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Modelos multinomiais multivariados aplicados em sequências de DNA / Multivariate multinomial models applied do DNA sequences

Orientador: Hildete Prisco Pinheiro / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matemática, Estatística e Computação Científica / Made available in DSpace on 2018-08-17T18:30:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2011 / Resumo: Modelos Multivariados são propostos para descrever a frequência de códons em sequências de DNA, bem como a ordem e frequência em que as bases nitrogenadas se apresentam em cada códon, considerando a dependência entre as bases dentro do códon. Modelos logísticos regressivos são utilizados com diferentes estruturas de dependência entre as posições do códon. Também, modelos baseados em uma extensão da representação de Bahadur para o caso multinomial são propostos para explicar dados multinomiais correlacionados. Uma aplicação desses modelos para o gene NADH4 do genoma mitocondrial humano é apresentada, e comparações desses modelos são feitas a partir de diferentes critérios como AIC, BIC e validação cruzada. Por fim, uma breve análise de diagnósticos é realizada para os modelos logísticos regressivo / Abstract: Multivariate models are proposed to describe the codons frequencies in DNA sequences, as well as the order and frequency that nucleotide bases have in each codon, considering the dependence among the bases inside a codon. Logistic regressive models are used with different structures of dependence among the three positions in a codon. Also, models based on a multinomial extension of the Bahadur's representation are proposed to explain correlated multinomial data. An application of these models to the NADH4 gene from human mitochondrial genome is presented, and model comparisons among them are done by different criteria such as AIC, BIC and cross validation. At last, a brief diagnostic analysis is done upon the logistic regressive models / Mestrado / Estatistica / Mestre em Estatística

Identiferoai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.unicamp.br:REPOSIP/307182
Date17 August 2018
CreatorsCuyabano, Beatriz Castro Dias
ContributorsUNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS, Pinheiro, Hildete Prisco, 1966-, Lachos Dávila, Víctor Hugo, Nobre, Juvêncio Santos
Publisher[s.n.], Universidade Estadual de Campinas. Instituto de Matemática, Estatística e Computação Científica, Programa de Pós-Graduação em Estatística
Source SetsIBICT Brazilian ETDs
LanguagePortuguese
Detected LanguagePortuguese
Typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/masterThesis
Format108 p. : il., application/pdf
Sourcereponame:Repositório Institucional da Unicamp, instname:Universidade Estadual de Campinas, instacron:UNICAMP
Rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess

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