Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-04-24T14:18:22Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 179014 bytes, checksum: 6dc994175521b9e665bebeec3986f34a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-24T14:18:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 179014 bytes, checksum: 6dc994175521b9e665bebeec3986f34a (MD5) Previous issue date: 2003-06-27 / Estudos sobre a patologia de sementes de feijão e a dinâmica temporal de epidemias do crestamento bacteriano comum do feijoeiro foram realizados com o objetivo de melhor conhecer a doença nas condições brasileiras. Em um primeiro estudo avaliou-se a incidência de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli (Xap) em 19 lotes de sementes provenientes, em sua maioria, do Distrito Federal. As sementes foram avaliadas pelos métodos de semeio direto e de inoculação do extrato de sementes em plantas suscetíveis, em duas condições ambientes, casa-de-vegetação e câmara de crescimento (30°C). Em 16 dos 19 lotes avaliados observou-se contaminação com Xap. Os métodos de plantio direto e extrato de sementes foram eficientes e de uso prático em laboratórios de rotina. Em um segundo estudo avaliou-se a transmissão de Xap, das sementes para as plântulas de feijão, em quatro cultivares e uma linhagem de feijão. Estudou-se ainda o efeito da idade de vagens na contaminação das sementes. Ambos os ensaios foram realizados duas vezes. Xap foi transmitida da semente para as plântulas, em todas as cultivares avaliadas. Além disso, com a maturação das vagens, houve redução significativa na produção de sementes sintomáticas. Finalmente, estudou-se a dinâmica temporal de epidemias do crestamento bacteriano comum do feijoeiro, em Viçosa, MG e no Distrito Federal. Foram avaliados os componentes epidemiológicos taxa de progresso, valor máximo de severidade e a área abaixo da curva de progresso da doença. Tentou-se, ainda, correlacionar dados de temperatura, precipitação e umidade aos de severidade da doença no campo. Detectou-se uma relação entre a severidade da doença no campo e a fenologia da cultura de feijão, além da correlação da temperatura, precipitação e a severidade. Porém, a umidade relativa não foi correlacionada aos dados de severidade obtidos. / Seed pathology of beans and temporal dynamics of common halo blight studies were done to better know about the disease in the Brazilian conditions. The first work concerned to the contamination of bean seeds by Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli was evaluated in 19 samples from Cerrados Brazilian Savana region, Brazil. Growing- on test and extraction followed by inoculation of suspension in bean susceptible plants were the two techniques used to assess the seeds. Growing-on tests were conducted in two environmental conditions: greenhouse and growing chamber at 30°C. X. axonopodis pv. phaseoli was found in sixteen samples. Seeds were placed in sterilized distilled water for bacterial extraction and the suspension obtained was inoculated in bean susceptible plants. Occurrence of symptoms was observed and the pathogen was detected in 16 samples. In the second work seed transmission of X. axonopodis pv. phaseoli was evaluated in some bean cultivars often used in comercial crops in Brazil. Two assays had been carried out and the results showed high rate of seed transmission of X. axonopodis pv. phaseoli in the cultivars. Rates of transmission ranged from 5,66 to 86,36% according to each cultivar. The effect of phenology of pods in seeds contamination was studied. Results showed that as younger as pods are, higher is the incidence of symptomatic seeds. Finally temporal dynamics of bean halo common blight epidemics were analyzed in two Brazilian locations, Federal District (Cerrados Savanna Region) and Viçosa, MG. Three epidemiological components were compared: disease progress rate (r), maximum intensity of disease (Ymax) and area under the viiidisease progress curve (AUDPC). Among the Gompertz, logistic, and monomolecular models, the monomolecular model fitted better disease severity data over time in Viçosa experiments. Disease severity was related to plant phenology, mean temperature, and rain intensity. However no correlation was found between disease severity and relative humidity. / Tese importada do Alexandria

Submitted by Helena Bejio (helena.bejio@unioeste.br) on 2017-11-22T21:49:01Z No. of bitstreams: 2 Dout_2017_Laline_Broetto.pdf: 2233437 bytes, checksum: 8d79cb052a3f82d54c7fcb5e2fbcafed (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-22T21:49:01Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dout_2017_Laline_Broetto.pdf: 2233437 bytes, checksum: 8d79cb052a3f82d54c7fcb5e2fbcafed (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-02-15 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The ease of using agrochemicals and the increasing demand for high productivity make the management of plant diseases to happen mainly through the use of chemicals. On the other hand, there is a growing search for new technologies that enable a production model compatible with sustainability. In this sense, research has been proving the efficiency in reducing the intensity of various diseases through induction of resistance. Therefore, this work aimed to investigate the potential of Trichoderma spp. isolates in the biological management of Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli, which causes common bacterial blight, in the bean crop, by its direct action and/or through the induction of resistance through the activation of enzymatic defense mechanisms. Fifteen isolates of Trichoderma spp. (TI2, TI4, TLB2, TLB3, TLB4, TLB12 and TOD3 (Trichoderma harzianum); TM1, TM2, TM4, TLB9 and TLB15 (Trichoderma virens); TLB6 (Trichoderma asperellum); TLB17 (Trichoderma koningiopsis) and TOD2B (Trichoderma longibrachiatum)) were used in three in vitro tests: direct comparison with the pathogen and production of volatile and non-volatile compounds, and two in vivo tests: evaluation of the severity of common bacterial blight in bean plants and evaluation of induction of resistance through defense enzymes analysis; peroxidase (POX), polyphenol oxidase (PFO), phenylalanine ammonia lyase (FAL) and β1,3-glucanase (β-GASE). The isolates tested together with the factor soil, autoclaved and nonautoclaved, presented very discrepant results in relation to the severity, in vitro results, protein concentration and activities of the four enzymes related to induction of resistance evaluated at work. The isolates TM4, TLB6, TLB4, and TI4 were able to limit the development of Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli in the three in vitro tests performed, direct comparison and volatile and non-volatile compounds. Isolates TLB15, TM4, TLB9, TLB6, TLB2, TLB12, TOD3 and TLB17 reduced the severity of common bacterial blight. TLB3, TI4, TLB12 and TLB15 isolates promoted increased activity of POX, PFO, and β-GASE enzymes. Isolates TLB15, TLB12, TI4, and TLB3 were the only ones that provided increased expression in the total protein content and in three of the four enzymes tested: POX, PFO, and β-GASE. The TLB2 isolate was the one that provided the greatest reduction in disease severity (80.58%) but showed little efficiency in the in vitro tests and little action in the expression of enzymatic activities. On the other hand, the TLB15 isolate, which reduced the severity at a 69.86% rate, showed in vitro action of both compounds (volatile and nonvolatile) and induced higher total protein content and POX, PFO and β-GASE expression. The TLB15 isolate was the isolate that provided most frequently when compared to control, increasing of the expression of the activity of the enzymes evaluated. In general, Trichoderma sp. may be considered promising in the management of common bacterial blight in bean crop. / A facilidade de utilização de agrotóxicos e a demanda crescente pelas altas produtividades faz com que o manejo de doenças de plantas seja realizado principalmente com a utilização de produtos químicos. Por outro lado, é crescente a busca por novas tecnologias que possibilitem um modelo de produção que seja compatível com a sustentabilidade. Neste sentido, pesquisas vêm comprovando a eficiência na redução da intensidade de várias doenças através da utilização da indução de resistência. Sendo assim, este trabalho teve como objetivo investigar o potencial de isolados de Trichoderma spp. no manejo biológico de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli, causador do crestamento bacteriano comum, na cultura do feijoeiro, pela sua ação direta e/ou através da indução de resistência através da ativação de mecanismos enzimáticos de defesa. Foram utilizados quinze isolados de Trichoderma spp. (TI2, TI4, TLB2, TLB3, TLB4, TLB12 e TOD3 (Trichoderma harzianum); TM1, TM2, TM4, TLB9 e TLB15 (Trichoderma virens); TLB6 (Trichoderma asperellum); TLB17 (Trichoderma koningiopsis) e TOD2B (Trichoderma longibrachiatum)), em três testes in vitro: confronto direto com o patógeno e produção de compostos voláteis e não voláteis, e dois testes in vivo: avaliação da severidade do crestamento bacteriano comum nas plantas de feijoeiro e avaliação da indução de resistência através da análise de enzimas de defesa; peroxidase (POX), polifenoloxidase (PFO), fenilalanina amônia-liase (FAL) e β-1,3-glucanase (β-GASE). Os isolados testados juntamente com o fator solo, autoclavado e não autoclavado, apresentaram resultados muito discrepantes em relação à severidade, os resultado in vitro, a concentração proteica e atividades das quatro enzimas relacionadas à indução de resistência avaliadas no trabalho. Os isolados TM4, TLB6, TLB4 e TI4 foram capazes de limitar o desenvolvimento de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli nos três testes in vitro realizados, confronto direto e compostos voláteis e não voláteis. Os isolados TLB15, TM4, TLB9, TLB6, TLB2, TLB12, TOD3 e TLB17 reduziram a severidade do crestamento bacteriano comum. Os isolados TLB3, TI4, TLB12 e TLB15 promoveram aumento na atividade das enzimas POX, PFO e βGASE. Os isolados TLB15, TLB12, TI4 e TLB3 foram os únicos que proporcionaram aumento da expressão no teor de proteínas totais e em três das quatro enzimas testadas: POX, PFO e β-GASE. O isolado TLB2 foi o que proporcionou maior redução da severidade da doença (80,58%), porém mostrou-se pouco eficiente nos testes in vitro e pouca ação na expressão das atividades enzimaticas. Já o isolado TLB15 que proporcionou redução da severidade de 69,86%, mostrou ação in vitro para ambos os compostos (voláteis e não voláteis) e induziu maior teor de proteínas totais e a expressão de POX, PFO e β-GASE. O isolado TLB15 foi o isolado que mais vezes proporcionou, quando comparado a testemunha, aumento da expressão da atividade das enzimas avaliadas. De maneira geral, Trichoderma sp. pode ser considerado promissor no manejo do crestamento bacteriano comum em feijoeiro.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-04-20T14:39:28Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 260475 bytes, checksum: 75cd7fa15456edf29588849379577fad (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-20T14:39:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 260475 bytes, checksum: 75cd7fa15456edf29588849379577fad (MD5) Previous issue date: 2002-04-02 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Conselheiros: Reginaldo da Silva Romeiro e Onkar Dev Dhingra. Sete meios semi-seletivos foram avaliados quanto à sua eficácia em permitir o crescimento de isolados de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli e suprimir o crescimento de contaminantes, objetivando selecionar um meio para utilização na rotina de laboratório. Foram utilizados 48 isolados da bactéria, provenientes de diferentes regiões do Brasil. Todos os meios semi- seletivos apresentaram boa eficiência em permitir o crescimento da bactéria quando preparados sem a adição dos compostos antimicrobianos presentes em suas composições originais. Quando da adição desses compostos aos meios, apenas o meio MXP modificado (M-MXP) não foi eficiente na recuperação da bactéria. Através de antibiogramas qualitativo e quantitativo respectivamente, os isolados do patógeno foram expostos a 43 compostos antimicrobianos, em diferentes concentrações. Foram selecionados sete compostos aos quais todos os isolados se mostraram insensíveis. Quatro destes compostos foram adicionados separadamente e em conjunto ao meio padrão (meio 523), em diferentes concentrações, e permitiram o crescimento de todos os isolados. Os meios semi-seletivos foram testados quanto à sua repressividade, utilizando- se, para tal, seis isolados representativos do total. Verificou-se que houve uma variação muito grande no valor do índice de repressão (IR) dos meios para cada isolado. Em alguns casos, os meios semi-seletivos permitiram maior desenvolvimento da bactéria que o meio padrão. Avaliando-se a supressividade, todos os meios semi-seletivos foram mais eficientes que o meio padrão em suprimir o crescimento de contaminantes associados a sementes de feijão nas duas amostras testadas. / Seven semi-selective media were evaluated for their efficiency to allow the growth of Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli isolates and suppress the growth of contaminants, to select a medium for use in laboratory routine tests. Forty-eight isolates of the bacterium, collected from distinct geographic regions of Brazil, were used. All semi-selective media permitted the growth of all isolates when prepared without the antimicrobial compounds presented on their original formula. When these compounds were added to the media, only the modified MXP did not permitted growth. Using qualitative or quantitative antibiograms, the isolates were exposed to forty-three different antimicrobial compounds and in different concentrations. Seven of these compounds to which the isolates showed insensibility were selected. Four of these compounds were added separately or together to the standard (523 medium), in different concentrations, and tested for growth of all the isolates. The semi- selective media were tested for their repression, using six representative isolates. There was a very high variation in repressing index value of the different media for each isolate. In some cases, the semi-selective media allowed more growth of the bacteria than the standard medium. Evaluating the suppression, all semi-selective media were found to be more efficient than the standard medium for suppressing the growth of contaminants associated with two bean seed samples. / Dissertação importada do Alexandria

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-04-18T13:33:35Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Bruna Alicia Rafael de Paiva - 2014.pdf: 5696996 bytes, checksum: 7e1928a13da15787585830bd9a4f4ae1 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-04-18T13:34:11Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Bruna Alicia Rafael de Paiva - 2014.pdf: 5696996 bytes, checksum: 7e1928a13da15787585830bd9a4f4ae1 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-18T13:34:11Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Bruna Alicia Rafael de Paiva - 2014.pdf: 5696996 bytes, checksum: 7e1928a13da15787585830bd9a4f4ae1 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2014-02-25 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The Common bacterial blight caused by Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli (Xap) and Xanthomonas fuscans subsp. fuscans (Xff), is one of most important bacterial etiology diseases from the common bean plant. This pathogen causes a great loss in the production, mainly in the “water” harvest, when the environmental conditions are helpful to the development of this disease and to its dissemination. Among the strategies about integrated handling of diseases, the genetic resistance is the main measure of control and, for obtaining some cultivate with lasting resistance and of notorious specter, it is important to the know the genetic pathogen diversity. The present work has the goal of studying the diversity and the genetic structure around and inside the population of Xap and Xff using the markers rep-PCR; to connect the genetic pathogen diversity with its geographical distribution inside Brazilian producing common bean plant regions. There were obtained 42 Xap and Xff isolated and four Xanthomonas isolated not pathogens of to the bean plant, originated in the States of São Paulo, Goiás, Paraná and Rio Grande do Sul. The genetic profiles obtained by primers BOX, ERIC and REP produced 12 haplotipes matched (HC), where the HC 3, specific xff, was more frequent in PR and GO, and was not found in RS. The dendrogram produced through the analysis showed that Xap, Xff and isolated not pathogens are genetically different. In the analysis of genetic structure, the total genetic diversity (Ht), among three populations was 0,2385 revealing that there was variability from a population to the other one. Higher values of the Shannon rate (0,3648) show that Xap population is more different genetically. From a total of 51 locos, 94,12 % are polymorphic, inside Xap population they are all polymorphicand inside Xff, only 18,18 % are polymorphic. The genetic differentiation coefficient (Gst = 0,5194) revealed diversity inside and among the patogenic populations, confirming AMOVA’s result, where 51,98 % of the diversity was among the populations and 48,06 % inside them. Then, the technique helped how to find differences between Xap and Xff and measure the values of genetic diversity among and inside populations. The results of this study give us much information about the pathogens diversity, which is considered useful to identify and to characterize the resistant germoplasm in a more efficient way. / O crestamento bacteriano comum, causado por Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli (Xap) e Xanthomonas fuscans subsp. fuscans (Xff), é uma das doenças de etiologia bacteriana mais importantes do feijoeiro-comum. Este patógeno provoca grandes perdas na produção, principalmente na safra das “águas”, quando as condições ambientais são favoráveis ao desenvolvimento da doença e à disseminação do patógeno. Dentro das estratégias do manejo integrado de doenças, a resistência genética é a principal medida de controle, e para a obtenção de cultivares com resistência duradoura e de amplo espectro é necessário o conhecimento da diversidade genética do patógeno. O presente trabalho teve como objetivos, estudar a diversidade e a estrutura genética entre e dentro das populações de Xap e Xff usando marcadores rep-PCR; relacionar a diversidade genética do patógeno com sua distribuição geográfica dentro das regiões produtoras de feijoeiro-comum no Brasil. Foram obtidos 42 isolados de Xap e Xff, e quatro isolados de Xanthomonas não patogênicas ao feijoeiro, oriundos dos estados de São Paulo, Goiás, Paraná e Rio Grande do Sul. Os perfis genéticos obtidos pelos primers BOX, ERIC e REP geraram 12 haplótipos combinados (HC), em que o HC 3, específico de Xff, foi mais frequente nos estados do PR e GO , porém não foi identificado no RS. O dendrograma gerado através da análise conjunta mostrou que Xap, Xff e isolados não patogênicos foram geneticamente distintos. Na análise de estruturação genética, a diversidade genética total (Ht) entre as populações foi de 0,2385, mostrando que houve variabilidade entre as populações. Valores mais altos do índice de Shannon (0,3648) revelam que a população de Xap é mais diversa geneticamente. De um total de 51 locos em todas populações, 94,12% foram polimórficos, sendo que, dentro de Xap todos foram polimórficos, e dentro de Xff apenas 18,18% foram polimórficos. O coeficiente de diferenciação genética (GST = 0,5194) revelou diversidade tanto dentro como entre as populações patogênicas, confirmando o resultado obtido pela AMOVA, em que 51,98% da diversidade está distribuída entre as populações e 48,06% dentro destas. Portanto, o uso da técnica rep-PCR permitiu diferenciar Xap e Xff e mensurar os valores de diversidade genética entre e dentro de populações. Os resultados deste estudo fornecem informações sobre a diversidade dos patógenos, o que auxiliará para melhor identificar e caracterizar o germoplasma resistente.