Return to search

Avaliação de métodos probabilísticos de inferência filogenética na investigação de complexos de espécies crípticas: estudo de caso em flebotomíneos de interesse epidemiológico

Submitted by Fernanda Rodrigues de Lima (fernanda.rlima@ufpe.br) on 2018-08-28T21:53:15Z
No. of bitstreams: 2
license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5)
DISSERTAÇÃO Abigail Marcelino dos Santos Silva.pdf: 4737414 bytes, checksum: 6d5e7224ed503576d6f5980323a0d5e5 (MD5) / Approved for entry into archive by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-09-06T22:53:30Z (GMT) No. of bitstreams: 2
license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5)
DISSERTAÇÃO Abigail Marcelino dos Santos Silva.pdf: 4737414 bytes, checksum: 6d5e7224ed503576d6f5980323a0d5e5 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-06T22:53:30Z (GMT). No. of bitstreams: 2
license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5)
DISSERTAÇÃO Abigail Marcelino dos Santos Silva.pdf: 4737414 bytes, checksum: 6d5e7224ed503576d6f5980323a0d5e5 (MD5)
Previous issue date: 2015-09-15 / A falta de padronizações sistemáticas deixa questões em aberto na identificação das espécies crípticas dos complexos Lutzomyia longipalpis e L. umbratilis, que incluem vetores dos agentes etiológicos das leishmanioses no Brasil. As metodologias de identificação taxonômica têm contribuído para um maior conhecimento da diversidade biológica. Porém o status taxonômico destes dois grupos de flebotomíneos ainda permanece incerto no Brasil. A filogenética molecular é uma ferramenta essencial para investigação de espécies crípticas. Para inferência filogenética com dados de sequências de nucleotídeos existem métodos estatísticos de inferência, inclusive métodos baseados em probabilidade. Estão disponíveis em duas abordagens: Máxima Verossimilhança (MV) e Bayesiana (BE). Neste trabalho foi avaliada a adequação destas abordagens na investigação das referidas espécies crípticas utilizando um marcador mitocondrial (citocromo oxidase I – COI) e um nuclear (gene period – per). Para o complexo L. umbratilis, o método BE apresentou árvores filogenéticas com maiores probabilidades, ou seja, com melhores resultados em relação às árvores inferidas por MV, principalmente com a utilização do marcador COI. Já para o complexo de espécies L. longipalpis, o método BE apresentou a melhor árvore filogenética em relação ao método MV e apenas utilizando o marcador nuclear period. Tendo alcançado melhores resultados com o marcador mitocondrial COI, para L. umbratilis, e period, para L. longipalpis, e com a abordagem BE, conclui-se que esta abordagem juntamente com os respectivos marcadores teve maior adequação do que a abordagem MV. / The lack of systematic standardization leaves open questions in the identification of cryptic species complex of Lutzomyia longipalpis and L. umbratilis, including vectors of etiological agents of leishmaniasis in Brazil. The taxonomic identification methodologies have contributed to a better understanding of biological diversity. But the taxonomic status of these two sandflies groups remains uncertain in Brazil. Molecular phylogenetics is an essential tool for research cryptic species. For phylogenetic inference nucleotide sequence data are statistical inference methods, including methods based on probability. two approaches are available: Maximum Likelihood (ML) and Bayesian (BE). This work evaluated the adequacy of these approaches in the investigation of these cryptic species using a mitochondrial marker (cytochrome oxidase I - COI) and nuclear (gene period - per). For the complex L. umbratilis the method presented phylogenetic trees BE with higher probability, that is, with better results in respect of trees inferred by MV, especially with the use of the COI marker. As for the species complex L. longipalpis, the BE method presented the best phylogenetic tree in relation to the MV method only using the nuclear period marker. Having achieved better results with the mitochondrial marker COI to L. umbratilis, and period to L. longipalpis, and with BE approach, it is concluded that this approach together with their markers had better match than the MV approach.

Identiferoai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.ufpe.br:123456789/26324
Date15 September 2015
CreatorsSILVA, Abigail Marcelino dos Santos
Contributorshttp://lattes.cnpq.br/1280123047954585, BALBINO, Valdir de Queiroz
PublisherUniversidade Federal de Pernambuco, Programa de Pos Graduacao em Genetica, UFPE, Brasil
Source SetsIBICT Brazilian ETDs
LanguagePortuguese
Detected LanguagePortuguese
Typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis
Sourcereponame:Repositório Institucional da UFPE, instname:Universidade Federal de Pernambuco, instacron:UFPE
RightsAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil, http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/, info:eu-repo/semantics/openAccess

Page generated in 0.1457 seconds