi de São Gabriel da Cachoeira/AM
(SGC/AM) o gene OBP marcou na região 3A em comparação com as quatro
localidades Coari/AM, Manaus/AM, Barra do Bugres/MT e Macapá/AP, onde a
sonda mapeou a região 4A. Duas novas inversões foram descritas, para A. darlingi
sendo uma no cromossomo X (Xb) na população de SGC/AM e outra no braço 2L
(2Lc), população de Barra do Bugres/MT. Distâncias geográficas e ecoregiões
(barreiras geográficas) são fatores ambientais que podem favorecer o aparecimento
das duas novas inversões descritas nesse trabalho. Na análise filogenética dos
genes GNBP, Toll, defensina, RpS7 e gambicina, obtivemos três clados para GNBP
e a maioria das sequências analisadas foi homóloga com a da subfamília B,
incluindo GNBP de Anopheles gambiae (87%), sugerindo, que GNBP de A. darlingi
pertence à subfamília B. As árvores filogenéticas para os genes RpS7, gambicina,
defensina e Toll mostraram um alto grau de conservação entre esses genes em A.
gambiae e Anopheles arabiensis. Os genes de resposta imune de A. darlingi e
Anopheles albimanus são filogeneticamente próximos, mas nem sempre com um
suporte confiável. Isso pode sugerir algum nível de conservação evolutiva entre os
genes de resposta imune de ambas as espécies. Os genes mapeados in situ foram
considerados marcadores citogenéticos úteis aos estudos de variabilidade
cromossômica e evolução em A. darlingi já que são genes conservados, além de
auxiliar no aprimoramento das análises de sequências não finalizadas na montagem
e anotação do genoma de A. darlingi.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:localhost:tede/2242 |
| Date | 23 August 2016 |
| Creators | Bridi, Letícia Cegatti |
| Contributors | Rafael, Míriam Silva |
| Publisher | Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, Genética, Conservação e Biologia Evolutiva (GCBEv), INPA, Brasil, Coordenação de Pós Graduação (COPG) |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | Portuguese |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações do INPA, instname:Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia, instacron:INPA |
| Rights | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/, info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | -5829914500254207356, 600, 600, 600, 3806999977129213183, -4671505905809893211 |
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