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Expressão gênica e haplótipos de genes envolvidos na sinalização celular e o risco para carcinoma hepatocelular

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Previous issue date: 2016-12-07 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - FAPESP / Background - Hepatocellular carcinoma (HCC) is highlighted as the most aggressive
malignant liver tumor. The identification of candidate genes to become biomarkers may
help to clarify the pathophysiology of HCC, as well as the diagnosis of the disease at
early stage, leading to new therapeutic interventions. Objectives -To evaluate the
association of genetic variants and the gene expression involved in the cell signaling
process, apoptosis, and angiogenesis with HCC, to characterize risk subgroups and
identify biological markers for early diagnosis, prognosis and treatment of the disease.
Casuistics and Methods – We studied 343 subjects, 102 with HCC (SG = study group)
and 215 controls (CG = control group) for the analysis of PTEN polymorphisms
(rs10490920, rs532678 and rs701848) and VEGF-A (rs3025039 and rs1570360). For
gene expression analysis of PTEN and PIK3CA, 24 patients with HCC were selected
(SGge = Study Group of gene expression), 16 with cirrhosis (CiGge = Cirrhosis Group
of gene expression) and 10 controls who underwent bileo and digestive surgery (CGge
= Group control of gene expression). The polymorphisms of related genes were
analyzed by PCR/RFLP (polymerase chain reaction/restriction fragments length
polymorphism), while the gene expression (fresh liver tissue) by qPCR
(quantitative/polymerase chain reaction). Data from the clinical profile, lifestyle and
comorbidities were obtained from medical records and questionnaire. Alpha error level
was set at 5%. Results - Male gender, advanced age, smoking, alcohol consumption
and diabetes mellitus (DM) prevailed in the group with HCC compared to the control
(P<0.05). Genetic polymorphisms: PTEN- rs10490920 - The T/T genotype was noted in
both groups followed by T/C, and the T allele (P>0.05). PTEN- rs532678- The genotype T/C was the most common in both groups, followed by C/C, and the C allele was
predominant in GE compared to control group (P>0.05). PTEN- rs701848- The
genotype C/C was highlighted in SG compared to CG, followed by T/T, and the T allele
(P>0.05). VEGF-A- rs3025039- The C/C genotype is distinguished in both groups
(P>0.05), the same occured for the C allele (P = 0.4226). VEGF-A- rs1570360 – G/G
genotype prevailed in both groups (P>0.05), as well as the G allele (P=0.6387).
Although similarity between the groups for genotypic and allelic distribution was
observed, mutant PTEN and VEGF-A alleles prevailed in patients with HCC and
tobacco and alcohol consumption, compared to the control group (P <0.05). PTEN and
VEGF haplotype analysis was similar among the groups (P>0.05). Gene expression -
PTEN expression levels was decreased in patients with HCC (median= 0,908) compared
to cirrhotic patients (median = 5.93, P=0.0347). PIK3CA expression levels (median-
HCC= 0,108; cirrhosis= 0,493) were similar between groups (P> 0.05). Conclusion –
PTEN and VEGF-A genetic variants, as well as their haplotypes were not associated to
HCC. Reduced gene expression of PTEN in tumor tissue can be associated with HCC,
while PIK3CA does not differentiate between patients with HCC from those with
cirrhosis. It stands out as independent risk factors for HCC, smoking, alcohol
consumption, male sex, advanced age and DM. PTEN and VEGF-A mutant alleles,
particularly in the presence of smoking and alcohol consumption may enhance the risk
for HCC. / Introdução - O carcinoma hepatocelular (CHC) destaca-se como o mais agressivo
tumor maligno do fígado. A identificação de genes candidatos a biomarcadores pode
contribuir para esclarecer a fisiopatologia do CHC e auxiliar no diagnóstico precoce da
doença com novas intervenções terapêuticas. Objetivos - Avaliar a associação de
variantes genéticas e expressão gênica envolvidas no processo de sinalização celular,
apoptose e angiogênese com CHC, visando caracterizar subgrupos de risco e identificar
marcadores biológicos para diagnóstico precoce, prognóstico e tratamento da doença.
Casuística e Métodos – Foram estudados 343 indivíduos, sendo 102 com CHC (GE=
Grupo de estudo) e 215 controles (GC= Grupo controle) para a análise dos
polimorfismos de PTEN (rs10490920, rs532678, rs701848) e VEGF-A (rs3025039 e
rs1570360). Para a análise de expressão gênica de PTEN e PIK3CA, foram selecionados
24 pacientes com CHC (GEeg= Grupo de estudo da expressão gênica), 16 com cirrose
(GCieg= Grupo cirrose da expressão gênica) e 10 controles submetidos a cirurgias
bileo-digestivas (GCeg= Grupo controle da expressão gênica). Os polimorfismos dos
referidos genes foram analisados por PCR/RFLP (polymerase chain reaction/restriction
fragments lengh polymorphism), enquanto a expressão gênica (tecido hepático fresco)
por qPCR (quantitative/polymerase chain reaction). Dados do perfil clínico, hábitos de
vida e comorbidades foram obtidos em prontuário médico e questionário. Admitiu-se
erro α de 5%. Resultados - O gênero masculino, idade avançada, tabagismo, etilismo e
diabetes mellitus (DM) prevaleceram no grupo com CHC, comparado ao controle
(P<0,05). Polimorfismos genéticos: PTEN- rs10490920- O genótipo T/T destacou-se em
ambos os grupos, seguido de T/C, assim como o alelo T (P>0,05). PTEN- rs532678- O
genótipo T/C foi o mais frequente em ambos os grupos, seguido de C/C, assim como o
alelo C predominou em GE comparado a GC (P>0,05). PTEN- rs701848- O genótipo
T/C destacou-se em GE compado a GC, seguido de T/T, assim como o alelo T (P>0,05).
VEGF-A- rs3025039- O genótipo C/C destacou-se em ambos os grupos (P>0,05), o
mesmo ocorreu para o alelo C (P=0,4226). VEGF-A- rs1570360 – O genótipo G/G
prevaleceu em ambos os grupos (P>0,05), assim como o alelo G (P=0, 6387). Embora
detectada semelhança entre os grupos para distribuição genotípica e alélica, alelos
mutantes de PTEN e VEGF-A prevaleceram em pacientes com CHC e hábitos tabagista
e etilista, comparado ao controle (P<0,05). A análise de haplótipos de PTEN e VEGF-A
mostrou semelhança entre os grupos (P>0,05). Expressão gênica- Houve diminuição
dos níveis de expressão de PTEN em pacientes com CHC (mediana= 0,908) comparado
aos cirróticos (mediana= 5,93; P= 0, 0347). Níveis de expressão de PIK3CA (mediana-
CHC=0,108; cirrose= 0,493) foram semelhantes entre os grupos (P>0,05). Conclusão –
Variantes genéticas de PTEN e VEGF-A, assim como seus haplótipos, não se associam
ao CHC. Expressão gênica reduzida de PTEN no tecido tumoral hepático pode estar
associado a CHC, enquanto PIK3CA não diferencia pacientes com CHC daqueles com
cirrose. Destacam-se como fatores de risco independentes para CHC tabagismo,
etilismo, sexo masculino, idade avançada e DM. Alelos mutantes de PTEN e VEGF-A,
particularmente na presença de tabagismo e etilismo podem potencializar o risco para
CHC.

Identiferoai:union.ndltd.org:IBICT/oai:localhost:tede/407
Date07 December 2016
CreatorsGraciele Domitila, Tenani
ContributorsDorotéia Rossi Silva, Souza, William José, Duca, Ana Elizabete, Silva
PublisherFaculdade de Medicina de São José do Rio Preto, Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde, FAMERP, Brasil, Faculdade 1::Departamento 1
Source SetsIBICT Brazilian ETDs
LanguagePortuguese
Detected LanguageEnglish
Typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis
Formatapplication/pdf
Sourcereponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da FAMERP, instname:Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, instacron:FAMERP
Rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
Relation-6954410853678806574, 500, 500, 600, 600, 306626487509624506, 8765449414823306929, -6491868300948288337

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