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Detecção, transmissão e patogenicidade de fungos em sementes de peroba rosa (Aspidosperma polyneuron)

Mazarotto, Edson José January 2016 (has links)
Orientadora : Profª. Drª. Ida Chapaval Pimentel / Coorientador : Prof. Dr. Álvaro Figueredo dos Santos / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ciencias Biológicas (Microbiologia, Parasitologia e Patologia Básica). Defesa: Curitiba, 19/02/2016 / Inclui referências : f. 72-82 / Área de concentração / Resumo: A peroba rosa (Aspidosperma polyneuron) é uma espécie florestal nativa da Floresta Estacional Semidecidual, que encontra-se ameaçada de extinção devido à intensa exploração predatória. Com a intensificação da procura por sementes, surge a necessidade de ampliar os conhecimentos sobre a qualidade das sementes de espécies florestais nativas. Frente a isso, o objetivo deste trabalho foi avaliar a qualidade sanitária e fisiológica de dez lotes de sementes de peroba rosa, identificando e avaliando fungos que são transmitidos pelas sementes e que possam causar danos à germinação e desenvolvimento das plantas. Foram utilizadas sementes oriundas de quatro regiões do Paraná (Oeste, Sudoeste, Centro-Sul e Noroeste). Para a germinação e vigor foram realizadas seis repetições de 25 sementes em rolos de papel, mantidas em germinador a 25°C por 26 dias com luz contínua. Os parâmetros de vigor avaliados foram a primeira contagem com 12 dias, índice de velocidade de germinação e comprimento de parte aérea e raiz. As análises sanitárias consistiram na detecção de fungos endofíticos e epifíticos, a qual requer níveis diferentes de desinfestação prévia das sementes. Para a detecção de fungos endofíticos (álcool 70% - 1 minuto; hipoclorito de sódio 1% - 4 minutos; álcool 70% - 30 segundos) e epifíticos (álcool 70% - 30 segundos; hipoclorito de sódio 1% - 1 minuto) foi utilizado meio de batata-dextrose-ágar (BDA) e meio seletivo de Fusarium (MSF). O material foi incubado a 20 °C, fotoperíodo de 12 horas de luz/ 12 horas de escuro, por sete dias. Em seguida, determinou-se a incidência (%) dos fungos. Para a transmissão, as sementes não desinfestadas foram semeadas em vermiculita. Avaliou-se a presença de sintomas nas plântulas. Aos 60 dias após a semeadura, as sementes não germinadas foram removidas e colocadas em câmara úmida para observação. Quanto à patogenicidade o teste foi realizado em mudas de peroba rosa, com ferimentos prévios nas folhas e inoculou-se um disco de meio BDA com micélio em crescimento ativo. As mudas foram colocadas em câmara úmida por 72 horas e mantidas por 30 dias em casa de vegetação. Os isolados de Fusarium spp. e Phomopsis spp. selecionados foram identificados por meio de sequências das regiões ITS1-5,8S e ITS2 do DNA ribossomal e região parcial do fator de elongação 1-alpha. A germinação das sementes de peroba rosa variou de 9,3% a 60%. Fusarium spp. e Phomopsis spp. foram os fungos fitopatogênicos encontrados como epífitos nas sementes de peroba rosa, com incidência entre 52 e 25%, respectivamente. Como endófitos apresentaram valores entre 5 e 65%, respectivamente. Houve transmissão de Fusarium spp. e Phomopsis spp. das sementes para as plântulas causando necrose de raízes e cotilédones. 27 isolados de Fusarium spp. e 26 de um total de 32 isolados de Phomopsis spp. foram patogênicos. Por meio das características morfológicas e moleculares foram identificadas sete espécies de Fusarium - Fusarium solani, Fusarium oxysporum, Fusarium verticillioides, Fusarium equiseti, Fusarium fujikuroi, Fusarium pseudocircinatum e Fusarium subglutinans, associadas às sementes de peroba rosa. Quanto à Phomopsis spp., foram identificadas duas espécies: Diaporthe paranensis e Diaporthe oxe. Palavras-chave: Patologia de sementes, sementes florestais nativas, fungos endofíticos. / Abstract: The peroba rosa (Aspidosperma polyneuron) is a forest specie, native from the semideciduous forest, which is threatened of extinction due the intense predatory exploitation. The increasing on the demand for seeds arises the need to increase knowledge about the quality of seeds of native forest species. Based on that, the aim of this study was to check the sanitary quality and physiological of ten peroba rosa seed lots, identifying and assessing fungi what are transmitted for seeds and that can cause damage to the germination and development of plants. Ten lots of seeds from four regions of Paraná (West, Southwest, South Central and Northwest) were used. For germination and vigor, six repetitions of 25 seeds were performed in rolls of paper, maintained in germinator at 25 °C for 26 days with continuous light. The vigor parameters evaluated were the first count with 12 days, germination speed index and length of shoot and root. The sanitary analysis consisted in detecting endophytic and epiphytic fungi, which requires different levels of prior disinfection of the seeds. For detection of endophytic fungi (70% alcohol - 1 minute; 1% sodium hypochlorite - 4 minutes; 70% alcohol - 30 seconds) and epiphytic (70% alcohol - 30 seconds; 1% sodium hypochlorite - 1 minute) potato-dextrose-agar (PDA) and Fusarium selective medium (MSF) were used. The material was incubated at 20 °C, with photoperiod of 12 hours light / 12 hours dark, for seven days. Then, it was determined the incidence (%) of fungi. For the transmission test, the non-disinfested seeds were sown in vermiculite. The presence of symptoms in seedlings was evaluated. At 60 days after sowing, the non-germinated seeds were removed and placed in a humid chamber for observation. The pathogenicity test was performed in seedlings of peroba rosa, with previous injuries in the leaves where a disk of PDA with mycellium in active growth was inoculated. The seedlings were placed in humid chamber for 72 hours and maintained for 30 days in a greenhouse. The isolates of Fusarium spp. and Phomopsis spp. selected were identified by sequences of rDNA regions ITS1-5,8S and ITS2 and partial region of the elongation factor 1-alpha. The germination of seeds of peroba rosa ranged from 9.3% to 60%. Fusarium spp. and Phomopsis spp. were the phytopathogenic fungi found as epiphytes in peroba rosa, with incidence between 52 and 25%, respectively. As endophytes, they showed values between 5 and 65%, respectively. There was transmission of Fusarium spp. and Phomopsis spp. from the seeds to seedlings causing necrosis in roots and cotyledons. 27 isolates of Fusarium spp. and only 26 out of 32 isolates of Phomopsis spp. were pathogenic. Through morphological and molecular and characteristics, seven Fusarium species were identified - Fusarium solani, Fusarium oxysporum, Fusarium verticillioides, Fusarium equiseti, Fusarium fujikuroi, Fusarium pseudocircinatum and Fusarium subglutinans, all associated with peroba rosa seeds. Regarding the Phomopsis spp., two species were identified: Diaporthe paranensis and Diaporthe oxe. Keywords: Seed pathology, native forest seeds, endophytic fungi.
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Identificação morfológica e transmissão de fungos em sementes de olerícolas /

Pierozzi, Caroline Geraldi, 1985. January 2017 (has links)
Orientador: Adriana Zanin Kronka / Coorientador: Ricardo Toshio Fujihara / Banca: Edson Luiz Furtado / Banca: Martha Maria Passador / Banca: Antonio Ismael Inácio Cardoso / Banca: José Otávio Machado Menten / Resumo: A identificação morfológica e a transmissão de fungos são dois ramos importantes da Patologia de Sementes. As chaves interativas, que têm como base a morfologia fúngica, auxiliam a pesquisa e trabalhos técnicos, de forma que a identificação digital se torne mais presente. Por este método, desenvolveu-se uma chave interativa que auxilie a identificação de onze espécies fúngicas associadas às sementes de cebola, cenoura, pimentão e tomate. Esta baseou-se em uma matriz composta por seis caracteres: cultura, conídio, conidióforo, coloração do conidióforo longo, coloração do micélio e presença ou não de setas. O usuário seleciona respostas aos caracteres oferecidos no software e o microrganismo é corretamente indicado. A validação desta ferramenta foi realizada por meio de teste com grupos de voluntários compostos por alunos de graduação e pós-graduação. Analisou-se o tempo despendido por cada voluntário para analisar 25 sementes com fungos comuns aos da chave, como também a porcentagem de acerto e o grau de dificuldade de cada participante. Os resultados foram confrontados com um grupo controle, o qual utilizou o meio convencional (manuais impressos de identificação). A elevada porcentagem de acertos na diagnose com o auxílio da chave e a classificação de fácil uso pelos usuários confirmou a eficiência do método. Também observou-se um aumento da acurácia dos resultados quando comparado ao sistema convencional. Além disso, esta chave pode ser útil em vários setores, desde auxiliar... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Morphological identification and fungi transmission are two important Seed Pathology branches. Interactive keys, based on fungal morphology, help research and technical work, so that digital identification becomes more present. Through this method, an interactive key was developed to help identify eleven fungal species associated with carrot, onion, pepper and tomato. It was based on a matrix composed by six characters: crop, conidium, conidiophore, long conidiophore coloration, mycelial staining and presence of setae. The user selects responses to the features offered in the software and the micro-organism is correctly indicated. The validation was performed through volunteers groups composed of undergraduate and graduate students. It was analysed the time spend by each volunteer to examine 25 seeds with fungi common to the key, as well as the percentage of hits and the difficulty level of each participant. The results were compared with a control group, which used the conventional means (printed identification manuals). The high percentage of correct answers in the diagnosis with the key use and the user easy classification confirmed its efficiency. There was also an increase in the results accuracy when compared to the conventional system. In addition, this key can be useful in many sectors, from assisting in training beginners in seed pathology to academic activities. For the study of fungi transmission through seeds, both morphological and molecular knowledge were necessary, which made the result safer. In this sense, the three races of Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici transmission by tomato seeds were analyzed. Two isolates of each race were used and 200 seeds were inoculated in spore suspension at 107 spores/mL concentration. These inoculated seeds were planted in trays with individual cells and kept under controlled light and humidity conditions until completed three weeks ... / Doutor
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Panorama do mercado de sementes e da disseminação de pragas quarentenárias no Brasil / Panorama of the seed market and the spread of quarantine pests in Brazil

Santana, Vanessa Campos 30 March 2015 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-02-20T11:24:43Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 617592 bytes, checksum: 9d57537c977e022a0e61c158cd69bc63 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-20T11:24:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 617592 bytes, checksum: 9d57537c977e022a0e61c158cd69bc63 (MD5) Previous issue date: 2015-03-30 / Semente é o insumo básico em qualquer produção agrícola e sem dúvida o sucesso do agronegócio brasileiro depende da utilização de sementes de qualidade. A associação de pragas com as sementes é um risco ao comércio internacional, consequentemente, a utilização de sementes ilegais aumenta potencialmente o risco de introdução de pragas quarentenárias em áreas isentas. Apesar do risco eminente associado às sementes ilícitas no Brasil, não há relatos na literatura sobre a relação entre comércio ilegal de sementes e a disseminação de pragas quarentenárias. O presente trabalho teve como objetivo analisar os riscos fitossanitários associados às sementes ilegais, levando em conta a produção, comercialização, fiscalizações nas safras 2009-2013 e identificando as pragas quarentenárias ausentes disseminadas por sementes. Os dados foram obtidos por meio de consulta à literatura técnico-científica e informações disponíveis em páginas eletrônicas de entidades e órgãos da área. Os resultados são apresentados em gráficos e tabelas que ilustram o panorama nacional sobre o tema. Com as informações obtidas concluiu-se que houve aumento na produção de sementes entre as safras 2009-2013, com destaque para as culturas de soja e milho. A taxa de utilização de sementes certificadas ainda é preocupante para algumas culturas importantes do país: feijão, arroz, algodão, soja e trigo. Os estados com mais fiscalizações entre 2009-2013 foram: São Paulo, Minas Gerais e Paraná. No entanto, os estados com mais irregularidades encontradas foram: Mato Grosso do Sul, Paraná e Minas Gerais. Das pragas quarentenárias ausentes no Brasil (A1), 162 espécies estão presentes em países da América do Sul, das quais 49 são potencialmente veiculadas por sementes, embora as demais também possam ser disseminadas em contaminações de lotes de sementes ilegais. Para minimizar os problemas fitossanitários associados à pirataria de sementes no Brasil, ações educativas sobre a gravidade do problema e melhoria do sistema de fiscalização em estados e áreas de fronteiras sul-americanas devem ser consideradas pelo sistema nacional de defesa sanitária. / Seed is the basic input for any agricultural production and no doubt the success of Brazilian agribusiness depends on the use of quality seeds. The association of pests with the seeds is a risk to international trade, hence the use of illegal seeds potentially increases the risk of introduction of quarantine pests in free areas. Despite the imminent risk associated with illegal seeds in Brazil, there are no reports in the literature about relationship between illegal seed trade and the spread of quarantine pests. This study aimed to analyze the phytosanitary risks associated with illegal seeds, taking into account production, marketing, inspections in 2009-2013 crops and identifying the missing quarantine pests spread by seeds. Data were obtained by consulting the technical and scientific literature and information available in electronic entities and bodies of the area pages. The results are presented in graphs and tables illustrating the national scene on the topic. With the information obtained it was concluded that there was an increase in seed production between the 2009-2013 seasons, especially the soybean and corn. The rate of use of certified seed is still worrisome to some important crops in the country: beans, rice, cotton, soybeans and wheat. The states with more inspections between 2009-2013 were: São Paulo, Minas Gerais and Paraná. However, the states with more irregularities were: Mato Grosso do Sul, Parana and Minas Gerais. Of absent quarantine pests in Brazil (A1), 162 species are found in the countries of South America, 49 of which are potentially propagated by seed, although others may also be disseminated in lots of illegal seed contamination. To minimize pest problems associated with piracy seeds in Brazil, educational activities on the severity of the problem and improve the surveillance system in states and areas of South American borders should be considered by the national health protection system.
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Mapeamento e avaliação da qualidade das sementes de forrageiras comercializadas em Rondônia / Mapping and quality evaluation of forage seed marketed in Rondônia

Silva, Rachel Barbosa da 17 April 2015 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-03-16T11:49:48Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1235669 bytes, checksum: e6b50c818e1940fbb203e4c3ad4832ec (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-16T11:49:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1235669 bytes, checksum: e6b50c818e1940fbb203e4c3ad4832ec (MD5) Previous issue date: 2015-04-17 / A qualidade dos atributos genéticos, físicos, fisiológicos e sanitários de sementes é fundamental para o sucesso na implantação das pastagens, que servem como principal alimento do rebanho bovino, fonte de renda de produtores rurais. Porém, análises laboratoriais apontam o comércio de sementes de forrageiras com baixa qualidade no Brasil. Neste panorama, objetivou-se realizar o levantamento da qualidade física, fisiológica e sanitária de sementes de Brachiaria brizantha, Brachiaria humidicola, Brachiaria decumbens e Panicum maximum coletadas por fiscais da Agência de Defesa Sanitária Agrosilvopastoril no comércio do estado de Rondônia, nos meses de setembro, outubro e novembro de 2012, 2013 e 2014, seguindo as Regras para Análise de Sementes - RAS. Os resultados foram obtidos das análises realizadas em Laboratórios Oficiais, localizados no Pará, Paraíba e Pernambuco, para “Pureza Física”, Germinação e “Outras Sementes por Número”. Foi verificado que, 98,2%, 90,3% e 94,7% (safra 2011-2012); 87,7%, 100% e 76% (safra 2012-2013) e, 80,4%, 60% e 92,8% (safra 2013-2014) de B. brizantha, B. humidicola e P. maximum respectivamente, estavam em desacordo com os padrões exigidos para a comercialização das espécies. A pureza física foi o principal parâmetro de baixa qualidade. As sementes de forrageiras das espécies B. brizantha, B. decumbens e P. maximum, produzidas em Minas Gerais, Mato Grosso do Sul e São Paulo foram avaliadas quanto a sanidade, no Laboratório de Fitopatologia da Embrapa Rondônia, em Porto Velho, RO. Quanto à incidência de fungos e ao potencial de disseminação de cigarrinha das pastagens, principal praga de gramíneas e um dos mais importantes problemas fitossanitários para a agropecuária brasileira. Em relação aos fungos, foram relacionados treze gêneros associados às sementes analisadas, sendo os de maior incidência Fusarium sp., Cercospora sp., Rizoctonia sp. e Helminthosporium sp. em todas as três espécies estudadas, com maior frequência nas sementes das espécies B. brizantha. Em relação à presença da cigarrinha das pastagens, nas impurezas destas sementes, não foram observados presença de ovos da praga nas amostras de sementes e nem o surgimento de ninfas da cigarrinha quando as sementes foram plantadas juntamente com as impurezas das amostras. Nestes experimentos, ficou evidente que as sementes comercializadas em Rondônia estão associadas à uma grande quantidade de impurezas e sendo o Estado importador de sementes, estes resultados evidenciam a necessidade de identificação da origem e a importância das ações de fiscalização do comércio, visando reduzir a vulnerabilidade a que se expõe a pecuária rondoniense. / The quality of genetic, physical, physiological and sanitary attributes of seeds is critical to the successful implementation of the pastures that serve as main food of cattle, source of income for farmers. However, laboratory tests indicate the forage seeds of trade with low quality in Brazil. Against this background, the objective was to survey the physical, physiological and health of Brachiaria seeds, Brachiaria humidicola, B. decumbens and Panicum maximum collected by inspectors from the Health Protection Agency Agrosilvopastoril trade the state of Rondônia, in September , October and November 2012, 2013 and 2014, following the Rules for Seed Analysis - RAS. The results were obtained from analyzes carried out in laboratories officers, located in Pará, Paraíba and Pernambuco, for "Purity Physics" Germination and "Other Seeds by number." It was found that 98.2%, 90.3% and 94.7% (2011-2012 harvest); 87.7%, 100% and 76% (season 2012-2013), and 80.4%, 60% and 92.8% (season 2013- 2014) of B. brizantha, B. humidicola and P. maximum, respectively. They were at odds with the standards required for the marketing of species. Physical purity has been the main measure of low quality. The forage seeds of the species B. brizantha, B. decumbens and P. maximum, produced in Minas Gerais, Mato Grosso do Sul and São Paulo were evaluated for sanity in the Phytopathology Laboratory of Embrapa Rondônia, in Porto Velho, RO. As the incidence of fungi and the potential for spread of the leafhopper pastures, major pest of grasses and one of the most important phytosanitary problems for Brazilian agriculture. Regarding fungi, thirteen were related genres associated with the seeds analyzed, and the higher incidence of Fusarium sp., Cercospora sp., Rhizoctonia sp. and Helminthosporium sp. in all three species studied, most frequently in the seeds of the species B. brizantha. Regarding the presence of the leafhopper pastures, the impurities of these seeds, we did not observe the presence of pest eggs in the seed samples and even the emergence of leafhopper nymphs when the seeds were planted along with the impurities in the samples. In these experiments, it became clear that the seeds sold in Rondônia, state seed importer, are associated with a large amount of impurities, these results highlight the need to identify the origin and the importance of trade enforcement actions aimed at reducing vulnerability that is exposed to rondoniense livestock.
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Detecção e identificação de Diaporthe phaseolorum var. meridionalis em sementes de soja por PCR

Vechiato, Marta Helena [UNESP] 09 1900 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:00Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2002-09Bitstream added on 2014-06-13T19:24:08Z : No. of bitstreams: 1 vechiato_mh_dr_botfca.pdf: 1951086 bytes, checksum: 3601f634d2920c34d704cb5312055b13 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O presente trabalho teve como objetivos a) desenvolver um método eficiente, rápido e de fácil aplicação na detecção e na identificação de Diaporthe phaseolorum var. meridionalis (Dphm), em sementes de soja utilizando-se a técnica de reação de polimerase em cadeia (PCR); b) comparar PCR com os métodos rotineiros de patologia de sementes. Os resultados sugerem que pode haver uma identificação equivocada, quando se utiliza este parâmetro na diferenciação do agente causal do cancro da haste da soja, com outras espécies de Diaporthe presentes em sementes; b) pela coloração das colônias nos meios de cultura BDA e Czapeck, os isolados de Dphm e Dph foram agrupados em 9 classes. Em meio Czapeck, todas as colônias identificadas como Dphm, foram agrupadas nas classes 8 e 9, apresentando um padrão micelial lanoso (tipo feltro), exceto o isolado 46; c) pelo crescimento micelial não foi possível distinguir Dphm de Dph. Comparando-se os métodos do papel de filtro modificado com 2,4D, plaqueamento em BDA e sementes em papel de filtro com 2,4D, associado a PCR, para detecção e identificação de Dphm, visando distinguí-lo de outras espécies presentes nas sementes, conclui-se que o método mais confiável foi o de incubação das sementes em papel de filtro com 2,4D associado a PCR. Em relação ao melhor método de extração de DNA, em sementes colonizadas por Dph., foi o da lavagem das sementes com STE e purificação do DNA com a resina de sílica gel da Wizard (Promega). / The objective of this research was to develop, an easy, quick and efficient method for detection and identification of Diaporthe phaseolorum var. meridionalis (Dphm), in soybean seeds, using the polimerase chain reaction (PCR) technique and methods routinely used in seed pathology. The results suggest that there can be a mistake when using this parameter to distinguish the causal agent of the stem canker from other species of Diaporthe; b)color of the colonies in PDA and Czapeck medium, Dphm and the of Diaporthe spp. (Dph) isolates were grouped in 9 classes. In Czapeck medium, all isolates identified as Dphm, were grouped in classes 8 and 9, showing wooled micelial pattern (like felt), except isolate 46; c) basead on the micelial growth it was not possible to distinguish Dphm from Dph. For detection and identification of Dphm of other Dph species in the seeds, the most reliable method was the modified blotter test with 2,4D associated with PCR. In Dph colonized seeds, the best method of DNA extraction was seed washing with STE and DNA purification using Wizard (Promega) silica gel resin.
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Detecção e identificação de Diaporthe phaseolorum var. meridionalis em sementes de soja por PCR /

Vechiato, Marta Helena, 1953- January 2002 (has links)
Resumo: O presente trabalho teve como objetivos a) desenvolver um método eficiente, rápido e de fácil aplicação na detecção e na identificação de Diaporthe phaseolorum var. meridionalis (Dphm), em sementes de soja utilizando-se a técnica de reação de polimerase em cadeia (PCR); b) comparar PCR com os métodos rotineiros de patologia de sementes. Os resultados sugerem que pode haver uma identificação equivocada, quando se utiliza este parâmetro na diferenciação do agente causal do cancro da haste da soja, com outras espécies de Diaporthe presentes em sementes; b) pela coloração das colônias nos meios de cultura BDA e Czapeck, os isolados de Dphm e Dph foram agrupados em 9 classes. Em meio Czapeck, todas as colônias identificadas como Dphm, foram agrupadas nas classes 8 e 9, apresentando um padrão micelial lanoso (tipo feltro), exceto o isolado 46; c) pelo crescimento micelial não foi possível distinguir Dphm de Dph. Comparando-se os métodos do papel de filtro modificado com 2,4D, plaqueamento em BDA e sementes em papel de filtro com 2,4D, associado a PCR, para detecção e identificação de Dphm, visando distinguí-lo de outras espécies presentes nas sementes, conclui-se que o método mais confiável foi o de incubação das sementes em papel de filtro com 2,4D associado a PCR. Em relação ao melhor método de extração de DNA, em sementes colonizadas por Dph., foi o da lavagem das sementes com STE e purificação do DNA com a resina de sílica gel da Wizard (Promega). / Abstract: The objective of this research was to develop, an easy, quick and efficient method for detection and identification of Diaporthe phaseolorum var. meridionalis (Dphm), in soybean seeds, using the polimerase chain reaction (PCR) technique and methods routinely used in seed pathology. The results suggest that there can be a mistake when using this parameter to distinguish the causal agent of the stem canker from other species of Diaporthe; b)color of the colonies in PDA and Czapeck medium, Dphm and the of Diaporthe spp. (Dph) isolates were grouped in 9 classes. In Czapeck medium, all isolates identified as Dphm, were grouped in classes 8 and 9, showing wooled micelial pattern (like felt), except isolate 46; c) basead on the micelial growth it was not possible to distinguish Dphm from Dph. For detection and identification of Dphm of other Dph species in the seeds, the most reliable method was the modified blotter test with 2,4D associated with PCR. In Dph colonized seeds, the best method of DNA extraction was seed washing with STE and DNA purification using Wizard (Promega) silica gel resin. / Orientador: Antonio Carlos Maringoni / Coorientador: Elza Maria Frias Martins / Doutor
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Crestamento bacteriano comum do feijoeiro: patologia de sementes e dinâmica temporal de epidemias / Common halo blight: seed pathology and temporal dynamics of epidemics

Pereira, José Luciano de Assis 27 June 2003 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-04-24T14:18:22Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 179014 bytes, checksum: 6dc994175521b9e665bebeec3986f34a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-24T14:18:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 179014 bytes, checksum: 6dc994175521b9e665bebeec3986f34a (MD5) Previous issue date: 2003-06-27 / Estudos sobre a patologia de sementes de feijão e a dinâmica temporal de epidemias do crestamento bacteriano comum do feijoeiro foram realizados com o objetivo de melhor conhecer a doença nas condições brasileiras. Em um primeiro estudo avaliou-se a incidência de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli (Xap) em 19 lotes de sementes provenientes, em sua maioria, do Distrito Federal. As sementes foram avaliadas pelos métodos de semeio direto e de inoculação do extrato de sementes em plantas suscetíveis, em duas condições ambientes, casa-de-vegetação e câmara de crescimento (30°C). Em 16 dos 19 lotes avaliados observou-se contaminação com Xap. Os métodos de plantio direto e extrato de sementes foram eficientes e de uso prático em laboratórios de rotina. Em um segundo estudo avaliou-se a transmissão de Xap, das sementes para as plântulas de feijão, em quatro cultivares e uma linhagem de feijão. Estudou-se ainda o efeito da idade de vagens na contaminação das sementes. Ambos os ensaios foram realizados duas vezes. Xap foi transmitida da semente para as plântulas, em todas as cultivares avaliadas. Além disso, com a maturação das vagens, houve redução significativa na produção de sementes sintomáticas. Finalmente, estudou-se a dinâmica temporal de epidemias do crestamento bacteriano comum do feijoeiro, em Viçosa, MG e no Distrito Federal. Foram avaliados os componentes epidemiológicos taxa de progresso, valor máximo de severidade e a área abaixo da curva de progresso da doença. Tentou-se, ainda, correlacionar dados de temperatura, precipitação e umidade aos de severidade da doença no campo. Detectou-se uma relação entre a severidade da doença no campo e a fenologia da cultura de feijão, além da correlação da temperatura, precipitação e a severidade. Porém, a umidade relativa não foi correlacionada aos dados de severidade obtidos. / Seed pathology of beans and temporal dynamics of common halo blight studies were done to better know about the disease in the Brazilian conditions. The first work concerned to the contamination of bean seeds by Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli was evaluated in 19 samples from Cerrados Brazilian Savana region, Brazil. Growing- on test and extraction followed by inoculation of suspension in bean susceptible plants were the two techniques used to assess the seeds. Growing-on tests were conducted in two environmental conditions: greenhouse and growing chamber at 30°C. X. axonopodis pv. phaseoli was found in sixteen samples. Seeds were placed in sterilized distilled water for bacterial extraction and the suspension obtained was inoculated in bean susceptible plants. Occurrence of symptoms was observed and the pathogen was detected in 16 samples. In the second work seed transmission of X. axonopodis pv. phaseoli was evaluated in some bean cultivars often used in comercial crops in Brazil. Two assays had been carried out and the results showed high rate of seed transmission of X. axonopodis pv. phaseoli in the cultivars. Rates of transmission ranged from 5,66 to 86,36% according to each cultivar. The effect of phenology of pods in seeds contamination was studied. Results showed that as younger as pods are, higher is the incidence of symptomatic seeds. Finally temporal dynamics of bean halo common blight epidemics were analyzed in two Brazilian locations, Federal District (Cerrados Savanna Region) and Viçosa, MG. Three epidemiological components were compared: disease progress rate (r), maximum intensity of disease (Ymax) and area under the viiidisease progress curve (AUDPC). Among the Gompertz, logistic, and monomolecular models, the monomolecular model fitted better disease severity data over time in Viçosa experiments. Disease severity was related to plant phenology, mean temperature, and rain intensity. However no correlation was found between disease severity and relative humidity. / Tese importada do Alexandria
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Germinação e vigor de sementes de soja em função da disponibilidade hídrica do solo e presença de Phomopsis sojae

Simoni, Fabiana De [UNESP] 29 June 2007 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:33:36Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-06-29Bitstream added on 2014-06-13T20:25:23Z : No. of bitstreams: 1 simoni_f_dr_jabo.pdf: 283626 bytes, checksum: 7040ccc9750e133445c4d78471b87dd1 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O objetivo da presente pesquisa foi verificar o efeito da disponibilidade hídrica e de Phomopsis sojae na germinação de sementes de soja. Para caracterização das qualidades fisiológica e sanitária das sementes foram usados os seguintes testes: padrão de germinação e de vigor (envelhecimento acelerado, condutividade elétrica e massa seca das plântulas) e “blotter test”; além disso, determinou-se o teor de água, antes e após o envelhecimento. Para o estudo da emergência com disponibilidade hídrica, foram considerados três tratamentos: 60% (H1), 40% (H2) e 20% (H3) de sua capacidade de retenção de água. As sementes foram inoculadas artificialmente com Phomopsis sojae por contato dessas com o fungo por um período de 32 horas, posteriormente foram semeadas em caixas plásticas para a condução do teste de emergência com disponibilidade hídrica. A semeadura das quatro variedades (MSoy 8400, MSoy 8200, Embrapa 48 e Paraíso) combinadas com os três tratamentos de disponibilidade hídrica e o fungo, constituíram 24 tratamentos com quatro repetições. Cada caixa recebeu 50 sementes, essas foram mantidas em ambiente de laboratório. A avaliação da emergência das plântulas foi feita aos 10 dias após a semeadura e, ao final desse período, procedeu-se a avaliação da massa seca de plântulas de soja. Para o estudo da disponibilidade hídrica em plântulas de soja e os níveis de inoculação das sementes com P. sojae foram considerados 18 tratamentos (3 disponibilidades hídricas: 50% (H1), 40% (H2) e 30% (H3) de sua capacidade de retenção de água x 6 níveis de sementes inoculadas (0, 5, 10, 20, 40 e 60%). O período de inoculação das sementes foi o mesmo utilizado anteriormente... / The objective of the present research was to verify the effect of water availability and Phomopsis sojae in the germination of soybean seeds. For characterization of physiological and sanitary qualities of the seeds the following tests were used: germination and vigor (accelerated aging, bulk electric conductivity and dry mass of seedlings) and blotter test ; besides, it was determined the water content, before and after the aging. For the study of the emergence with water availability, three treatments were considered: 60% (H1), 40% (H2) and 20% (H3) of its water retention capacity. The seeds were artificially inoculated with Phomopsis sojae by contact with the fungi for a period of 32 hours, laterly they were sowed in plastic boxes for the emergence test with water availability. Four varieties (MSoy 8400, MSoy 8200, Embrapa 48 and Paradise) were seeded combined with three levels of water availability and the fungi, constituted 24 treatments with four replications. Each box received 50 seeds, these were maintained in laboratory. The evaluation of the seedlings emergence was made in 10th day after seeding and at the end of that period was made the evaluation of the soybean seedlings dry mass. For the study of the water availability in soybean seedlings and the levels of inoculation of the seeds with P. sojae were considered 18 treatments (3 water availability: 50% (H1), 40% (H2) and 30% (H3) of its water retention capacity x 6 levels of inoculated seeds (0, 5, 10, 20, 40 and 60%). The period of the seeds inoculation was the same used previously. The evaluation of the seedlings emergence was made in 10th day after the seeding and at the end of that period was made the evaluation of the soybean seedlings dry mass. The obtained results allowed to conclude that the relationship between the emergence of soybean seedlings in soil and Phomopsis sojae varied with the level of water...(Complete abstract, click electronic access below)
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Germinação e vigor de sementes de soja em função da disponibilidade hídrica do solo e presença de Phomopsis sojae /

Simoni, Fabiana De January 2007 (has links)
Orientador: Rita de Cássia Panizzi / Banca: Juliana Altafin Galli / Banca: Terezinha de Jesus Deléo Rodrigues / Banca: Rubens Sader / Banca: Adriana Zanin Kronka / Resumo: O objetivo da presente pesquisa foi verificar o efeito da disponibilidade hídrica e de Phomopsis sojae na germinação de sementes de soja. Para caracterização das qualidades fisiológica e sanitária das sementes foram usados os seguintes testes: padrão de germinação e de vigor (envelhecimento acelerado, condutividade elétrica e massa seca das plântulas) e "blotter test"; além disso, determinou-se o teor de água, antes e após o envelhecimento. Para o estudo da emergência com disponibilidade hídrica, foram considerados três tratamentos: 60% (H1), 40% (H2) e 20% (H3) de sua capacidade de retenção de água. As sementes foram inoculadas artificialmente com Phomopsis sojae por contato dessas com o fungo por um período de 32 horas, posteriormente foram semeadas em caixas plásticas para a condução do teste de emergência com disponibilidade hídrica. A semeadura das quatro variedades (MSoy 8400, MSoy 8200, Embrapa 48 e Paraíso) combinadas com os três tratamentos de disponibilidade hídrica e o fungo, constituíram 24 tratamentos com quatro repetições. Cada caixa recebeu 50 sementes, essas foram mantidas em ambiente de laboratório. A avaliação da emergência das plântulas foi feita aos 10 dias após a semeadura e, ao final desse período, procedeu-se a avaliação da massa seca de plântulas de soja. Para o estudo da disponibilidade hídrica em plântulas de soja e os níveis de inoculação das sementes com P. sojae foram considerados 18 tratamentos (3 disponibilidades hídricas: 50% (H1), 40% (H2) e 30% (H3) de sua capacidade de retenção de água x 6 níveis de sementes inoculadas (0, 5, 10, 20, 40 e 60%). O período de inoculação das sementes foi o mesmo utilizado anteriormente...(Resumo completo clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The objective of the present research was to verify the effect of water availability and Phomopsis sojae in the germination of soybean seeds. For characterization of physiological and sanitary qualities of the seeds the following tests were used: germination and vigor (accelerated aging, bulk electric conductivity and dry mass of seedlings) and " blotter test "; besides, it was determined the water content, before and after the aging. For the study of the emergence with water availability, three treatments were considered: 60% (H1), 40% (H2) and 20% (H3) of its water retention capacity. The seeds were artificially inoculated with Phomopsis sojae by contact with the fungi for a period of 32 hours, laterly they were sowed in plastic boxes for the emergence test with water availability. Four varieties (MSoy 8400, MSoy 8200, Embrapa 48 and Paradise) were seeded combined with three levels of water availability and the fungi, constituted 24 treatments with four replications. Each box received 50 seeds, these were maintained in laboratory. The evaluation of the seedlings emergence was made in 10th day after seeding and at the end of that period was made the evaluation of the soybean seedlings dry mass. For the study of the water availability in soybean seedlings and the levels of inoculation of the seeds with P. sojae were considered 18 treatments (3 water availability: 50% (H1), 40% (H2) and 30% (H3) of its water retention capacity x 6 levels of inoculated seeds (0, 5, 10, 20, 40 and 60%). The period of the seeds inoculation was the same used previously. The evaluation of the seedlings emergence was made in 10th day after the seeding and at the end of that period was made the evaluation of the soybean seedlings dry mass. The obtained results allowed to conclude that the relationship between the emergence of soybean seedlings in soil and Phomopsis sojae varied with the level of water...(Complete abstract, click electronic access below) / Doutor
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Potencial do óleo de Aloysia citriodora Palau no controle de fitopatógenos e na indução de resistência ao tombamento de plântulas de feijão, pepino e beterraba / Potential of Aloysia citriodora Palau oil on the phytopathogens and in theresistance induction at damping off in bean, cucumber and beet

Freddo, Álvaro Rodrigo 18 September 2015 (has links)
Os cultivos agrícolas são acometidos por pragas e doenças que diminuem sua produtividade. Dentre as doenças está o tombamento de plântulas que pode ocorrer em pré e pós-emergência. Nas culturas de feijão, pepino e beterraba o tombamento é ocasionado por diversos patógenos, mas principalmente por fungos fitopatogênicos. Várias medidas são utilizadas para o controle deste tipo de doenças e dentre estas, está o tratamento de sementes com fungicidas químicos. No entanto, a sociedade tem cada vez mais se preocupado com a qualidade dos alimentos e com a contaminação ambiental, gerando uma busca por produtos menos agressivos ao homem e ao ambiente. O uso de óleos essenciais para o controle de fitopatógenos é um exemplo de alternativa testada pela ciência, na busca de tecnologias menos agressivas. O presente trabalho teve como objetivo avaliar o potencial do óleo de Aloysia citriodora no controle de fitopatógenos e na indução de resistência ao tombamento de plântulas de feijão, pepino e beterraba. Esta tese foi dividida em quatro capítulos, sendo o primeiro introdutório e os demais abordando o patossistema Pythium sp. em feijoeiro, Sclerotinia sclerotiorum em pepino e Fusarium sp. em beterraba. A metodologia utilizada consistiu na realização de quatro experimentos em cada patossistema, sendo o trabalho todo realizado na Universidade Tecnológica Federal do Paraná, Campus Dois Vizinhos. No primeiro experimento avaliou-se o efeito fungistático e fungicida do óleo essencial de A. citriodora em meio BDA in vitro, no crescimento micelial dos patógenos estudados. No segundo experimento avaliou-se o efeito in vitro de concentrações de óleo essencial de A. citriodora, em meio BD em lâminas de microscopia, na germinação de esporângios de Pythium sp. e de conídios de Fusarium sp. e em placas de Petri com meio BDA, no índice de velocidade de germinação de escleródios de S. sclerotiorum. No terceiro experimento, avaliou-se por meio de teste de germinação em rolo de papel (RP), o efeito do uso de concentrações de óleo essencial de A. citriodora no tratamento de sementes de feijão, pepino e beterraba. As variáveis utilizadas para avaliar este experimento foram a porcentagem de germinação, vigor, massa verde média por plântula e comprimento médio de plântulas. No quarto experimento avaliou-se o efeito do tratamento de sementes de feijão, pepino e beterraba, com concentrações de óleo essencial de A. citriodora, semeadas em substratos contaminados com seus subsequentes patógenos estudados, Pythium sp., S. sclerotiorum e Fusarium sp. Neste experimento, utilizaram-se as seguintes variáveis: porcentagem de emergência, porcentagem de tombamentos de plântulas de pós-emergência, massa verde média por plântula, comprimento médio por plântula e análises bioquímicas. As análises bioquímicas dos tecidos vegetais avaliados foram as seguintes: teor de proteínas, atividade enzimática de peroxidases, fenilalanina amônia-liase (FAL), quitinases e β-1,3-glucanases. Os resultados obtidos in vitro, demonstram que o óleo essencial possui efeito fungistático e fungicida no crescimento micelial e na germinação de esporângios, conídios e escleródios dos patógenos estudados no presente trabalho, o que pode estar relacionado aos seus principais componentes, citral e limoneno. O óleo também apresenta baixa fitotoxidez às sementes das espécies estudadas, em feijão diminuiu apenas a germinação na maior dosagem estudada (0,25%), em pepino também na maior dosagem (0,25%) reduziu o comprimento de plântulas e em beterraba não houveram efeitos negativos às plântulas. No experimento em substrato contaminado com os patógenos, o uso de óleo essencial: aumentou a germinação e diminuiu os tombamentos de plântulas de feijoeiro; na concentração de 0,0625% diminuiu os tombamentos de pós-emergência em pepino. Nas análises bioquímicas constatou-se aumento da atividade enzimática de peroxidases e β-1,3-glucanases em feijoeiro, aumentou a atividade enzimática de peroxidases e glucanases em pepino e aumentou a atividade enzimática de peroxidases em beterraba, demonstrando dessa forma ação do óleo na indução de resistência ao tombamento de plântulas. / The crops are affected by pests and diseases that decrease productivity. Among them are the damping off of seedlings that can occur in pre and post-emergence. In bean crops, cucumber and beet these diseases occur, being caused by various pathogens, especialy fitopathogenic fungi. Several measures are used for the controle of such diseases, among them, is the chemical seed treatment fungicides. However, society has become increasingly concerned about the quality and food and environmental contamination, generation a growting search for sensitive products to humans and the environment. The use of essential oils to control plant pathogens is an example of alternative tested by science in the search for less aggressive technologies. This study aimed to evaluate the efficiency of the use of essential oil Aloysia citriodora, in control of pathogens causing damping off in beans, cucumber and beet. This thesis was divided in four chapters, the introductory first, and the other addressing the control of Pythium sp. in beans, Sclerotinia sclerotiorum on cucumber, and Fusarium sp. on beet. The methodology consisted of four experiments in each pathosystem, with all the work done at the Federal Technological University of Parana, Campus Dois Vizinhos. In the first experiment evaluated the fungistatic and fungicidal effect of the essential oil of A. citriodora on PDA in vitro in mycelial growth of pathogens studied. In the second experiment evaluated the in vitro effect of essential oil concentrations of A. citriodora in BD medium on microscope slides, on the germination of sporangia Pythium sp. and conidia Fusarium sp., and in Petri dishes with PDA medium, the sclerotia germination speed index of S. sclerotiorum. In the third experiment, we evaluated in germination test in paper roll (PR), the phytotoxic effect or not the use of essential oil concentrations of A. citriodora in dry bean seed, cucumber and beet. The variables used to assess this experiment were the germination percentage, mediun green mass per plant and average length of seedlings. In the fourth experiment we assessed the effect of treating bean seeds, cucumber and beet with essential oil contents of A. citriodora, seeds in their subsequent substrates contamined with pathogens studied, Pythium sp., S. sclerotiorum and Fusarium sp. In this experiment we used the following variables: percentage of emergence, percentage of post-emergence damping off, green average mass per plant, average length per plant and biochemical analyzes. The biochemistry of plant tissues evaluated were as follows: protein content, enzymatic activities of peroxidases, phenylalanine ammonia-liase (PAL), chitinases and β-1,3-glucanases. The in vitro results show that the essential oil has fungistatic and fungicidal effect on mycelial growth, on sporangia germination, conidia and sclerotia of the pathogens studied in this work, wich may be related to its major components, citral and limonene. The oil also exhibits low phytotoxicity to seeds of the species studied, only in beans decreases germination in most studied dosage (0,25%), cucumber also in the higher dosage (0,25%) reduce the length of seedlings, and beet there were no negative effects to the seedlings. In the test in substrate contaminated with the pathogens, the use of essential oil: increased germination and decreased post emergence damping off of beans seedlings; at a concentration of 0,0625% decreases post emergence damping off in cucumber. In biochemical analyzes found an increase in the enzymatic activity of peroxidases and β-1,3-glucanases on beans, and glucanases on cucumber, and increased enzyme activity of peroxidases on beet, showing action in resistance induction at damping off.

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