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Previous issue date: 2014-02-25 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The Common bacterial blight caused by Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli (Xap) and
Xanthomonas fuscans subsp. fuscans (Xff), is one of most important bacterial etiology diseases from
the common bean plant. This pathogen causes a great loss in the production, mainly in the “water”
harvest, when the environmental conditions are helpful to the development of this disease and to its
dissemination. Among the strategies about integrated handling of diseases, the genetic resistance is the
main measure of control and, for obtaining some cultivate with lasting resistance and of notorious
specter, it is important to the know the genetic pathogen diversity. The present work has the goal of
studying the diversity and the genetic structure around and inside the population of Xap and Xff using
the markers rep-PCR; to connect the genetic pathogen diversity with its geographical distribution inside
Brazilian producing common bean plant regions. There were obtained 42 Xap and Xff isolated and four
Xanthomonas isolated not pathogens of to the bean plant, originated in the States of São Paulo, Goiás,
Paraná and Rio Grande do Sul. The genetic profiles obtained by primers BOX, ERIC and REP
produced 12 haplotipes matched (HC), where the HC 3, specific xff, was more frequent in PR and GO,
and was not found in RS. The dendrogram produced through the analysis showed that Xap, Xff and
isolated not pathogens are genetically different. In the analysis of genetic structure, the total genetic
diversity (Ht), among three populations was 0,2385 revealing that there was variability from a
population to the other one. Higher values of the Shannon rate (0,3648) show that Xap population is
more different genetically. From a total of 51 locos, 94,12 % are polymorphic, inside Xap population
they are all polymorphicand inside Xff, only 18,18 % are polymorphic. The genetic differentiation
coefficient (Gst = 0,5194) revealed diversity inside and among the patogenic populations, confirming
AMOVA’s result, where 51,98 % of the diversity was among the populations and 48,06 % inside them.
Then, the technique helped how to find differences between Xap and Xff and measure the values of
genetic diversity among and inside populations. The results of this study give us much information
about the pathogens diversity, which is considered useful to identify and to characterize the resistant
germoplasm in a more efficient way. / O crestamento bacteriano comum, causado por Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli (Xap) e
Xanthomonas fuscans subsp. fuscans (Xff), é uma das doenças de etiologia bacteriana mais importantes
do feijoeiro-comum. Este patógeno provoca grandes perdas na produção, principalmente na safra das
“águas”, quando as condições ambientais são favoráveis ao desenvolvimento da doença e à
disseminação do patógeno. Dentro das estratégias do manejo integrado de doenças, a resistência
genética é a principal medida de controle, e para a obtenção de cultivares com resistência duradoura e
de amplo espectro é necessário o conhecimento da diversidade genética do patógeno. O presente
trabalho teve como objetivos, estudar a diversidade e a estrutura genética entre e dentro das populações
de Xap e Xff usando marcadores rep-PCR; relacionar a diversidade genética do patógeno com sua
distribuição geográfica dentro das regiões produtoras de feijoeiro-comum no Brasil. Foram obtidos 42
isolados de Xap e Xff, e quatro isolados de Xanthomonas não patogênicas ao feijoeiro, oriundos dos
estados de São Paulo, Goiás, Paraná e Rio Grande do Sul. Os perfis genéticos obtidos pelos primers
BOX, ERIC e REP geraram 12 haplótipos combinados (HC), em que o HC 3, específico de Xff, foi
mais frequente nos estados do PR e GO , porém não foi identificado no RS. O dendrograma gerado
através da análise conjunta mostrou que Xap, Xff e isolados não patogênicos foram geneticamente
distintos. Na análise de estruturação genética, a diversidade genética total (Ht) entre as populações foi
de 0,2385, mostrando que houve variabilidade entre as populações. Valores mais altos do índice de
Shannon (0,3648) revelam que a população de Xap é mais diversa geneticamente. De um total de 51
locos em todas populações, 94,12% foram polimórficos, sendo que, dentro de Xap todos foram
polimórficos, e dentro de Xff apenas 18,18% foram polimórficos. O coeficiente de diferenciação
genética (GST = 0,5194) revelou diversidade tanto dentro como entre as populações patogênicas,
confirmando o resultado obtido pela AMOVA, em que 51,98% da diversidade está distribuída entre as
populações e 48,06% dentro destas. Portanto, o uso da técnica rep-PCR permitiu diferenciar Xap e Xff
e mensurar os valores de diversidade genética entre e dentro de populações. Os resultados deste estudo
fornecem informações sobre a diversidade dos patógenos, o que auxiliará para melhor identificar e
caracterizar o germoplasma resistente.
| Identifer | oai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.bc.ufg.br:tede/7162 |
| Date | 25 February 2014 |
| Creators | Paiva, Bruna Alicia Rafael de |
| Contributors | Araújo, Leila Garcês de, Wendland, Adriane, Araújo, Leila Garcês de, Borba, Tereza Cristina de Oliveira, Coelho, Gesimária Ribeiro Costa, Wendland, Adriane |
| Publisher | Universidade Federal de Goiás, Programa de Pós-graduação em Genética e Melhoramento de Plantas (EAEA), UFG, Brasil, Escola de Agronomia e Engenharia de Alimentos - EAEA (RG) |
| Source Sets | IBICT Brazilian ETDs |
| Language | Portuguese |
| Detected Language | English |
| Type | info:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| Format | application/pdf |
| Source | reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFG, instname:Universidade Federal de Goiás, instacron:UFG |
| Rights | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/, info:eu-repo/semantics/openAccess |
| Relation | -3325099404361873119, 600, 600, 600, 600, 4500684695727928426, -2769579902317698057, 2075167498588264571 |
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