Return to search

Identificação de sequencias como iniciadores ("primers") especificos para a caracterização em cultura dos sorotipos A e B de Cryptococcus neoformans pela reação em cadeia da polimerase (PCR)

Orientador: Marcelo de Carvalho Ramos / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-07-26T14:19:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1
Aoki_FranciscoHideo_D.pdf: 3906599 bytes, checksum: 6e221a82a1ec683a22642639f401776d (MD5)
Previous issue date: 2000 / Resumo: A Criptococose, doença cosmopolita, causada pelo Cryptococcus neoformans, é conhecida há cerca de um século. A imunossupressão que decorre, tanto de tratamentos com esteróides e outros tipos de drogas, quanto de doenças degenerativas e infecciosas, facilita a multiplicação e o desenvolvimento desse agente tornando a doença importante, particularmente, nesses casos. o aparecimento da Síndrome da Imunodeficiência Adquirida (AIOS) ao final da década de 70 fez proliferar a criptococose, já que um dos efeitos daquela síndrome é '0 comprometimento acentuado das defesas dos pacientes. Neste trabalho foram estudadas trinta e três cepas de Cryptococcus neoforrnans isoladas de vinte e quatro pacientes atendidos no Hospital das Clínicas da Universidade Estadual de Campinas. Esses isolamentos foram obtidos de líquor, sangue e biópsia de pele. As trinta e três cepas de Cryptococcus neoformans foram inicialmente sorotipadas, utilizando-se o "kit" comercial "Cryptocheck" (Iatron, Japan). Vinte e quatro dessas cepas, provenientes de dezenove pacientes portadores de Aids foram caracterizadas como do sorotipo A. Das nove cepas recuperadas de pacientes sem Aids, sete revelaram-se como sendo do sorotipo A e duas do sorotipo B. Cepas de C. n eoformans sorotipos A e B foram testadas pelo método da Reação em Cadeia da Polimerase (PC R) com iniciadores comerciais aleatórios denominados R 1, R2 e R3 para determinação do seu perfil genômico (RAPD). A partir desse perfil, foi selecionada uma banda de 695 pares de bases (pb) presente apenas no perfis do sorotipo A e uma de 448 pb do sorotipo B. Esses "amplicons" foram sequenciados e, a seguir, desenvolvidos dois pares de iniciadores a serem testados para caracterização dos sorotipos A e B. Esses dois pares de iniciadores foram testados nas 33 amostras de C. neoformans previamente determinadas como sorotipos A ou B pela técnica de aglutinação. No caso do sorotipo A, de todas as amostras de referência testadas, bem como as isoladas de casos clínicos foi amplificada a sequência típica desse sorotipo (banda de 695 pb). Do mesmo modo, no sorotipo B a banda de 448 pb pode ser amplificada. A amplificação dessas seqüências especificas, utilizando os iniciadores estudados para amb'es os sorotipos foi sensível e específica, quando comparados com o teste de aglutinação. Para o estudo da Concentração Inibitória Mínima (CIM) as 33 cepas de C. neoformans foram testadas contra a Anfotericina B, o Itraconazol, o Fluconazol, a 5 - Fluorocitosina e a Anfotericina B comercial (Fungison@), de acordo com as normas do "National Commitee for Clinical and Laboratorial Standards" (NCCLS). As Concentrações Inibitórias Mínimas das várias drogas estudadas empregando-se o meio de RPM I 1640 para trinta e três cepas de C. neoformans foram: Anfotericina B: 0,25 a 2 J.lg/ml, Fungison: 0,03- 2J.lg/ml, FCZ: 0,5-32J.lg/ml; Itraconazol: 0,06-2 e 5-Fluorocitosina: 1-16 J.lg/ml. Os resultados deste estudo trouxeram uma nova abordagem para a caracterização dos sorotipos A e B de C. neoformans com base na técnica da Reação em Cadeia de Polimerase (PCR), para o conhecimento dos padrões de sensibilidade de cepas colhidas entre nós aos principais agentes antifúngicos e, ainda, para a preocupante presença de cepas dose dependentes ao Fluconazol em pacientes com e sem infecção pelo Vírus da Imunodeficiência Humana (HIV) / Abstract: 1. The cryptococcosis, a cosmopolitan disease, caused by Cryptococcus neoformans , a fungus, has been known about one century. The immunossupression that occurs by the consequence with steroids treatments and other kinds of drugs, degeneratives and infectious diseases, facilitates the proliferation and the development of these infectious agents, that permit to this disease be transformed itself in an important disease, particularly, on these cases. 2. The appearance of AIOS at the 70's end has facilitated the proliferation of cryptococcosis, since one of the effects of this syndrome is the great immunocompromise of the patients immunological defenses. 3. In this work 33 strains of Cryptococcus neoformans were isolated from 24 patients treated at the Hospital of Clinics from The State University of Campinas - State of São Paulo, Brazil. The isolation of these strains were obtained from skin, blood and specially from Central Nervous System Fluid(CNSF). 4. The 33 strains of Cryptococcus neoformans were, innitially, submitted to an identification by serotyping technique using the comercial kit named Cryptocheck(latron, Japan). Twenty four strains, from nineteen AIOS patients, were characterized like serotype A. Considering the rest of the samples, nine were from patients without AIDS, and from these nine, seven were characterized as serotype A and 2 as serotype B. 5. C. neoformans strains serotype A and B were tested by PCR method with ramdomized commercial primers denominated R 1, R2 and R3 to the determination of the genomic profile (RAPO). Using that profile, a exclusive 695 bp band were ~elected from the serotype A strains and other with 448 bp, beeing exclusive toe in the serotype B strains. These amplicons were sequenced and, after that, there was a developing of two primer pairs to be tested to the characterization of serotype A and B. 6. These two primer pairs were tested in the 33 strains of C. neoformans, previously determined like serotype A and B by the aglutination test. In the serotype A case, from ali reference strains tested, as well strains isolated from clinical cases, there was amplification of typical sequence of this serotype(695 bp band). Similarly, in the serotype B strains, a 448 bp band were amplified. The amplification of these specific sequencies, using primers studied for both serotypes was specific and sensitive, compared with the aglutination test. 7. For minimal inhibitory concentraion(MIC) study, 33 strains of C. neofonnans were tested with amphotericin B, Itraconazole, Fluconazole, 5- Fluorcytosin and commercial Amphotericin B(Fungison@), according the "National Comittee for Clinical and Laboratorial Standards"(NCCLS) proceedings. . 8. The MIC of the various studied drugs, using RPMI 1640 medium for 33 strains of C. neoformans were: Amphotericin B: 0,25 to 2 J,1g/ml; Fungison@: 0,03 to 2 J.1g/ml; Fluconazole:O,5 to 32 J.1g/ml; Itracon~zole: 0,06 to 2 J.1g/ml; 5 - Fluorcytosin: 1 to 16 J.1g/ml. 9. The results of this study showed a new approach to the characterization of C. neoformans serotype A and B based in the Protein Chain Reaction(PCR) technic, to the knowledge of C. neoformans strains sensibility collected from patients against antifungal agents and to the worried presence of strains SDD(Sensibility Dose Dependent) to the Fluconazol in patients with and without HIV infection / Doutorado / Clinica Medica / Doutor em Clínica Médica

Identiferoai:union.ndltd.org:IBICT/oai:repositorio.unicamp.br:REPOSIP/310663
Date01 March 2000
CreatorsAoki, Francisco Hideo, 1954-
ContributorsUNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS, Ramos, Marcelo de Carvalho, 1951-
Publisher[s.n.], Universidade Estadual de Campinas. Faculdade de Ciências Médicas, Programa de Pós-Graduação em Clínica Médica
Source SetsIBICT Brazilian ETDs
LanguagePortuguese
Detected LanguagePortuguese
Typeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion, info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
Format106p. : il., application/pdf
Sourcereponame:Repositório Institucional da Unicamp, instname:Universidade Estadual de Campinas, instacron:UNICAMP
Rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess

Page generated in 0.0028 seconds